| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,821,377 | C→G | 5.0% | W3286C (TGG→TGC) | pvdL ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,821,377 | 0 | C | G | 5.0% | 311.1 / 5.1 | 96 | W3286C (TGG→TGC) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (43/48); new base G (3/2); total (46/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 | |||||||||||
CGCTGCTCCTGGGCATCGTCGGCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCTGCATCGGCGTCAGCGGGTAAACGTCCTCGATCTGCGC > NC_002947/4821228‑4821526 | cgcTGCTCCTGGGCATCGTCGGCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGc < 1:380383/150‑1 (MQ=255) ctgctCCTGGGCATCGTCGGCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCa < 2:6397/150‑1 (MQ=255) tgctCCTGGGCATCGTCGGCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAg > 1:1614944/1‑150 (MQ=255) gctCCTGGGCATCGTCGGCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGACAGGTTGCCCGGCCTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAAAGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAgg > 2:138917/1‑150 (MQ=255) cTGGGCATCGTCGGCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTg > 1:635886/1‑150 (MQ=255) cTGGGCATCGTCGGCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTg < 2:877304/150‑1 (MQ=255) gggCATCGTCGGCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTggg < 2:635886/150‑1 (MQ=255) cATCGTCGGCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGa > 2:97301/1‑150 (MQ=255) aTCGTCGGCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGaa > 1:1563650/1‑150 (MQ=255) tcgGCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGc > 2:625715/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTgg < 1:616059/138‑1 (MQ=255) gCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTgg > 2:616059/1‑138 (MQ=255) gCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTc > 2:1008237/1‑150 (MQ=255) cgcgCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGa < 1:1522715/150‑1 (MQ=255) agcgcCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGa < 1:350199/149‑1 (MQ=255) aGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGGACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCNGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAgcgcgc > 2:1287881/1‑150 (MQ=255) tGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTg > 2:1015338/1‑150 (MQ=255) gTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGAt < 1:6909/150‑1 (MQ=255) tAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATg < 1:319622/150‑1 (MQ=255) cACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTc > 1:883881/1‑129 (MQ=255) cACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTc < 2:883881/129‑1 (MQ=255) cACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGAggca > 1:492537/1‑148 (MQ=255) cACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTAGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTa > 1:1460408/1‑150 (MQ=255) aCCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGGCAGGccgt > 1:170261/1‑108 (MQ=255) aCCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGGCAGGccgt < 2:170261/110‑3 (MQ=255) aCCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAAc > 1:965063/1‑118 (MQ=255) aCCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAg > 1:1205407/1‑150 (MQ=255) aCCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCGGCCAGGCCTGGGCGAAAc < 2:965063/118‑1 (MQ=255) ccGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGc < 2:941270/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGc < 2:467204/150‑1 (MQ=255) cGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTg < 1:228112/136‑1 (MQ=255) cGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAACTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTg > 2:228112/1‑136 (MQ=255) ccAGGTTGCCCTGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGt > 1:208205/1‑150 (MQ=255) gCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCAt > 2:149382/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGa > 2:265022/1‑117 (MQ=255) ccGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGa < 1:265022/117‑1 (MQ=255) ccGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATgt > 2:592141/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATgt > 2:1337922/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCA‑CACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATgta > 1:1267702/1‑150 (MQ=255) cGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAANCGCNCGNGGTCGAGCGCGCNGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATgta < 1:1287881/150‑1 (MQ=255) cGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATgta < 2:1563650/150‑1 (MQ=255) ttGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTAc > 2:647964/1‑150 (MQ=255) tgtgGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACa < 2:1205407/150‑1 (MQ=255) gatgatCTGCAGCATCGCCTCGCGGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCACGGGCTGGGTGAAGCAAATCTCGCCGGGCGCCCTGTTAATGCCGTAACTGTCCTGCATGTAGTACAGGcc > 2:1177645/1‑150 (MQ=255) atgatCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCa > 1:1626194/1‑150 (MQ=255) tgatCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAg > 1:1267875/1‑150 (MQ=255) gcagcaTCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGc > 2:547859/1‑82 (MQ=255) gcagcaTCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGc < 1:547859/82‑1 (MQ=255) gcagcaTCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCg > 2:1132485/1‑150 (MQ=255) gcagcaTCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCg > 1:339442/1‑150 (MQ=255) gcagcaTCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCA‑GGCCTGGCAGGccgtgg < 1:133237/80‑5 (MQ=255) gcagcaTCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCA‑GGCCTGGCAGGccgtgg > 2:133237/1‑76 (MQ=255) cagcaTCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCgg < 1:1015338/150‑1 (MQ=255) gcctcgccGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCcagc < 1:1222375/150‑1 (MQ=255) cctcgccGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAgc > 1:25169/1‑92 (MQ=255) cctcgccGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAgc < 2:25169/92‑1 (MQ=255) ctcgccGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTc < 2:787659/87‑1 (MQ=255) ctcgccGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTc > 1:787659/1‑87 (MQ=255) tcgccGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAgg < 1:647964/150‑1 (MQ=255) gcgccgcTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAgg < 1:104653/149‑1 (MQ=255) 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aCGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCAACCACGGCCACGAACAACTAACCGCCATGCATGTGGCGGATCGTGTTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAATACAGGCCAGTGACGGGCTACAGCAGGGTGTACAGCAGAATGCCtt > 1:29640/1‑150 (MQ=255) gAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGACTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTcc < 2:420129/150‑1 (MQ=255) aGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCt < 2:339442/150‑1 (MQ=255) aGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCt < 2:1307004/150‑1 (MQ=255) aGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCt < 2:1270830/150‑1 (MQ=255) gcgcgcAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTACAGCAGCATGCCTTcc > 2:1284295/1‑147 (MQ=255) gcgcgcAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTACAGCAGCATGCCTTcc < 1:1284295/147‑1 (MQ=255) cgcgcAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCTAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTATTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCTGCa < 1:582871/150‑1 (MQ=255) gcgcAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCca > 1:546011/1‑119 (MQ=255) gcgcAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCca < 2:546011/119‑1 (MQ=255) gcgcAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCTGCAt > 2:1377404/1‑150 (MQ=255) aaCGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCTGCATCGGc < 2:1267875/150‑1 (MQ=255) tCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCTGCATCGGCGTCAGc < 1:1008237/150‑1 (MQ=255) gTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCTGCATCGGCGTCAGCgg < 2:1460408/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCTGCATCGGCGTCAGCGGGt < 1:1609808/150‑1 (MQ=255) cgcCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCTGCATCGGCGTCAGCGGGTAAAc < 1:1377404/150‑1 (MQ=255) caccacGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCTGCATCGGCGTCAGCGGGTAAACGTc < 1:374745/150‑1 (MQ=255) caccacGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCTGCATCGGCGTCAGCGGGTAAACGTc > 1:1099198/1‑150 (MQ=255) cacGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCTGCATCGGCGTCAGCGGGTAAACGTCCTc < 2:1626194/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCTGCATCGGCGTCAGCGGGTAAACGTCCTCGATCTgcgc > 2:1260474/1‑150 (MQ=255) | CGCTGCTCCTGGGCATCGTCGGCCAGGCCGCGCCAGTCCTGGTAGTCCACCGCCAGGTTGCCCGGCTTGTGGATGATCTGCAGCATCGCCTCGCCGCTGTTCCAGCTGAACGAGGCGCGCAACGCTTCGTGGCGCGCCACCACGGCCTGCCAGGCCTGGGCGAAACGCTCGGGGTCGAGCGCGCTGTTGATGCGGTAGCGGTCCTGCATGTAGTACAGGCCAGTGCCCGGCTCCAGCAGGGTGTGCAGCAGCATGCCTTCCTGCATCGGCGTCAGCGGGTAAACGTCCTCGATCTGCGC > NC_002947/4821228‑4821526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |