Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,366,334 | G→A | 7.2% | V90V (GTC→GTT) | ftsH ← | integral membrane ATP‑dependent zinc metallopeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,366,334 | 0 | G | A | 7.2% | 191.1 / 5.3 | 69 | V90V (GTC→GTT) | ftsH | integral membrane ATP‑dependent zinc metallopeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/30); new base A (2/3); total (36/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.65e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.60e-01 |
AGCTCATCGGCCCGCCCTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGCCATCCTTGACCTGCTG > NC_002947/5366189‑5366483 | aGCTCATCGGCCCGCCCTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGACCATCCAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCa < 1:100225/150‑1 (MQ=255) tCATCGGCCCGCCCTTGCCGCCCGCGCCAACTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGt > 2:403028/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCCCTTGTCCGCCACGCGACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTg > 2:1303009/1‑150 (MQ=255) gcccgcccTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACAACCACGTGGtcgt > 2:437280/1‑147 (MQ=255) cccgcccTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTgg < 1:517916/145‑1 (MQ=255) cccgcccTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTgg > 2:517916/1‑145 (MQ=255) gcccTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACAACCACGTGGTCGTCGaa < 1:475661/150‑2 (MQ=255) gcccTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACAACCACGTGGTCGTCGaa < 1:437280/150‑2 (MQ=255) gcccgcGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCTCGTGGTTGTCGACCAGATCGcc < 2:501093/150‑1 (MQ=255) cccgcGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCg < 2:1450328/150‑1 (MQ=255) cgcgCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGAt > 2:297772/1‑150 (MQ=255) ttGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCAtt > 2:242865/1‑150 (MQ=255) ttGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCAtt > 1:357244/1‑150 (MQ=255) tCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCgg > 1:646685/1‑150 (MQ=255) tCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCgg < 1:981084/150‑1 (MQ=255) ggCGAATGAAGAGCATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGa < 2:655241/150‑1 (MQ=255) aagaaCATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCCGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCggg < 1:384242/150‑1 (MQ=255) gaaCATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGAc > 1:778405/1‑111 (MQ=255) gaaCATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGAc < 2:778405/111‑1 (MQ=255) gaaCATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGgcg > 2:1139905/1‑150 (MQ=255) gaaCATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGgcg > 2:1047350/1‑150 (MQ=255) cATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATg > 1:942923/1‑139 (MQ=255) cATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATg < 2:942923/139‑1 (MQ=255) cATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGcac > 1:527329/1‑150 (MQ=255) aaCACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACAACCACGTGGtc > 2:1600701/1‑97 (MQ=255) aaCACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACAACCACGTGGtc < 1:1600701/98‑2 (MQ=255) cacGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCtt < 1:203397/150‑1 (MQ=255) ggCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGaa > 1:65165/1‑150 (MQ=255) ggCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGaa > 1:203126/1‑150 (MQ=255) ggCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGaa < 1:43823/150‑1 (MQ=255) aaTGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGAcc > 1:740753/1‑82 (MQ=255) aaTGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGAcc < 2:740753/82‑1 (MQ=255) tGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGt > 2:1373806/1‑150 (MQ=255) gATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTc < 2:527329/150‑1 (MQ=255) tCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACCCAACAAGAAACCATATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCAAAGTCTTGAGGTTGTCGc > 1:1349865/1‑150 (MQ=255) aCCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGAcc > 2:289963/1‑90 (MQ=255) aCCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGAcc < 1:289963/90‑1 (MQ=255) cAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGTTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTg > 2:1463814/1‑115 (MQ=255) cAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTg < 1:1463814/115‑1 (MQ=255) aGGATCGGGAAGCCCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTTTCGCCATCg < 1:403028/150‑1 (MQ=255) ggATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCCCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTgg < 1:1156025/77‑1 (MQ=255) ggATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCCCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTgg > 2:1156025/1‑77 (MQ=255) cTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCa < 1:1047350/150‑1 (MQ=255) cTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCa < 1:297772/150‑1 (MQ=255) gCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTa > 2:1493965/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTaa > 2:616106/1‑150 (MQ=255) accaGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAatg > 1:1256289/1‑150 (MQ=255) ccaGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTTTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAatga > 1:954078/1‑150 (MQ=255) ccaGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAatga < 2:203126/150‑1 (MQ=255) ccaGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAatga > 2:343985/1‑150 (MQ=255) aGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTCCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAatgatg > 2:947079/1‑150 (MQ=255) cAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTa < 2:673031/150‑1 (MQ=255) gTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCg > 2:205374/1‑150 (MQ=255) aGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACgg < 1:1493965/150‑1 (MQ=255) gCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTcac > 2:17574/1‑150 (MQ=255) ctGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACg < 1:1139905/150‑1 (MQ=255) tGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCg > 2:1378642/1‑108 (MQ=255) tGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCg < 1:1378642/108‑1 (MQ=255) ttGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTc < 2:646685/150‑1 (MQ=255) cTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGc < 1:754111/113‑1 (MQ=255) cTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGc > 2:754111/1‑113 (MQ=255) cTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGAc < 1:343985/150‑1 (MQ=255) aGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCa < 2:811243/97‑1 (MQ=255) aGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCa > 1:811243/1‑97 (MQ=255) gctgctTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTCGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGc < 2:1256289/150‑1 (MQ=255) tgctTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGCCa > 2:1155461/1‑150 (MQ=255) gctTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTCGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGCCAt > 2:474977/1‑150 (MQ=255) ttGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACCGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACgg < 1:225376/127‑1 (MQ=255) ttGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACgg > 2:225376/1‑127 (MQ=255) gacCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCCGTAATGAGGTAGCCGTCGCCGGTGACACGCTGTACCTGGCCATCCTTGACctgctg < 1:205374/150‑1 (MQ=255) | AGCTCATCGGCCCGCCCTTGCCGCCCGCGCCACCTTGCATCTGGCGCATGAAGAACATGAACACGGCAATGATCACCAGGATCGGGAAGCTCGCCACCAGCAACTGCGTCCAGATGCTCTGTTGCTCAGGCTGCTTGCCTTCGACGACCACGTGGTTGTCGACCAGATCGCCGATCAGGCCATTGTCGGTGATGGCCGGGCGCACAGTCTTGAAGTTGTCGCCATCGGTGCGCTTGCCAGTAATGATGTAGCCATCGACGGTCACACGCTCGACCTTGCCATCCTTGACCTGCTG > NC_002947/5366189‑5366483 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |