New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1114875 = | 31 (0.350) | 16 (0.230) | 14/198 | NT | 32.4% | intergenic (‑64/+115) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
? | NC_002947 | 1114951 = | 42 (0.600) | intergenic (‑140/+39) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TCAGGGTGGGCCTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTG > NC_002947/1114726‑1115023 | tcgacaaggccccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacgaccctttcg < 2:719908‑M1/1‑1 (MQ=255) acaaggccccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcnctagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGa > 1:1352551‑M1/147‑150 (MQ=255) acaaggccccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGa < 2:2277615‑M1/4‑1 (MQ=255) ggTGGGCCTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGC < 1:492752‑M1/147‑1 (MQ=255) ggTGGGCCTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGC > 2:492752‑M1/1‑147 (MQ=255) gTGGGCCTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACA > 1:1147451‑M1/1‑150 (MQ=255) gTGGGCCTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCAGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACA > 2:1445867‑M1/1‑150 (MQ=255) aaggccccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGaca > 1:1008811‑M1/145‑150 (MQ=255) aaggccccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGaca < 2:1790540‑M1/6‑1 (MQ=255) aggccccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGacac > 1:1006021‑M1/144‑150 (MQ=255) ggccccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGAcaca < 2:452862‑M1/8‑1 (MQ=255) ggCCTTGATCAGGCTGGGGAAGGCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAA < 1:454434‑M1/150‑1 (MQ=255) gCCTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGAC < 1:199628‑M1/145‑1 (MQ=255) cccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcACGCCACAAgg < 1:84066‑M1/11‑1 (MQ=255) ccTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGG > 1:280917‑M1/1‑150 (MQ=255) ccTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCATGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGG > 1:719908‑M1/1‑150 (MQ=255) ccTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGCCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGG < 1:2095854‑M1/150‑1 (MQ=255) gATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGC < 1:1467203‑M1/150‑1 (MQ=255) tCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTC > 2:1767886‑M1/1‑150 (MQ=255) tGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAG > 1:1790540‑M1/1‑150 (MQ=255) tcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACagga > 1:2277615‑M1/126‑150 (MQ=255) ccacaacgaacgccccaaacttgcagagtccgaacacgccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttngtgccgctgnacggccctntcGCGACACAAGGCCGCTCCCAcaggan > 1:1129607‑M1/125‑149 (MQ=255) gAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACagga‑gg > 2:1845498/1‑150 (MQ=255) tCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATATGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTgg > 1:747039/1‑150 (MQ=255) gaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGgcg < 2:1656670‑M1/33‑1 (MQ=255) aGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTACAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGcc < 2:2075307/150‑1 (MQ=255) gACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCTCCTTg < 1:245442/150‑1 (MQ=255) cccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGaa < 2:1384638/150‑1 (MQ=255) cccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGaa < 2:280917/150‑1 (MQ=255) cccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGaa < 1:311630/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACGCGA‑GGGTGGCGCCTTGAAg > 2:1539477/1‑150 (MQ=255) ccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAg < 2:1017918/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCT > 2:561399‑M1/1‑125 (MQ=255) ccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCT < 1:561399‑M1/125‑1 (MQ=255) ccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaa > 1:272776‑M1/1‑134 (MQ=255) ggTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGcc < 1:617706/150‑1 (MQ=255) cgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggcctctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGcc < 1:2210896‑M1/50‑1 (MQ=255) gtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggcctctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTc > 2:2210896‑M1/98‑150 (MQ=255) cgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgt > 2:2090523‑M2/1‑144 (MQ=255) cgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgt < 2:272776‑M1/150‑33 (MQ=255) aacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAgg > 2:1262624‑M1/93‑103 (MQ=255) aacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAgg < 1:1262624‑M1/11‑1 (MQ=255) aggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGa > 1:1656670‑M1/90‑150 (MQ=255) cctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑CGG‑‑‑CGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTc < 2:737331‑M1/50‑1 (MQ=255) cctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑CGG‑‑‑CGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTc > 1:737331‑M1/86‑135 (MQ=255) ggtgggtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCCCACACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggc > 2:329388‑M2/1‑135 (MQ=255) ctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGc > 2:44925‑M1/85‑150 (MQ=255) gtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgt < 1:857833‑M2/150‑21 (MQ=255) gtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgt < 1:2251190‑M2/150‑21 (MQ=255) gtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGGTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgt < 1:1683516‑M2/150‑21 (MQ=255) tttGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtg < 1:689879‑M2/136‑8 (MQ=255) tttGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtg > 2:689879‑M2/1‑129 (MQ=255) ttGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgt > 1:1154980‑M2/1‑128 (MQ=255) ttCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGCCCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGCC‑AAGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgc > 1:1590926‑M2/1‑125 (MQ=255) cgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGacac > 2:1660277‑M1/71‑77 (MQ=255) cgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGacac < 1:1660277‑M1/7‑1 (MQ=255) cgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTc < 2:1830698‑M1/17‑1 (MQ=255) cgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTc > 1:1830698‑M1/71‑87 (MQ=255) cgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGaaa > 1:811300‑M1/71‑150 (MQ=255) aTGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggc < 2:2030708‑M2/131‑16 (MQ=255) aTGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggc > 1:2030708‑M2/1‑116 (MQ=255) gtCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCg < 2:857833/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccac > 1:551534‑M1/1‑79 (MQ=255) cAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccac < 2:551534‑M1/103‑25 (MQ=255) aGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGccc < 1:1075950/150‑1 (MQ=255) cagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCtgtg < 2:302069‑M1/58‑1 (MQ=255) cagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCtgtg > 1:302069‑M1/51‑108 (MQ=255) cTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACTAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgt < 2:948396‑M2/106‑7 (MQ=255) cTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACTAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgt > 1:948396‑M2/1‑100 (MQ=255) cTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAAc > 1:2337271/1‑150 (MQ=255) cTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGGCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTGGCGGAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAAc > 1:1911501/1‑150 (MQ=255) agcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTgg < 2:290122‑M1/59‑1 (MQ=255) agcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTgg > 1:290122‑M1/50‑108 (MQ=255) taCGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgt < 1:996998‑M2/103‑7 (MQ=255) gCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctctc < 2:1147451/150‑1 (MQ=255) actagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGTCGCCGTCCTGTGGGa < 1:736094‑M1/61‑1 (MQ=255) actagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGa > 2:736094‑M1/38‑98 (MQ=255) cTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGAt > 1:2182424/1‑150 (MQ=255) ttGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcg < 1:120651‑M1/97‑40 (MQ=255) ttGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcg > 2:120651‑M1/1‑58 (MQ=255) ttGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGAtt > 1:1514317/1‑150 (MQ=255) ttGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGAtt > 2:277892/1‑150 (MQ=255) aaGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACa > 2:754603/1‑150 (MQ=255) gACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAgc > 1:419876/1‑150 (MQ=255) aCCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGcc < 1:795274/112‑1 (MQ=255) aCCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGcc > 2:795274/1‑112 (MQ=255) aCCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAgcg > 1:466741/1‑150 (MQ=255) ccaggggCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAgcgca > 1:2337148/4‑149 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCt > 2:1999779/1‑150 (MQ=255) gctgctGCCCAGCCCTTTTGCTACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGGGCGGCCTGGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATc < 1:78793/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCcg > 1:747663/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGTcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcct > 2:1346763‑M1/1‑39 (MQ=255) tgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcct < 1:1346763‑M1/69‑31 (MQ=255) gcgcAGCCCTTTTGCGACACACGGCAGCT‑ACACAACACGCGTCACTCTTTCCATATTGGCGCCTTTCTGTGTGTGCGGCCTTTTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTTATTTCTGCTTTGCAATCCGCTCa < 2:1674661/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCAtgc > 2:1617785/1‑150 (MQ=255) cTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACgg < 1:465921/108‑1 (MQ=255) cTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACgg > 2:465921/1‑108 (MQ=255) ttttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCg > 1:1888638/1‑150 (MQ=255) tGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTg < 2:747663/150‑1 (MQ=255) gCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccacttggctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccaggggcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaa > 1:1590926‑M1/1‑25 (MQ=255) | TCAGGGTGGGCCTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA‑GGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTG > NC_002947/1114726‑1115023 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |