New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 799870 | 115 (1.370) | coding (606/969 nt) | ispB | octaprenyl diphosphate synthase |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGAACAGCATCGCCGTCTTGCCGCGAATGACCTCCATGTAGACTTCCTCG > NC_002947/799706‑799999 | tGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTgg > 2:2201566/1‑150 (MQ=255) aCCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCTCCGGCAGCGCAGGTTTACTCAAGACAAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGcc > 2:2328326/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCTGGTCGACGACCTGCTGGactacaag < 2:1175397/150‑8 (MQ=255) 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aGTGCATTTGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCaaa > 2:1160376/1‑150 (MQ=255) gTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACTGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTGGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGAtggtcggcacag < 1:638467‑M2/150‑13 (MQ=255) gTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAg < 1:82745/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAg < 1:150380/150‑1 (MQ=255) gCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGt < 2:2061762/150‑1 (MQ=255) 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cagcagGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGaa < 1:148012/120‑1 (MQ=255) cagcagGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGAACAGCATCGCCGTCTTGCCGCGAATGACCTc < 1:2214513/150‑1 (MQ=255) cagcagGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGAACAGCATCGCCGTCTTGCCGCGAATGACCTc < 2:1313553/150‑1 (MQ=255) agctgGTCGACGACCTGCTGGACGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGAACAGCATCGCCGTCTTGCCGCGAATGACCTcc > 1:1187454/1‑150 (MQ=255) ctgtgccgaccatctgggcgtggccttccagctggtccacgacctgctggactacaagggtgactcgcagaccctgggcaagaacgtcagtgacgacctggccgagggcaaacctaccctgccgctgatctacaccatgcgcgaaggcac < 1:638467‑M1/144‑139 (MQ=255) gtcgtcGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGAtggtcgacgacctgctggactacaagggtgactcgcagaccctgggcaagaacgtc < 1:1793070‑M2/87‑57 (MQ=255) gtcgtcGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGAtggtcgacgacctgctggactacaagggtgactcgcagaccctgggcaagaacgtc > 2:1793070‑M2/1‑31 (MQ=255) gtcgacGACCTGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGAACAGCATCGCCGTCTTGCCGCGAATGACCTCCATGTa > 1:1318131/1‑150 (MQ=255) tcgtcgACCAGCTGGAAGGACACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGATCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGAACAGCATCGACGTCTTGCCGCGAATGACATACATGTAg > 2:1782/1‑150 (MQ=255) gtcgACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGcc < 1:1873315/79‑1 (MQ=255) gtcgACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGcc > 2:1873315/1‑79 (MQ=255) gtcgACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGAACAGCATCGCCGTCTTGCCGCGAATGACCTCCATGTAGAc < 1:1252278/150‑1 (MQ=255) gccgacCCtctggccgtgtccttccagctgctacacgacctgctggactacaaggctgactcgcagaccctgggcaagaacgtcggtgacgacctggccgagggcaaacctaccctgccgctgatctacaccatgcgcgaaggcactgcc < 1:1153433‑M1/148‑143 (MQ=255) tcgACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGAACAGCATCGCCGTCTTGCCGCGAATGACCTCCATGTAGACt > 2:1829544/1‑150 (MQ=255) gACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTgg > 1:19884/1‑94 (MQ=255) gACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTgg < 2:19884/94‑1 (MQ=255) ccAtctgggcgtggccttccagctggtcgacgacctgctggactacaagggtgactcgcagaccctgggcaagaacgtcggtgacgacctggccgagggcaaacctaccctgccgctgatctacaccatgcgcgaaggcactgccgagca < 1:1881817‑M1/150‑148 (MQ=255) ccAGCTGGAAGGCCACGCCCAGAtggtcgacgacctgctggactacaagggtgactcgcagaccctgggcaagaacgtcggtgacgacctggccgagg > 2:692823‑M2/1‑23 (MQ=255) ccAGCTGGAAGGCCACGCCCAGAtggtcgacgacctgctggactacaagggtgactcgcagaccctgggcaagaacgtcggtgacgacctggccgagg < 1:692823‑M2/98‑76 (MQ=255) cAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACtgtg < 1:189038/90‑1 (MQ=255) cAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACtgtg > 2:189038/1‑90 (MQ=255) cAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGAACAGCATCGCCGTCTTGCCGCGAATGACCTCCATGTAGACTTCCTc > 1:2081720/1‑150 (MQ=255) atctgggcgtggccttccagctggtcgacgacctgctggactacaagggtgactcgcagaccctgggcaagaacgtcggtgacgacctggccgagggcaaacctaccctgccgctgatctacaccatgcgcgaaggcactgccgagcagg < 1:1365585‑M1/150‑150 (MQ=255) | TGGCGTACCAGCGCCGCCTGCTCGGCAGTGCCTTCGCGCATGGTGTAGATCAGCGGCAGGGTAGGTTTGCCCTCGGCCAGGTCGTCACCGACGTTCTTGCCCAGGGTCTGCGAGTCACCCTTGTAGTCCAGCAGGTCGTCGACCAGCTGGAAGGCCACGCCCAGATGGTCGCCAAAGGTACGCAGGGCTTCGCGCTGCTCGTCGGTGGCCTGGGCCAGCGCCGCAGCACTGTGGGTAGAAGCTTCGAACAGCATCGCCGTCTTGCCGCGAATGACCTCCATGTAGACTTCCTCG > NC_002947/799706‑799999 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |