| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1967188 = | 37 (0.480) | 25 (0.440) | 17/200 | 3.2 | 46.4% | intergenic (+15/+104) | PP_1762/yciK | hypothetical protein/putative oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | 1967284 = | 30 (0.520) | intergenic (+111/+8) | PP_1762/yciK | hypothetical protein/putative oxidoreductase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CATGCCGGTGTACCTGTACCTGATGGGGCCGGACAGCACAGGGGTGAACGGGCAGGCGTTCAACGCCCAATAAACCTGCATCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1967364‑1967188‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGCATCGCCGT > NC_002947/1967284‑1967429 CATGCCGGTGTACCTGTACCTGATGGGGCCGGACAGCACAGGGGTGAACGGGCAGGCGTTCATCGCGCGATAAACCTGCATCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTG < 1:991544/150‑1CATGCCGGTGTACCTGTACCTGATGGGGCCGGACAGCACAGGGGTGAACGGGCAGGCGTTCAACGCCCAATAAACCTGCATCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTG < 1:1540507/150‑1 ATGCCGGTGTACCTGTACCTGATGGGGCCGGACAGCACAGGGGTGAACGGGCAGGCGTTCAACGCCCAATAAACCTGCATCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGG < 1:142069/150‑1 GCCGGTGTACCTGTACCTGATGGGGCCGGACAGCACAGGGGTGAACGGGCAGGCGTTCAACGCCCAATAAACCTGCATCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGA < 2:920867/150‑1 ACCTGTACCTGATGGGGCCGGACAGCACAGGGGTGAACGGGCAGGCGTTCAACGCCCAATAAACCTGCATCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAA < 1:1196850/150‑1 CAATAAACCTGCATCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGC > 2:1519700/1‑96 CAATAAACCTGCATCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGC < 1:1519700/96‑1 ACCTGCATCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGA < 2:636369/99‑1 ACCTGCATCGGCCTCCTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGA > 1:636369/1‑99 GCATCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGG < 1:1213714/80‑1 GCATCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGG > 2:1213714/1‑80 TCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTG > 1:1080983/1‑64 TCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTG < 2:1080983/64‑1 CCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACAC > 1:752804/1‑150 CCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTG < 1:57099/119‑1 CCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTG > 2:57099/1‑119 CGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTG > 1:463142/1‑120 CGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTG < 2:463142/120‑1 GCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCG > 2:906357/1‑150 CTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACA > 2:963845/1‑140 CTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACA > 2:963169/1‑140 CTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACA < 1:963169/140‑1 CTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACA < 1:963845/140‑1 TCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGC > 1:1260575/1‑150 TCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGC > 2:1763662/1‑150 TCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGC > 2:450033/1‑150 CCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCAT > 2:1325478/1‑150 CACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATG > 1:877031/1‑150 ACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTAC < 1:1424712/134‑1 ACAGGCAGGGCGAACTCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTAC > 2:1424712/1‑134 GCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTC > 2:1213617/1‑150 GCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGC < 1:699644/142‑1 GCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGC > 2:699644/1‑142 AGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGCCCTGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTT > 2:663781/1‑150 GGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCG < 1:1325478/150‑1 GCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGG < 2:877031/150‑1 GTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGT < 1:450033/150‑1 GTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGT < 2:1260575/150‑1 CCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAG > 2:1003110/1‑101 CCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAG < 1:1003110/101‑1 CTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGC > 2:1657202/1‑86 CTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGC < 1:1657202/86‑1 TGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCC > 2:1706266/1‑150 gGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGG < 2:752804/149‑1 GGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGG < 1:781871/143‑1 GGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGG > 2:781871/1‑143 GCAAGCCCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCT < 1:1434921/150‑1 CCGCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCC > 2:923116/1‑150 CCGCGAAGAGGCAGATGCAGGTTTATTGGTCTGTGAACGCCGGCCCGGTCACCCCGGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTAAAGGTACACCGGCATGCTCCCCTCGCGCATCGGGCTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCC > 2:1852837/1‑150 GCGAAGAGGCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGGGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGC > 1:1401183/1‑150 GCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGCATCGCCGT < 1:1213617/150‑1 GCCGATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGCATCGCCGT > 2:1161701/1‑150 CATGCCGGTGTACCTGTACCTGATGGGGCCGGACAGCACAGGGGTGAACGGGCAGGCGTTCAACGCCCAATAAACCTGCATCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGGGCGCAATCCTTGAGGGTTGCGGTGATCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1967364‑1967188‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccgATGCAGGTTTATTGGGCGTTGAACGCCTGCCCGTTCACCCCTGTGCTGTCCGGCCCCATCAGGTACAGGTACACCGGCATGATCTCTTCGGGCAGCGGGTTGTTCTGCGGGTTCTCGCCGGGGTAGGCCTGGGCCCGCATCGCCGT > NC_002947/1967284‑1967429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |