| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,468,253 | G→A | 6.1% | G152S (GGC→AGC) | PP_3959 → | voltage‑gated chloride channel family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,468,253 | 0 | G | A | 6.1% | 183.8 / 2.7 | 65 | G152S (GGC→AGC) | PP_3959 | voltage‑gated chloride channel family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/31); new base A (2/2); total (32/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.83e-01 | |||||||||||
GGCTGCGCGCCCGATTACTCTCGCTCCCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTG > NC_002947/4468104‑4468399 | ggCTGCGCGCCCGATTACTCTCGCTCTCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAg < 2:212984/150‑1 (MQ=255)ggCTGCGCGCCCGATTACTCTCGCTCCCTGTGGCTGCACAACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAg < 1:15153/150‑1 (MQ=255) cTGCGCGCCCGATTACTCTCGCTCCCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGc < 1:1283284/150‑1 (MQ=255) cgcCCGATTACTCTCGCTCCCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCa < 2:230312/150‑1 (MQ=255) gcCCGATTACTCTCGCTCCCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCAc > 2:1106244/1‑150 (MQ=255) ccGATTACTCTCGCTCCCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCAcgg > 1:1466535/1‑150 (MQ=255) ccGATTACTCTCGCTCCCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCAGGGAAGGCCCGACCGTCCACATAGACGCCGCAGTTCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCAcgg < 1:693422/150‑1 (MQ=255) tcGCTCCCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCAcggc < 2:1160131/141‑1 (MQ=255) tcGCTCCCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCAcggc > 1:1160131/1‑141 (MQ=255) cTCCCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCNTGACGCTGGGCGNCCTGCTNGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATc > 1:1445697/1‑150 (MQ=255) cTCCCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATc < 2:722072/150‑1 (MQ=255) cTCCCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATc > 2:1166437/1‑150 (MQ=255) tCCCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTTGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCg < 1:1106244/150‑1 (MQ=255) cTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTg > 2:773980/1‑150 (MQ=255) cTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTg < 1:1055249/150‑1 (MQ=255) tGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTGGGCGGTTGGGTTGGTCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGt < 1:489722/150‑1 (MQ=255) agcaCGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGcc > 1:623778/1‑143 (MQ=255) agcaCGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGcc < 2:623778/143‑1 (MQ=255) gCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCg > 2:929235/1‑150 (MQ=255) aTGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCg < 1:458296/148‑1 (MQ=255) aTGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCg > 2:458296/1‑148 (MQ=255) aTGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGa > 2:708183/1‑150 (MQ=255) tGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAg < 2:1465498/150‑1 (MQ=255) tGAGCCGGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAg < 2:252690/150‑1 (MQ=255) gAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAgg < 2:1466535/150‑1 (MQ=255) gCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGgcg > 1:1228982/1‑150 (MQ=255) gACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATc < 2:1632990/121‑1 (MQ=255) gACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATc > 1:1632990/1‑121 (MQ=255) gACGCTGGGCGCCCTGCTCGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGc < 2:1288948/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAg > 2:189261/1‑94 (MQ=255) cTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAg < 1:189261/94‑1 (MQ=255) tGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAg < 1:639140/93‑1 (MQ=255) tGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAg > 2:639140/1‑93 (MQ=255) cgcCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGCCGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTCGCCTGGTGCTACCCGGAGGCGCTGCGGGTACTGc < 2:1296310/150‑1 (MQ=255) gcCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCg < 2:1228982/150‑1 (MQ=255) cggcggTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCaa < 1:708183/150‑1 (MQ=255) ggcggTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGc > 1:1025039/1‑78 (MQ=255) ggcggTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGc < 2:1025039/78‑1 (MQ=255) gcggTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATa > 1:970456/1‑150 (MQ=255) ttcggttGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACAcc > 1:397894/1‑150 (MQ=255) cGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCgggg > 1:1176414/1‑150 (MQ=255) cGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCgggg > 1:119103/1‑150 (MQ=255) gggAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCggggg > 1:558139/1‑150 (MQ=255) gAAGGCCGGACCGTCCACATCGGCGCCGCCGTGCTCTATTCCTTTGGCGGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCACTACACCGTTAGCGGGGGtc > 1:886298/1‑149 (MQ=255) ggCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTc > 2:331827/1‑150 (MQ=255) gCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCt > 1:382449/1‑150 (MQ=255) ccGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCttt > 1:481135/1‑150 (MQ=255) gACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGc > 1:816892/1‑150 (MQ=255) tCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTg > 1:700469/1‑150 (MQ=255) caTCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATacac > 1:1236966/1‑119 (MQ=255) caTCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATacac < 2:1236966/119‑1 (MQ=255) caTCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGa < 2:700469/150‑1 (MQ=255) aTCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGAGCGGCAGCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGaa > 2:1457045/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAAt > 2:392937/1‑150 (MQ=255) gccgcAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGc < 2:1433034/150‑1 (MQ=255) gccgcAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAAGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGa < 2:491659/140‑1 (MQ=255) gccgcAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAAGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGa < 2:491789/140‑1 (MQ=255) gccgcAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAAGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGa > 1:491789/1‑140 (MQ=255) gccgcAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAAGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGa > 1:491659/1‑140 (MQ=255) tGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGt > 2:72530/1‑150 (MQ=255) ctctATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTc < 2:397894/150‑1 (MQ=255) ctctATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTc < 1:1166437/150‑1 (MQ=255) ccTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAAc < 1:392937/150‑1 (MQ=255) ccTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAAc < 2:66161/150‑1 (MQ=255) gCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCa < 1:929235/150‑1 (MQ=255) cGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGt < 2:827325/150‑1 (MQ=255) aCGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGa < 2:104943/114‑1 (MQ=255) aCGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGa > 1:104943/1‑114 (MQ=255) cGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGc < 1:72530/150‑1 (MQ=255) gTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAACCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCt > 1:745601/1‑150 (MQ=255) ttAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTg < 2:1445697/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGa > 2:624456/1‑128 (MQ=255) ggCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGa < 1:624456/128‑1 (MQ=255) | GGCTGCGCGCCCGATTACTCTCGCTCCCTGTGGCTGCAGCACGCATGAGCCTGACGCTGGGCGCCCTGCTGGTCGGCGGTTCGGTTGGCCGGGAAGGCCCGACCGTCCACATCGGCGCCGCAGTGCTCTATTCCTTTGGCCGACGTTTAGGCCTGCACGGCCGGCGCACCATCGCTGGCCTGGTGCTAGCCGGAGGCGCTGCGGGTATTGCGGCAGCCTTCAATACACCGTTAGCGGGGGTAGTCTTTGCCATTGAGGAATTGAGCCGCACGTTCGAGCAACGTTTCAGTGGCTTG > NC_002947/4468104‑4468399 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |