| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,060,099 | Δ1 bp | 5.4% | coding (242/891 nt) | iciA → | chromosome initiation inhibitor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,060,099 | 0 | A | . | 5.4% | 289.3 / 10.2 | 93 | coding (242/891 nt) | iciA | chromosome initiation inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (43/44); new base . (2/3); total (46/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.35e-01 | |||||||||||
GGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGAC > NC_002947/1059950‑1060241 | ggCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTTCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCa < 2:2003393/150‑1 (MQ=255) cGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAgg > 1:1315100/1‑150 (MQ=255) aTTTCCCAGCGAATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTa > 2:1155120/1‑150 (MQ=255) gcAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGGCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑ggg > 1:1153381/2‑149 (MQ=255) ccAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCC‑GGTAcctggc > 1:408290/1‑146 (MQ=255) cAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCCGCTACTCCACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑Ggcg > 1:2293028/1‑150 (MQ=255) gcgcATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑Ggcg > 2:1805911/1‑148 (MQ=255) gcgcATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑Ggcg < 2:182790/148‑1 (MQ=255) gcgcATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑Ggcg > 1:182790/1‑148 (MQ=255) gcgcATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑Ggcg < 1:1805911/148‑1 (MQ=255) gcATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTgc < 2:386620/150‑2 (MQ=255) cATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGGCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGa < 1:2298213/150‑1 (MQ=255) cATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGa < 1:2139179/150‑1 (MQ=255) cATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTgca < 2:408290/150‑3 (MQ=255) aTCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGAc > 2:473443/1‑150 (MQ=255) aTCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGAc < 2:2297176/150‑1 (MQ=255) tCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCt < 1:631385/145‑1 (MQ=255) tCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCt > 2:631385/1‑145 (MQ=255) tGCTTGAGGGGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAgg < 2:561698/150‑1 (MQ=255) tGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAgg < 2:2333541/150‑1 (MQ=255) ttGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCa > 1:618623/1‑150 (MQ=255) ttGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCa > 1:2207785/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTg < 2:998450/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTCCAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTgcag < 1:642860/125‑4 (MQ=255) gCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTCCAGCGCC‑GGTACCTGGCGCTgcag > 2:642860/1‑122 (MQ=255) aGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCa > 1:1590831/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATc > 2:1809366/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGcc < 2:2309829/150‑1 (MQ=255) tGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGc < 2:1294226/147‑1 (MQ=255) tGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGc > 1:1294226/1‑147 (MQ=255) gCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGAt > 2:1446885/1‑150 (MQ=255) gCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGAt > 1:264587/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGACAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATa < 1:106890/150‑1 (MQ=255) tCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGACGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGc > 2:941801/1‑150 (MQ=255) gccgccCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCt > 1:2319240/1‑150 (MQ=255) ccgccCGGCGCGACCGAAGTCGGCCCCCATCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTg < 2:2293028/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCCGGAACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCa > 1:403195/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCa > 1:3425/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCa > 2:1046744/1‑150 (MQ=255) gACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGcc > 2:186384/1‑121 (MQ=255) gACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGcc < 1:186384/121‑1 (MQ=255) gACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCtggtg < 1:528731/150‑1 (MQ=255) ccGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTggg > 1:2244583/1‑150 (MQ=255) ccGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACA‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGGGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTggg < 2:772439/150‑1 (MQ=255) cGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGc < 1:1992265/150‑1 (MQ=255) aGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCgg < 2:618623/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGcgcg > 1:2147151/1‑150 (MQ=255) ccgccAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGt < 2:2319240/150‑1 (MQ=255) gccAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTgg > 1:789078/1‑150 (MQ=255) gccAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTgg < 1:473443/150‑1 (MQ=255) gccAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTgg < 2:2207785/150‑1 (MQ=255) aGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCa > 2:1314860/1‑150 (MQ=255) gCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTg > 2:432065/1‑145 (MQ=255) gCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTg < 1:432065/145‑1 (MQ=255) cAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCCACGCCGATAGCCTGGCCTCCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTg < 2:1435456/150‑1 (MQ=255) cAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGTCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTg < 2:1435616/150‑1 (MQ=255) aaCCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCTCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACtt > 1:1541012/1‑146 (MQ=255) aaCCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCTCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACtt < 2:1541012/146‑1 (MQ=255) aaCCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTg > 1:906765/1‑138 (MQ=255) aaCCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTg < 2:906765/138‑1 (MQ=255) aaCCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTgc > 2:885602/1‑150 (MQ=255) aaCCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTgc > 1:105573/1‑150 (MQ=255) aaCCATGTGCAGCAGGTGCGCCGGCTCGAACGCGACCTGCAGGGCCATGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCCTAGCGCAGAGGGCGGAGAGCCTTCTCACCTGTTGGTCCGGCGCGGTGGCCAACTTCTgc > 2:1674484/1‑150 (MQ=255) ccATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTgcgc > 2:2036762/1‑150 (MQ=255) cATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTggg < 1:2176480/137‑1 (MQ=255) cATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCCGTggg > 2:2176480/1‑137 (MQ=255) cATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGAGATGCCAGAAGAGGACGTGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGca < 2:1024141/150‑1 (MQ=255) aTGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGcac < 1:1155120/150‑1 (MQ=255) tgtgCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGAACTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGcaca > 2:1779692/1‑150 (MQ=255) gcagcaGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCacaaca < 1:1215354/150‑1 (MQ=255) cagcagGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTAGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAg > 2:822478/1‑150 (MQ=255) gcagGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGaa < 1:1314860/150‑1 (MQ=255) gTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCGTCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGtc < 2:1605014/150‑2 (MQ=255) cTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTgaccgac < 1:2036762/150‑1 (MQ=255) cGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTTGGCCGGCGCGGTgg < 1:2166775/113‑1 (MQ=255) cGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTgg > 2:2166775/1‑113 (MQ=255) gAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGGATGCGGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTGAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtg > 1:477005/1‑150 (MQ=255) aaCGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtgg > 1:295195/1‑150 (MQ=255) aCGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtggt > 2:1611556/1‑150 (MQ=255) aCGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtggt > 2:669634/1‑150 (MQ=255) cgcgACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtggtg < 2:3425/150‑1 (MQ=255) gACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtgg < 2:1142604/145‑1 (MQ=255) gACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCtgg > 1:1142604/1‑145 (MQ=255) gACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGtt > 2:2084178/1‑150 (MQ=255) ccTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGa < 1:1618245/150‑1 (MQ=255) ccTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGa < 1:55928/150‑1 (MQ=255) ccTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGa < 2:1445404/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAg < 2:2244583/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAg < 2:1126640/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAg < 1:2012637/150‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGa > 1:249637/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGAc < 1:1879087/150‑1 (MQ=255) ccAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGTCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGtt < 2:2321343/139‑1 (MQ=255) ccAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGtt > 1:2321343/1‑139 (MQ=255) aGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCacaa < 2:500227/110‑1 (MQ=255) aGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCacaa > 1:500227/1‑110 (MQ=255) aGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAg > 2:26317/1‑140 (MQ=255) aGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAg < 1:26317/140‑1 (MQ=255) aGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGAc > 2:2084442/1‑143 (MQ=255) aGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGAc < 1:2084442/143‑1 (MQ=255) | GGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGCTGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGTACC‑GGCGCTGGACGAAGAGGGCATGCCGGAGCGCCTGCGCATCGCCCTCAACGCCGATAGCCTGGCCACCTGGTGGGCCGGCGCGGTGGGCAACTTCTGCGCACAACAGAACGTGCTGACCGACCTGGTGGTTGAGGAC > NC_002947/1059950‑1060241 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |