Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,821,852 | C→A | 5.1% | G3128V (GGC→GTC) | pvdL ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,821,852 | 0 | C | A | 5.1% | 248.4 / 3.0 | 78 | G3128V (GGC→GTC) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/33); new base A (2/2); total (43/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.74e-01 |
AGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCTTGATGCGCTTGATCGAACCGGCC > NC_002947/4821709‑4822001 | aGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCTCGATTTGGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGt > 1:100014/1‑150 (MQ=255) gCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAgg > 2:1303922/1‑150 (MQ=255) agagCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTg > 2:1427725/1‑150 (MQ=255) agagCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTg > 1:168406/1‑150 (MQ=255) gagCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGa > 2:301760/1‑150 (MQ=255) cGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATgcgcg > 1:459362/1‑150 (MQ=255) aTACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTg > 1:1150665/1‑150 (MQ=255) tACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGc < 1:969816/150‑1 (MQ=255) cTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGCACTGGCCCAGGTAGTTGAAgg > 1:1320394/1‑131 (MQ=255) cTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAgg < 2:1320394/131‑1 (MQ=255) tCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCt > 2:448798/1‑150 (MQ=255) tCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCt < 2:1248410/150‑1 (MQ=255) aCCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTcgc > 1:914898/1‑150 (MQ=255) ccAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGgc < 2:825888/135‑1 (MQ=255) ccAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGgc > 1:825888/1‑135 (MQ=255) ttGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGTGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGATAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCTGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCcg < 1:1025230/150‑1 (MQ=255) gggCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATc > 2:628023/1‑136 (MQ=255) gggCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATc > 2:628002/1‑136 (MQ=255) gggCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATc < 1:628023/136‑1 (MQ=255) gggCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATc < 1:628002/136‑1 (MQ=255) aaCGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCa < 2:459362/150‑1 (MQ=255) ggCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATcc > 2:732273/1‑150 (MQ=255) ggCCCATCGAGTTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCAAGAGGCCTGAACAAGTGCGCACTGTCGAACTGCTGATCTAACTTGCCCAGTTAGTTGAAGGGTATGCGCGCCTGCGGCAATACCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATcc < 1:108875/150‑1 (MQ=255) gcATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGcc > 2:1485917/1‑150 (MQ=255) gAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTa > 2:534397/1‑150 (MQ=255) aTGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGt < 2:872187/77‑1 (MQ=255) aTGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGt > 1:872187/1‑77 (MQ=255) aTGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCa > 1:695857/1‑140 (MQ=255) aTGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCa < 2:695857/140‑1 (MQ=255) gcCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACg > 2:382716/1‑150 (MQ=255) cAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGcc > 2:53905/1‑150 (MQ=255) cccGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTa > 1:1285542/1‑150 (MQ=255) cccGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTa < 1:448798/150‑1 (MQ=255) ccGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAGCTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAg > 2:1647735/1‑150 (MQ=255) ccGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAg > 2:1393333/1‑150 (MQ=255) cGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGc < 1:1119820/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGcc < 1:597364/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGccc > 1:916712/1‑150 (MQ=255) aGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGc < 1:53905/150‑1 (MQ=255) cTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCtt < 1:534397/150‑1 (MQ=255) tCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTtg > 1:769746/1‑150 (MQ=255) ccAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTtgt < 2:1285542/150‑1 (MQ=255) ccAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTtgt < 2:914898/150‑1 (MQ=255) tGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACa > 1:1586983/1‑150 (MQ=255) gAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAg > 2:660203/1‑127 (MQ=255) gAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAg < 1:660203/127‑1 (MQ=255) aaCAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATgg < 1:301760/150‑1 (MQ=255) aCAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAg < 1:1469056/115‑1 (MQ=255) aCAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAg > 2:1469056/1‑115 (MQ=255) gCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGCTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCGgt > 2:347991/1‑150 (MQ=255) ccGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAgtt < 2:916712/150‑1 (MQ=255) gTCGAACTGCTGGGCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCtt < 2:258942/150‑1 (MQ=255) gAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCa > 2:6670/1‑137 (MQ=255) gAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCa < 1:6670/137‑1 (MQ=255) gAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCTTGAt > 1:1001118/1‑150 (MQ=255) aaCTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGgccgc < 2:523640/59‑1 (MQ=255) aaCTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGgccgc > 1:523640/1‑59 (MQ=255) tgctgGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTa < 2:882471/104‑1 (MQ=255) tgctgGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTa > 1:882471/1‑104 (MQ=255) ctgGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCTTGATGCGCtt > 1:1013532/1‑150 (MQ=255) ctgGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAATACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCTTGATGCGCtt > 1:575222/1‑150 (MQ=255) ggTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCTGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCTTGATGCGCTTGa < 2:1586983/150‑1 (MQ=255) ggTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCTTGATGCGCTTGa > 2:278762/1‑150 (MQ=255) ggTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCTTGATGCGCTTGa < 2:1150665/150‑1 (MQ=255) gTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGTAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCTTGATGCGCTTGAt > 2:1053572/1‑150 (MQ=255) tCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTcc < 2:1595403/135‑1 (MQ=255) tCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTcc > 1:1595403/1‑135 (MQ=255) gAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCt < 2:118805/53‑1 (MQ=255) gAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCt > 1:118805/1‑53 (MQ=255) atcTGGACCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGcc > 2:243514/3‑75 (MQ=255) atcTGGACCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGcc < 1:243535/73‑1 (MQ=255) atcTGGACCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGcc < 1:243514/73‑1 (MQ=255) atcTGGACCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGcc > 2:243535/3‑75 (MQ=255) aaCTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCTTGATGCGCTTGATCGaa < 2:1001118/150‑1 (MQ=255) aCTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCTTGATGCGCTTGATCGAAc > 1:145001/1‑150 (MQ=255) tGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCa > 2:449695/1‑73 (MQ=255) tGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCa < 1:449695/73‑1 (MQ=255) ggCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCTTGATGCGCTTGATCGAACCgg < 1:382716/150‑1 (MQ=255) cccAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCTTGATGCGCTTGATCGAACCGGcc > 1:847419/1‑150 (MQ=255) | AGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAGGTGATGCGCGCCTGCGGCAAGGCCGCCATCTGCTCGCGCCCGGCGGCATCCGCCAGGTAGCGCAGTACGCCGTAGCCCAGGCCCTTGTGCGGTACATGGCGCAGTTGTTCCTTGATGCGCTTGATCGAACCGGCC > NC_002947/4821709‑4822001 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |