New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1436018 = | 100 (1.130) | 8 (0.100) | 7/236 | NT | 8.3% | intergenic (‑48/+105) | PP_1256/PP_1257 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase/1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
? | NC_002947 | 1436109 = | 81 (0.970) | intergenic (‑139/+14) | PP_1256/PP_1257 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase/1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCG > NC_002947/1435870‑1436167 | ggCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGAccc < 2:1190573/150‑1 (MQ=255) cgacaccgagtacagcctgcacttcaacgagaccgacgtcctgaccgacgctcagcgcaactatgccgaacagcagtacgcgctgttccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctctccc > 1:2103244‑M1/148‑150 (MQ=255) gtCCAACGTCGGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCGCGGATGGGGTCCAGGCTGCAGGTTACGGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGGCTTGGAGGGGCTTGTAGCCTCCTTGGAACTCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCt < 2:850807/149‑1 (MQ=255) cTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCt > 1:973876/1‑150 (MQ=255) ccAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCCCGGTGGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGGGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGt < 1:503362/150‑1 (MQ=255) caccgactacagcctgcacttcaacgagaccgacgtcctgaccgacgctcagcgcaactatgccgaacagcagtacgcgctgttccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctctCCCTGt > 2:1298289‑M1/145‑150 (MQ=255) cAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTa > 2:1412574/1‑150 (MQ=255) cAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTa > 2:2276890/1‑150 (MQ=255) accgagtacagcctgcacttcaacgagaccgacgtcctgaccgacgctcagcgcaactatgccgaacagcagtacgcgctgttccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctcacccaggg < 1:573349‑M1/7‑5 (MQ=255) aaCGTCTGCCCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAg < 1:1152460/150‑1 (MQ=255) aaCGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAg < 1:983930/150‑1 (MQ=255) aaCGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAg < 2:411856/150‑1 (MQ=255) aaCGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAg < 2:1408065/150‑1 (MQ=255) tCTGGCCGGTGGTTGGGTCGATGGCACCGATGGCGTCGCGGCTTCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGc < 2:456894/150‑1 (MQ=255) gACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCggg > 1:1477782/1‑150 (MQ=255) aCCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGt < 2:808037/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGtt > 2:2036559/1‑150 (MQ=255) ccGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGtt > 1:1282297/1‑150 (MQ=255) 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cACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGt < 1:113702/120‑1 (MQ=255) cACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGt > 2:113702/1‑120 (MQ=255) cACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑Ga > 1:1753655/1‑150 (MQ=255) cGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAg < 2:696233/150‑1 (MQ=255) ggCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGt < 1:1768973/150‑1 (MQ=255) gTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGcc > 1:662207/1‑150 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(MQ=255) tCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGc > 1:889630/1‑108 (MQ=255) tCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGtttt < 1:696239/150‑1 (MQ=255) tAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGc < 1:681398/150‑1 (MQ=255) tAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACACCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGc < 1:279659/150‑1 (MQ=255) aaTGCAGCTGCCTGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGCAC‑CTGGCTGCCAGCGGCGCCTTGCACCGGGTCGCCTTCTTCGCGGGAACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCt < 1:1113234/150‑1 (MQ=255) aTGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaga > 2:1364439/1‑111 (MQ=255) aTGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaga < 1:1364439/111‑1 (MQ=255) aTGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAg > 1:604816/1‑150 (MQ=255) ggggggATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTg > 2:1075237/1‑150 (MQ=255) ggggggATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTg > 1:2183215/1‑150 (MQ=255) gggggATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGTTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTgg < 2:1511467/150‑1 (MQ=255) gggggATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTgg < 2:1753655/150‑1 (MQ=255) ggATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCAt > 1:298547/1‑150 (MQ=255) aTTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATAc > 1:834770/1‑150 (MQ=255) gACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCGCGTGGTGACCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCTGAGAAGCTGGCATACCAGCt > 1:1311909/1‑150 (MQ=25) gACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGC‑GAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCt > 2:2058578/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |