| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,414,219 | Δ1 bp | 5.6% | coding (256/561 nt) | PP_1236 ← | glycine cleavage system transcriptional repressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,414,219 | 0 | T | . | 5.6% | 277.1 / 10.2 | 90 | coding (256/561 nt) | PP_1236 | glycine cleavage system transcriptional repressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/35); new base . (2/3); total (50/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.35e-01 | |||||||||||
CAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGACCA > NC_002947/1414073‑1414362 | cAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCg > 2:2038796/1‑150 (MQ=255) aggtaggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGc > 1:750880/1‑148 (MQ=255) aggtaggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGc < 2:750880/148‑1 (MQ=255) aggtaggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTCGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCgg > 1:1013554/1‑150 (MQ=255) gtaggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGAc > 2:1361977/1‑150 (MQ=255) aggtGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCa < 1:1465974/150‑1 (MQ=255) gtgtCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCAGC‑GCGGACCagg < 2:1406358/150‑3 (MQ=255) gtCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑AGCGCGGACCaggaa < 2:1603207/150‑5 (MQ=255) gCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCGAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAg > 1:2187855/1‑150 (MQ=255) cAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAgg > 2:1180221/1‑150 (MQ=255) aGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAggg > 1:1799690/1‑150 (MQ=255) ggTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGt < 1:1291261/150‑1 (MQ=255) cATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAg > 1:324946/1‑150 (MQ=255) ggCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCTGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGcc > 2:2024080/1‑150 (MQ=255) ggCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCaggaa < 2:1282054/138‑5 (MQ=255) ggCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCaggaa > 1:1282054/1‑134 (MQ=255) ggCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGcc > 2:2166770/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTg > 2:1457255/1‑150 (MQ=255) aGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGcttc < 2:1995218/150‑1 (MQ=255) tCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTg > 1:1734494/1‑150 (MQ=255) gACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGcc > 2:1930158/1‑150 (MQ=255) gcgGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCaa < 1:1457255/150‑1 (MQ=255) ggtggtCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGc < 2:1517887/150‑1 (MQ=255) gtggtCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGcc > 2:2040040/1‑150 (MQ=255) ggtCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTg < 2:404114/150‑1 (MQ=255) tCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGc > 2:1122714/1‑150 (MQ=255) aaGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAg > 1:2069904/1‑150 (MQ=255) aaGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGACTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCAGCGGCCCACCCTGAGCGCCAGTGCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAg > 1:1321360/1‑150 (MQ=255) aGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACACAGGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAgg > 2:563489/1‑150 (MQ=255) ggAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTg < 1:885587/134‑1 (MQ=255) ggAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTg > 2:885587/1‑134 (MQ=255) ggAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAggg > 2:1964193/1‑150 (MQ=255) ggAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAggg > 1:1483947/1‑150 (MQ=255) taagaaCTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCTGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGt < 1:78618/149‑1 (MQ=255) gaagaaCTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGt > 2:992721/1‑150 (MQ=255) gaagaaCTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGt > 1:269172/1‑150 (MQ=255) gaaCTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGa < 2:324946/150‑1 (MQ=255) cTGGCACAGTTTGTTTATGATGTCCAGGGGGGAGGCAGCGCTAACATAGGCCACCCACCGAAAGCCCTGCGCGCGCACTTCCTCGTCCAC‑GCCGCGCCCCTCGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTc < 2:723273/150‑1 (MQ=255) ggCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCga < 2:306421/150‑1 (MQ=255) gCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCg > 1:1932958/1‑103 (MQ=255) gCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCg < 2:1932958/103‑1 (MQ=255) gCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGa < 1:1224933/104‑1 (MQ=255) gCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGa > 2:1224933/1‑104 (MQ=255) gCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCaa < 2:1828940/129‑1 (MQ=255) gCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCaa > 1:1828940/1‑129 (MQ=255) gCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCgag > 2:2273667/1‑150 (MQ=255) cacaGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCgaga < 2:1013554/150‑1 (MQ=255) acaGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCAGC‑GCGGACCa > 2:1830231/1‑96 (MQ=255) acaGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGCAGC‑GCGGACCa < 1:1830231/96‑1 (MQ=255) acaGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCt < 2:635688/88‑1 (MQ=255) acaGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGAc > 1:1673954/1‑150 (MQ=255) acaGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACGTCCTGGTCCGC‑GCt > 1:635688/1‑88 (MQ=255) gTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTc > 2:2156691/1‑100 (MQ=255) gTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAAGGCCTGCGTGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTc < 1:2156691/100‑1 (MQ=255) ttGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAgg > 2:123651/1‑150 (MQ=255) ttGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAgg > 1:1143507/1‑150 (MQ=255) gTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCa < 1:1361977/150‑1 (MQ=255) 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ccACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGgcgc > 1:200346/1‑150 (MQ=255) cacaTACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAggg < 2:2104345/146‑1 (MQ=255) cacaTACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAggg > 1:2104345/1‑146 (MQ=255) acaTACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTg > 1:1117486/1‑150 (MQ=255) caggAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGtct > 1:385161/3‑150 (MQ=255) 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tGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGTCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTggcgg < 2:2069904/150‑1 (MQ=255) tGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGCCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTggcgg < 2:1321360/150‑1 (MQ=255) gggCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCCCGTCGAGGGTCAGGGCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCATCTGCCGCCCCCCTGCAGCACCAGGGCGCTGGCCTCGCCGTGGCGGCTc > 1:456651/1‑150 (MQ=255) ggCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCa < 1:1122714/150‑1 (MQ=255) gcACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGAGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAgtc > 2:15983/1‑148 (MQ=255) aCTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGgcgc > 2:1368915/1‑150 (MQ=255) tCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTTTCTCCTTTGCGGCTCAGGCGCGAg < 1:2166770/150‑1 (MQ=255) tCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAg < 2:1143507/150‑1 (MQ=255) gTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGac < 2:2187855/150‑1 (MQ=255) ccGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGacca < 2:1117486/150‑1 (MQ=255) gc‑gcTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAgg < 2:1503351/75‑1 (MQ=255) gc‑gcTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAgg > 1:1503351/1‑75 (MQ=255) | CAGGTAGGTGTCGCAGGTCATGGCTTCCAGCTCGACGCGGTGGTCAAGGAAGAACTGGCACAGCTCGTTGATGATGTCCGGGCGGTAGGCAGCGCTCACGTAGGCCACATACGGAAGGGCCTGCGGGCGCACTTCCTGGTCCGC‑GCTGCGGACCACGTCGAGGGTCAGGCCGTGCTTCTTGCCCAAGCCTGGCAGGGTGGATTCGAGACGTGCCAGGGCGTCCCAGCTGCCGCCCACCTGCAGCACCAGGGCGCTGGTCTCGCCGTGGCGGCTCAGGCGCGAGGTGACCA > NC_002947/1414073‑1414362 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |