Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,047,705 | C→T | 5.8% | A71V (GCC→GTC) | quiA → | quinate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,047,705 | 0 | C | T | 5.8% | 238.3 / 2.7 | 79 | A71V (GCC→GTC) | quiA | quinate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/35); new base T (2/3); total (41/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
CATCGCCCTGCTCGGCCTCCTCCTCGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGGCGCCAGCG > NC_002947/4047556‑4047854 | catcGCCCTGCTCGGCCTCCTCCTCGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTATGGTCTGATCGGGGGCGTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGc > 1:529648/1‑150 (MQ=255) atcGCCCTGCTCGGCCTCCTCCTCGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGcc > 1:187712/1‑150 (MQ=255) tcGCCCTGCTCGGCCTCCTCCTCGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCGCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCg > 1:260450/1‑150 (MQ=255) cGCACTGCTCGTCCTCCTCCTCGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCTCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTGCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCgt < 2:260450/150‑1 (MQ=255) cccTGCTCGGCCTCCTCCTCGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCgtgt > 2:1160237/1‑150 (MQ=255) ccTGCTCGGCCTCCTCCTCGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGtt > 1:1402865/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCTCCTCCTCGCTGCCGCGGGCCTCACACGGGCCGCGCGTGGCTGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTg < 2:178091/150‑1 (MQ=255) cGGCCTCCTCCTCGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGt < 1:733264/150‑1 (MQ=255) ggCCTCCTCCTCGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCTGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAAGCGGTCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTc > 2:1565/1‑150 (MQ=255) ggCCTCCTCCTCGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTACTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTAGTc > 2:668743/1‑150 (MQ=255) ctcctcctcGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGt > 2:1284450/1‑150 (MQ=255) tcctcctcGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCgg < 2:1453893/148‑1 (MQ=255) tcctcctcGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCgg > 1:1453893/1‑148 (MQ=255) cctcGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGc > 2:1468259/1‑150 (MQ=255) tcGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCa > 1:1444287/1‑150 (MQ=255) gCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATc > 2:1032049/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGTCGTGTTCCTGGTc < 1:1067554/136‑1 (MQ=255) tGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGTCGTGTTCCTGGTc < 1:1067386/136‑1 (MQ=255) tGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGTCGTGTTCCTGGTc > 2:1067554/1‑136 (MQ=255) tGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGTCGTGTTCCTGGTc > 2:1067386/1‑136 (MQ=255) tGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTg < 1:206431/133‑1 (MQ=255) tGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTg > 2:206431/1‑133 (MQ=255) gCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCGTCTgg < 1:1183045/150‑1 (MQ=255) cggcggCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGc < 2:529648/150‑1 (MQ=255) cTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTCCTCGCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCg > 1:43260/1‑150 (MQ=255) gTCTGGGCGGTTCCTGGGACTGCCTGTTCGGCGGCTTGGCAATGGCCACCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCACGAAGGCGGGCACCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCACCTGGCCTCTCATCGATGCGGGCCTgg < 2:559393/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGgtg < 1:1284450/150‑1 (MQ=255) tGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGAGTCCTCATTGCTCGCCGAAATTATGTGGGCGCCTGGATGTATGCCGTGTTCGTTGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGgtgt > 1:366609/1‑150 (MQ=255) gggCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGtt > 1:544877/1‑150 (MQ=255) gggCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGAGGGCGCATGGCTGTATATCGAGGAGCTGCTCGTTACTGGTATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGtt < 1:446103/150‑1 (MQ=255) gCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCt < 1:461346/150‑1 (MQ=255) cGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTg < 1:1032049/150‑1 (MQ=255) ttCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGcc > 1:863996/1‑150 (MQ=255) tACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTtc < 2:400793/150‑1 (MQ=255) ttCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTAATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTcg > 1:135461/1‑150 (MQ=255) tCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTcgc > 1:1393534/1‑150 (MQ=255) ccTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTcgcg > 1:296241/1‑150 (MQ=255) cTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACt < 1:566421/110‑1 (MQ=255) cTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACt > 2:566421/1‑110 (MQ=255) tCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGt > 1:479984/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGt > 1:678408/1‑150 (MQ=255) cggcTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCAt < 1:775664/150‑1 (MQ=255) gccatggccatCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATACCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGgc > 1:198689/1‑150 (MQ=255) ccatggccatCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGgcg > 2:556182/1‑150 (MQ=255) tggccatCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTccgctcca < 2:366609/150‑8 (MQ=255) ggccatCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCg > 1:391737/1‑71 (MQ=255) ggccatCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCg < 2:391737/71‑1 (MQ=255) atCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGTAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGc > 2:688444/1‑150 (MQ=255) tCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCa < 2:678408/150‑1 (MQ=255) tgtCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTc < 2:845453/124‑1 (MQ=255) tgtCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTc > 1:845453/1‑124 (MQ=255) gtCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTg > 2:604708/1‑150 (MQ=255) ccTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGgc < 1:1160237/150‑1 (MQ=255) cTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTg < 1:1321570/61‑1 (MQ=255) cTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTg > 2:1321570/1‑61 (MQ=255) cTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCACCTGGGCACTGATCGATGCGAGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGgcg > 2:550676/1‑150 (MQ=255) aTTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCCGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTg < 1:289254/150‑1 (MQ=255) ttGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTgg < 2:863996/150‑1 (MQ=255) tCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGc > 2:1057464/1‑92 (MQ=255) tCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGc < 1:1057464/92‑1 (MQ=255) tCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTa > 1:1131195/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTa > 1:1037285/1‑150 (MQ=255) agaagGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGC > 1:62754‑M1/1‑150 (MQ=255) aagGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTG < 1:604708‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgggcgCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTAATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCG < 2:135461‑M1/150‑1 (MQ=255) cgggcgCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGC < 2:479984‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTg < 2:1402865/150‑1 (MQ=255) gcCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGc > 1:194288/1‑73 (MQ=255) gcCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGc < 2:194288/73‑1 (MQ=255) cTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCaa > 2:742736/1‑150 (MQ=255) ggCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACg > 1:185459/1‑150 (MQ=255) ggCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACg < 2:187712/150‑1 (MQ=255) gCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTAGAGCCTGTTCATGTACGACGGAAGCTGGGTGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGg < 2:387583‑M2/150‑2 (MQ=255) cTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGgc > 2:1077712‑M2/1‑148 (MQ=255) tGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCAATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGgcg < 1:1563639‑M2/150‑4 (MQ=255) gTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGTGCCGGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCCGTTGGCACGCGCCagcagcgg < 2:43260/150‑8 (MQ=255) 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ccGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCcgttggcacgcgccagca > 2:69953‑M1/1‑132 (MQ=255) | CATCGCCCTGCTCGGCCTCCTCCTCGCTGCCGGCGGCGTCAAGCTCGCCGGTCTGGGCGGTTCCTGGTACTTCCTGATCGGCGGCTTGGCCATGGCCATCGCCGGTGTCCTCATTGCTCGCCGCAAGAAGGCGGGCGCCTGGCTGTATGCCGTGTTCCTGGTCGGTACTGCCATCTGGGCACTGATCGATGCGGGCCTGGTGTTCTGGCCGCTGTTCTCGCGCCTGTTCATGTTCGGCGCAATCGGCATGGTCGTGGCGCTGGTCTACCCGCTGCTGGCGCGTGCCAACGGCGCCAGCG > NC_002947/4047556‑4047854 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |