Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,503,184 | T→G | 6.8% | L29R (CTG→CGG) | oprC → | copper receptor OprC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,503,184 | 0 | T | G | 6.8% | 207.9 / 3.2 | 73 | L29R (CTG→CGG) | oprC | copper receptor OprC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/34); new base G (2/3); total (36/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 |
CAACATTTTGCGCACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCGACGGCGC > NC_002947/5503035‑5503331 | caacaTTTTGCGCACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCt > 1:343517/1‑150 (MQ=255) acaTTTTGCGCACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTgg < 1:458720/150‑1 (MQ=255) acaTTTCGCGCCCGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGAATGATCGACTGGAACCATTATGTCCGGCTGCTCCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTgg < 1:708198/150‑1 (MQ=255) aTTTTGCGCACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGgcc < 2:260636/150‑1 (MQ=255) ttttGCGCACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGgccg > 1:693879/1‑150 (MQ=255) ttttGCGCACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGgccg > 1:574450/1‑150 (MQ=255) gcACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGcc > 1:1052660/1‑150 (MQ=255) aaGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCTCATGGCCAGGGCCGGCGGccagggc < 1:699973/150‑6 (MQ=255) gCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCa < 2:192943/150‑1 (MQ=255) aggaggCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGa > 1:397988/1‑150 (MQ=255) ggaggCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGCACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCAGGGCCGGCGGCCAGGGCCATggg < 2:431371/150‑3 (MQ=255) ggagcCTGCGGGCTAACTCCTGACTGATCGACTGGACTCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGaa < 2:343517/150‑1 (MQ=255) gCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGAcc > 2:871809/1‑150 (MQ=255) ttCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGAcc > 2:242381/1‑148 (MQ=255) ttCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGAcc < 1:242381/148‑1 (MQ=255) ttCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCAt < 1:871809/150‑1 (MQ=255) aaCTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCacga < 1:1575910/150‑1 (MQ=255) aaCTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGATGATTGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCacga < 1:1607524/150‑1 (MQ=255) aCTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCGGGTCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCacgac > 1:500215/1‑150 (MQ=255) ncATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTNTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGc > 1:368923/2‑150 (MQ=255) cTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTTCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGa > 2:704665/1‑150 (MQ=255) aTCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGtt < 2:368923/150‑1 (MQ=255) cGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTCTTCGCCGCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGa < 2:388171/150‑1 (MQ=255) taCTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCAt < 2:349348/126‑1 (MQ=255) gACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCAt > 1:349348/1‑127 (MQ=255) cTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGcc < 2:574450/150‑1 (MQ=255) gAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGa > 2:657763/1‑150 (MQ=255) gAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGa > 2:1499415/1‑150 (MQ=255) aTCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACg < 2:397988/150‑1 (MQ=255) ttATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGa > 1:1447448/1‑150 (MQ=255) cTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCACCTTCGTGATCACCGCCGt < 1:56169/150‑1 (MQ=255) cACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGc < 2:693879/150‑1 (MQ=255) cccTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCAGGGCCGGCGGCCAGGGCCAt > 1:1303802/1‑91 (MQ=37) cccTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCAGGGCCGGCGGCCAGGGCCAt < 2:1303802/91‑1 (MQ=37) ccTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCg > 1:607549/1‑150 (MQ=255) ccTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCGCGCGCCCATGGCCCTGGCAGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGGCCCg > 1:607538/1‑150 (MQ=255) cTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGa > 2:763547/1‑150 (MQ=255) cTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGa > 1:237331/1‑150 (MQ=255) ttttGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGAGGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTc < 2:409220/150‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTg > 1:472589/1‑110 (MQ=255) ccTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTg < 2:472589/110‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTcgccgc < 2:1044288/150‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTcgccgc < 2:1517654/150‑1 (MQ=255) cTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCt < 1:990637/150‑1 (MQ=255) cTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCt < 2:1447448/150‑1 (MQ=255) ttGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAg > 1:755355/1‑110 (MQ=255) ttGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAg < 2:755355/110‑1 (MQ=255) tGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTgg < 1:704665/150‑1 (MQ=255) cATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGa > 2:585559/1‑98 (MQ=255) cATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGa < 1:585559/98‑1 (MQ=255) cATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACtgtg < 2:934628/139‑1 (MQ=255) cATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAAccc < 1:763547/150‑1 (MQ=255) cATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGGTCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACtgtg > 1:934628/1‑139 (MQ=255) tCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCACATGGCCCTGGCCGCCGGCCATGGCCAAGAAGACCATCTGCAAAACGCACCCGAATGTAGCTCGACGGTGAGCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGa > 2:596717/1‑150 (MQ=255) gccgccCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGaaa > 1:329569/1‑150 (MQ=255) tgtgCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAAcc > 2:663794/1‑138 (MQ=255) tgtgCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAAcc < 1:663794/138‑1 (MQ=255) tgtgCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCcgc > 1:1422379/1‑150 (MQ=255) ggCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCgccag > 1:1134996/1‑150 (MQ=255) cTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGt < 2:439906/96‑1 (MQ=255) cTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGt > 1:439906/1‑96 (MQ=255) cTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACt > 2:1398188/1‑118 (MQ=255) cTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACt < 1:1398188/118‑1 (MQ=255) gctgctCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGa > 2:1372506/1‑71 (MQ=255) gctgctCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGa < 1:1372506/71‑1 (MQ=255) ctCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCg < 1:657763/150‑1 (MQ=255) tCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCgg > 2:1119484/1‑150 (MQ=255) gcgcCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGcc < 2:364026/150‑1 (MQ=255) ccATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCg > 2:25822/1‑150 (MQ=255) ggCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCGACgg < 2:1613823/150‑1 (MQ=255) cccTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCGACGgcg > 1:668473/1‑150 (MQ=255) cccTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCGACGgcg > 2:1202121/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCGACGgcgc > 1:420750/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCGCAAGCCCTGGCCATGAAGACAATGTGCACGACGCACCCGAGTTACGCACGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCCAGTTCGCCGATGACTGTGAACACCAACCCAAAAGACCCGCGCCAGCCAGTACCAGCCAGCGACGgcgc > 2:745337/1‑150 (MQ=255) | CAACATTTTGCGCACGAAGCCAGGAGGCTTCGCGCTAACTCATGACTGATCGACTGGAATCATTATGTCCGGCTGCACCCCTGTTTTTGCCTTGTCCCTGCGTGGGACCATCGCCGCCCTGTGCGGCTCGCTGCTCGCGCCCATGGCCCTGGCCGCCGGCCCTGGCCATGAAGACCATGTGCACGACGCACCCGAGTTGAGCCCGACGGTGATCACCGCCGTGGCCCCGAGTTCGCCGCTGACTGTGGTCACCAACCCGAAAGACCCGCGCCAGCCAGTGCCGGCCAGCGACGGCGC > NC_002947/5503035‑5503331 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |