New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5201663 | 62 (0.810) | 18 (0.330) | 16/192 | 3.2 | 30.3% | intergenic (‑101/‑79) | PP_4582/PP_4583 | membrane protein/putative Peptidase |
? | NC_002947 | = 5201684 | 38 (0.690) | intergenic (‑122/‑58) | PP_4582/PP_4583 | membrane protein/putative Peptidase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
CTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGC > NC_002947/5201517‑5201808 | cTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 2:260263/1‑150 (MQ=255) tACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGGCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCAAca > 1:318326/1‑149 (MQ=255) cTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTc > 2:142330/1‑150 (MQ=255) tGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCg < 1:260263/150‑1 (MQ=255) ccccAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATccc > 2:1046440/1‑150 (MQ=255) ccccAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATccc > 2:1046615/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTg > 2:1339002/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTg > 2:1339012/1‑150 (MQ=255) cAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGt < 1:288455/150‑1 (MQ=255) aGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTTGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTATCTCGGTGCGATCCCTGtt < 2:37055/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTg < 2:1761200/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTg < 1:1086049/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATACCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTg < 1:304666/150‑1 (MQ=255) cGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGa < 1:1745513/150‑1 (MQ=255) cGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGa < 1:142330/150‑1 (MQ=255) ggTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCgg < 2:1609705/150‑1 (MQ=255) gtgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg < 2:1085929/150‑1 (MQ=255) gtgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg < 1:678338/150‑1 (MQ=255) gtgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg < 1:1399403/150‑1 (MQ=255) gtggAGTCGTTCTCGGGCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggt < 2:856891/150‑2 (MQ=255) tgtAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGt > 2:1433132/1‑150 (MQ=255) tAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCgg < 2:1335398/146‑1 (MQ=255) tAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCgg > 1:1335398/1‑146 (MQ=255) tCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTAcc < 2:324170/150‑1 (MQ=255) tcGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:324826/150‑1 (MQ=255) tcGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 1:14692/150‑1 (MQ=255) gTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag < 1:1339002/150‑1 (MQ=255) gTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag < 1:1339012/150‑1 (MQ=255) tGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 1:1433132/150‑1 (MQ=255) aGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTg < 2:1096237/104‑1 (MQ=255) aGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTg > 1:1096237/1‑104 (MQ=255) tttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg < 2:1603394/67‑1 (MQ=255) tttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCggg > 1:1603394/1‑67 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCtt < 2:89934/101‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCtt > 1:89934/1‑101 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCtt < 2:1250841/100‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCtt > 1:1250841/1‑100 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCg > 2:1190703/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCg > 2:1359202/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAagag > 1:205055/1‑91 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAagag < 2:205055/91‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGAcc > 2:661865/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGt > 1:1548184/1‑150 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTa > 1:1641424/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAag < 2:239008/57‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAag > 1:239008/1‑57 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATg > 1:812939/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGAtt > 1:1891044/1‑114 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGAtt < 2:1891044/114‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTgg > 1:329152/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTgg > 1:47940/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGc > 2:1265043/1‑115 (MQ=255) cccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGc < 1:1265043/115‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGAccc < 2:763685/139‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGAccc > 1:763685/1‑139 (MQ=255) cccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGc > 2:185789/1‑145 (MQ=255) cccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGc < 1:185789/145‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGc > 1:1163225/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGc > 2:358480/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCt > 1:1523379/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCt > 1:273158/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCAAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTg > 1:178270/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGc > 2:197621/1‑150 (MQ=255) | CTACTGCGTACAAGCCCCAGGCGAAGGTGTAGTCGTTCTCGGTCATGGTGTTCGTGCAAGCCAGGCAAAGAGATGCCTATGATAAACACTTTTCCGGGCGCAGACAGTGTTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCTCGGTGCGATCCCTGTTGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTCCAATCAAGAGACCTTCAATGCCAACCAAGCCCCAACCCCCGATTGCCCAAGCCGACCAGGCCACCGACCCGTATGCCTGGCTGC > NC_002947/5201517‑5201808 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |