| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,902,717 | T→C | 6.8% | V196A (GTG→GCG) ‡ | PP_4310 → | hydantoin racemase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,902,717 | 0 | T | C | 6.8% | 252.3 / 5.0 | 85 | V196A (GTG→GCG) ‡ | PP_4310 | hydantoin racemase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/49); new base C (2/4); total (32/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCTGGAACTGGAAGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTGGCCGATGCGCTTCGGCCGCTA > NC_002947/4902568‑4902858 | gttggaactggaaGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGt < 1:537995/148‑1 (MQ=255) aactggaaGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCgg < 2:1427443/150‑1 (MQ=255) ggaaGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCggtggt < 1:1181949/150‑1 (MQ=255) ggaaGCCGACCCGCTGCGGGCCGAGGCGGCGATTGGCGTGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCggtggt < 2:266599/150‑1 (MQ=255) gaaGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGgtggtg > 2:1043333/1‑150 (MQ=255) gCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGACCGGGGAGCCGGCTTCGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCACGCCggtgcgttgg < 2:42524/150‑7 (MQ=255) gCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGTTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGAt < 1:1563356/150‑1 (MQ=255) ccGCCCCGCTGATTGCCTTAGAGGCAATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGAC‑CGGCGTTTGAGCATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATg < 1:920148/150‑1 (MQ=255) gACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGgt > 1:212821/1‑150 (MQ=255) cccGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGTGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGgtgt < 1:26394/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCGGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGtgtg > 2:1478323/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCAAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATTGCCGGGCTGAACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGAt > 2:176134/1‑144 (MQ=255) ccGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCAAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGAACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGAt < 1:176134/144‑1 (MQ=255) cGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGa < 1:772509/150‑1 (MQ=255) cGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGa < 1:987752/150‑1 (MQ=255) tGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTTGGGCGGCATGGTCGTGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTg < 1:1018809/150‑1 (MQ=255) gggCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAg < 1:1203070/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGCGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCg < 1:519552/150‑1 (MQ=255) ccGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGT‑ATCGCCGTGGGTGGGGTGGATGGTGTGAGTCCAGCgg > 2:1089069/1‑150 (MQ=255) ccGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCgg < 2:212821/150‑1 (MQ=255) cGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACTGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGt < 1:639711/150‑1 (MQ=255) ggCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGGCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGTGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGAAGCGCA‑AATCGACAAATCGGCCGGCTGTCCGGTGGGGGATGGTGTGAGTGCAGCGGGGACCAt > 2:357964/1‑150 (MQ=255) gCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCAtt > 1:911982/1‑150 (MQ=255) gATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGc < 2:333774/135‑1 (MQ=255) gATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGc > 1:333774/1‑135 (MQ=255) gATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGc < 2:264119/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAAt > 1:1177693/1‑150 (MQ=255) aGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGc < 1:1314069/150‑1 (MQ=255) gCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCAGTACGGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCt < 1:516112/150‑1 (MQ=255) gCAGGACGAACGAGCCCTGCTCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCt < 2:911982/150‑1 (MQ=255) ggCCGAACGCGCCGTGCGCGCCGACAAGGCCGAGTTG‑ATCTGCCTGGGTTGGGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGATCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGt < 2:1250204/150‑1 (MQ=255) gCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGGCGCGGTG‑CTCTGCCTGCGCTGTGTCGCCATGTCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCCGTGACCATTGCCGAATCGCTtgtg < 2:1177693/150‑1 (MQ=255) gCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGc < 2:832684/100‑1 (MQ=255) gCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGc > 1:832684/1‑100 (MQ=255) cGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAg < 1:1054255/122‑1 (MQ=255) cGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAg > 2:1054255/1‑122 (MQ=255) gAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTgcgc > 2:653171/1‑150 (MQ=255) gcCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGt < 1:193623/150‑1 (MQ=255) gTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTg < 1:27105/150‑1 (MQ=255) tGCGCGACGGCAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGa < 2:562411/150‑1 (MQ=255) tGCGCGACGAAAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGa < 1:641455/150‑1 (MQ=255) cgacgaCAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCAc < 1:437189/150‑1 (MQ=255) gacAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTg < 2:252611/126‑1 (MQ=255) gacAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTg > 1:252611/1‑126 (MQ=255) acAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGATCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCa > 2:181205/1‑150 (MQ=255) acAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGa < 1:1631961/96‑1 (MQ=255) acAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGa > 2:1631961/1‑96 (MQ=255) caGGCCGCGGTG‑ACCTGCCTGGGTTGTGGCGGACTGGCAGGCCTGCACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGCGCCGGTGGTGGATGGTGTTCGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGCGCGCATGGGTTTGCGCACTTCCaaa < 2:52918/149‑1 (MQ=255) ggCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGt > 2:426675/1‑102 (MQ=255) ggCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGt < 1:426675/102‑1 (MQ=255) ggCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGGGGGGGGTGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTGCAAAGt > 1:922312/1‑150 (MQ=255) ccGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGATCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTgc < 1:181205/150‑1 (MQ=255) gAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTgcgc < 1:531479/150‑1 (MQ=255) aTCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCgg < 2:1499279/67‑1 (MQ=255) aTCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCgg > 1:1499279/1‑67 (MQ=255) aTCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCa < 2:447927/136‑1 (MQ=255) aTCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCa > 1:447927/1‑136 (MQ=255) aTCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTag > 2:1325787/1‑149 (MQ=255) aTCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTAt < 1:751515/150‑1 (MQ=255) cTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACg > 2:1283910/1‑150 (MQ=255) tGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGc > 2:778732/1‑150 (MQ=255) gTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTg > 2:67185/1‑75 (MQ=255) gTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTg < 1:67185/75‑1 (MQ=255) ttGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACg > 1:857513/1‑150 (MQ=255) ggcATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCgaag < 2:857513/150‑1 (MQ=255) gggCTGGACGAGCAGATTCGCCGACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAgtggtg < 2:922312/150‑1 (MQ=255) tGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCt < 1:357964/150‑1 (MQ=255) ggACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTg < 1:450906/150‑1 (MQ=255) gACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTgg > 2:30759/1‑150 (MQ=255) gCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATc < 1:520578/69‑1 (MQ=255) gCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATc > 2:520578/1‑69 (MQ=255) gCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGc > 1:306571/1‑119 (MQ=255) gCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGc < 2:306571/119‑1 (MQ=255) cAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTTATTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTGGCCGATg < 1:1089069/150‑1 (MQ=255) gATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCa > 2:616687/1‑77 (MQ=255) gATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCa < 1:616687/77‑1 (MQ=255) aTTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTGGCCGATgcgc < 1:653171/150‑1 (MQ=255) ccAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACggg < 2:767920/116‑1 (MQ=255) ccAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACggg > 1:767920/1‑116 (MQ=255) cacc‑ACCGGCACGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAgtg < 2:1090958/121‑1 (MQ=255) cacc‑ACCGGCACGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAgtg > 1:1090958/4‑124 (MQ=255) cacc‑ACCGGCACGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGATTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAgtg < 2:1090863/121‑1 (MQ=255) cacc‑ACCGGCACGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGATTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAgtg > 1:1090863/4‑124 (MQ=255) c‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTGGCCGATGCGCTTCGGCCGCTa < 2:873516/150‑1 (MQ=255) aCCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACggg < 1:212849/109‑1 (MQ=255) aCCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACggg > 2:212849/1‑109 (MQ=255) | GCTGGAACTGGAAGCCGACCCGCTGCGGGCCGTGGAGGCGATTGTCGAGCAGGCCGAACGCGCCGTGCGCGACGACAAGGCCGAGGTG‑ATCTGCCTGGGTTGTGGCGGCATGGCCGGGCTGGACGAGCAGATTCGCCAACGC‑ACCGGCGTGCCGGTGGTGGATGGTGTGAGTGCAGCGGTGACCATTGCCGAATCGCTGGTGCGCATGGGTTTGAGCACGTCCAAAGTGCGCACCTATGCGACGCCACGGGCGAAGAAAGTGGTGGGCTGGCCGATGCGCTTCGGCCGCTA > NC_002947/4902568‑4902858 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |