| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,363,111 | G→T | 5.6% | L235I (CTC→ATC) | glmM ← | phosphoglucosamine mutase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,363,111 | 0 | G | T | 5.6% | 223.0 / 2.3 | 71 | L235I (CTC→ATC) | glmM | phosphoglucosamine mutase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/32); new base T (2/2); total (37/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.85e-01 | |||||||||||
ATCAGCGTACCGACCACCCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCACCCAGCTCACGGAATACGCTGGGCGCAACCTT > NC_002947/5362963‑5363255 | atcaGCGTACCGACCACCCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGAGCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCgaga > 2:1364891/1‑150 (MQ=255) gCGTACCGACCACCCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCgg < 1:627345/150‑1 (MQ=255) gCGTACCGACCACCCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCgg > 1:1194702/1‑150 (MQ=255) cGTACCGACCACCCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGTGAATTCCGAGATCGGc < 2:808515/150‑1 (MQ=255) cGTACCGACCACCCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGc < 1:898917/150‑1 (MQ=255) tACCGACCACCCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCAt < 2:1416897/150‑1 (MQ=255) ccGACCACCCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGATCTCGGCAttg < 2:1243604/150‑3 (MQ=255) ccGACCACCCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGt > 2:651399/1‑150 (MQ=255) ccGACCACCCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGt > 2:1513307/1‑150 (MQ=255) gACCACCCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGATCTCGGCAttgcc < 1:373933/150‑5 (MQ=255) gACCACCCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTcc < 1:1513307/150‑1 (MQ=255) ccaccCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGa > 1:559889/1‑150 (MQ=255) ccaccCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGa < 1:1364891/150‑1 (MQ=255) ccccGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGAGGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCa > 1:1240158/1‑150 (MQ=255) cccGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCAt < 1:419091/140‑1 (MQ=255) cccGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCAt > 2:419091/1‑140 (MQ=255) cccGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAg > 1:1508801/1‑150 (MQ=255) ttGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGc > 1:626664/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGc > 2:644137/1‑150 (MQ=255) ttGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGc > 2:454994/1‑150 (MQ=255) aTGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGa > 2:659855/1‑150 (MQ=255) gTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGAtt > 2:1444860/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGGCCGGTTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGa < 2:1206676/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGAt < 1:77758/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGAtg > 2:1082571/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGAtgt < 1:436070/150‑1 (MQ=255) gCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGAtgt > 1:945988/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGAtgt < 2:559889/150‑1 (MQ=255) aGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGAtgtgt < 1:659855/150‑1 (MQ=255) tgatgaACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTTCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAAc > 1:669726/1‑150 (MQ=255) tgatgaACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAAc > 2:124956/1‑150 (MQ=255) tgatgaACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAAc > 2:1241575/1‑150 (MQ=255) tgaACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCtt > 1:1211245/1‑150 (MQ=255) gaACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTc > 2:701339/1‑150 (MQ=255) aCAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGt < 1:1444860/150‑1 (MQ=255) aCAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGAGGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGt < 2:1508801/150‑1 (MQ=255) aCAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGACCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGt < 2:1194702/150‑1 (MQ=255) cagcagCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGtt < 1:644137/150‑1 (MQ=255) cagcagCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGtt > 2:32832/1‑150 (MQ=255) gTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAg > 2:1496250/1‑150 (MQ=255) gTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAg < 1:124956/150‑1 (MQ=255) gTCACCGTCGACGATCGCGCTCGTGTGGTCGACCCTCAGAACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCTAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAg < 2:85046/150‑1 (MQ=255) tCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAgg < 2:945988/150‑1 (MQ=255) cACCGTCGACGATGGCTCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACATCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGc < 1:633434/150‑1 (MQ=255) gTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTc > 2:623040/1‑150 (MQ=255) tCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATNGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGGGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTAGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTAAGGCCGTcc > 1:1068789/1‑150 (MQ=255) tCGACGATGGCGCACGCCTGGTCGAGCATCGGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTcc > 2:145554/1‑150 (MQ=255) cgaCGGCGGCCGGGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCCTCAACGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGGTGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGtt < 2:669726/150‑1 (MQ=255) gaTGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGcc < 2:1130962/141‑1 (MQ=255) gaTGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGcc > 1:1130962/1‑141 (MQ=255) tGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTgcg > 2:156136/1‑150 (MQ=255) gcCCGTGGGGTCGACCAGCAGCCCGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATg < 2:71589/150‑1 (MQ=255) tgGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCTGTGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTTTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACg < 2:1135060/150‑1 (MQ=255) tgGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCgg < 2:1127499/134‑1 (MQ=255) tgGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCgg > 1:1127499/1‑134 (MQ=255) gTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGt < 1:623040/150‑1 (MQ=255) tCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTc > 1:10056/1‑150 (MQ=255) tCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTc > 1:10299/1‑150 (MQ=255) ccATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGt > 2:151495/1‑150 (MQ=255) cACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCAcc > 1:1428281/1‑150 (MQ=255) cgcgATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCACCCa < 2:626664/150‑1 (MQ=255) cGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCACCCAGCTCAc < 1:1084204/150‑1 (MQ=255) cgtcaAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCACCCAGCTCACGGAATACGc > 2:1578964/1‑150 (MQ=255) gtcaAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCACCCAGCTCACGGAATACGCt < 1:1496250/150‑1 (MQ=255) aaaGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCACCCAGCTCACGGAATACGCTggg > 2:486054/1‑150 (MQ=255) aaaGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGAACGTCCGGTTGCGAAAGACACACAGTCAAGTCGGCAACCAGCTCACGGAATACGCTggg > 1:876009/1‑150 (MQ=255) aaaGGAAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCACCCAGCTCACGGAATACGCTggg < 1:651399/150‑1 (MQ=255) aaGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCACCCAGCTCACGGAATACGCTGGgc < 1:486054/150‑1 (MQ=255) ggacaTGCCGATCTCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCACCCAGCTCACGGAATACGCTGGgcgc > 1:1009651/5‑150 (MQ=255) aTGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCACCCAGCTCACGGAATACGCTGGGCGCAAcc < 1:1241575/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCACCCAGCTCACGGAATACGCTGGGCGCAACCt > 2:1092894/1‑150 (MQ=255) gCCGATCTCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGGTAAAGATTTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCCCCGCGCTTACGGAAGACGCCGGGCGCAACCtt > 1:1593985/1‑150 (MQ=255) | ATCAGCGTACCGACCACCCCGCCTTGCAGCTTGCCATGTTCCTGCAGGTCGCGAGCAATGATGAACAGCAGCTCGTCACCGTCGACGATGGCGCCCGTGTGGTCGACCATCAGCACGCGATCGCCGTCACCGTCAAAGGCAATGCCGAGATCGGCATGTCCGACCAGTACAGCGGCCTGCAGCGATTCGATGTGTGTCGAGCCGCAACCTTCGTTGATGTTCAGGCCGTCCGGTTGCGCATGCAGCACGGTCACGTCGGCACCCAGCTCACGGAATACGCTGGGCGCAACCTT > NC_002947/5362963‑5363255 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |