New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1452353 | 97 (1.100) | 7 (0.080) | 7/238 | NT | 6.6% | coding (508/1542 nt) | PP_1271 | putative Multidrug efflux MFS transporter |
? | NC_002947 | = 1452371 | 104 (1.230) | coding (526/1542 nt) | PP_1271 | putative Multidrug efflux MFS transporter |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCAAACAGTTC > NC_002947/1452209‑1452502 | gATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑c > 1:1828706/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑cgcc < 2:137335/150‑1 (MQ=255) gctgcGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑GGCCGCt > 1:2148035/1‑150 (MQ=255) ctgcGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTg > 1:1296727/1‑150 (MQ=255) gcgTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCgg < 1:595696/150‑1 (MQ=255) tACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCGGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTATGCCCTGACCGCCAGCTTTGGCCCCAACCTCGGGA‑CGCCGCTGGCggcgc > 2:451759/1‑147 (MQ=255) cTGCAGGGCTTTGACGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGggttg > 2:2243962‑M2/1‑145 (MQ=255) tGCATGGCGTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGCGTCTGCGTCGGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGACTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTtgt < 1:253433/150‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTtgt > 1:2114758/1‑150 (MQ=255) gCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCg > 2:632189/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGCAt < 1:451759/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAAt < 1:2057463/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGCATagg > 1:259378/1‑148 (MQ=255) ccGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACg > 2:1272854/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACg > 1:2018293/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGc < 2:919037/150‑1 (MQ=255) cTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGAAACAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCa > 1:58764/1‑150 (MQ=255) ccgccgATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTTTGTGGCAGTAAGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATgg < 2:1230916/150‑1 (MQ=255) ccgccgATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGggttg > 1:2131238‑M2/1‑118 (MQ=255) ccgccgATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGggttg < 2:2131238‑M2/123‑6 (MQ=255) ccgccgATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATgg < 2:2114758/150‑1 (MQ=255) ccgATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGCCCGAATACGTCGGTTGGCACTGGGCg > 2:1502455/1‑150 (MQ=255) aTGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTc < 1:1272854/150‑1 (MQ=255) gatgaGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCa > 2:394134/1‑150 (MQ=255) gCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCACGTATCAAGGTCTATGGCCTGCTGTAGGACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGatca < 2:61964/150‑1 (MQ=255) gTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGatcatc < 1:394134/150‑1 (MQ=255) ggCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCt > 2:1405306/1‑150 (MQ=255) ggCCCGGCGCTTGCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCt < 1:1023199/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCACCCTGCCCTc > 2:935643/1‑150 (MQ=255) gcgcTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGGGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTc > 2:350662/1‑150 (MQ=255) tttCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑gctg > 1:1603015/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCccgccagcggcgtgccgaggttgg < 1:737689‑M1/90‑25 (MQ=255) tGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCccgccagcggcgtgccgaggttgg > 2:737689‑M1/1‑66 (MQ=255) ccgccAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTTCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGcc > 2:621841/1‑150 (MQ=255) ccgccAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCCCGCCAGCGGCG‑TGCCGAggttggggccaaaggtggcggtca > 1:712245‑M2/1‑82 (MQ=255) ccgccAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCCCGCCAGCGGCG‑TGCCGAgggtggggccaaaggtggcggtca < 2:712245‑M2/106‑25 (MQ=255) ccAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGc > 1:2146035/1‑146 (MQ=255) ccAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATg < 1:543109/150‑1 (MQ=255) ccAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATg > 1:1117752/1‑150 (MQ=255) ccAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATg > 1:93915/1‑150 (MQ=255) cAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATgg < 2:1519003/150‑1 (MQ=255) aTCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGc < 2:1296727/150‑1 (MQ=255) cAAGGTCTATGCCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTgtgt > 1:249774/1‑150 (MQ=255) aGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGtt < 2:817374/93‑1 (MQ=255) aGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGtt > 1:817374/1‑93 (MQ=255) aGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGTAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAg > 2:2315621/1‑150 (MQ=255) ggTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCgg < 1:966533/68‑1 (MQ=255) ggTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTgg > 2:847970/1‑109 (MQ=255) ggTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTgg < 1:847970/109‑1 (MQ=255) ggcctggcctGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTggggg > 1:696260/1‑150 (MQ=255) gcctggcctgCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCACAACCccgccagcggcgtgccgaggttggggccaaaggt > 2:1794711‑M1/1‑42 (MQ=255) gcctggcctgCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCACAACCccgccagcggcgtgccgaggttggggccaaaggt < 1:1794711‑M1/76‑35 (MQ=255) ggcctgCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGcc > 2:770124/1‑150 (MQ=255) gcctgCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑Gctgctg > 1:1462674/1‑120 (MQ=255) gcctgCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCg > 1:362506/1‑150 (MQ=255) cctgCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGc > 1:1955926/1‑150 (MQ=255) tgCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGAcc > 1:1997831/1‑63 (MQ=255) tgCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGAcc < 2:1997831/63‑1 (MQ=255) tgCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGTAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAg < 1:2315621/150‑1 (MQ=255) tgCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTACCCTCGGCAGC‑GACCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAg > 2:1939612/1‑150 (MQ=255) tACGCCCTGCCCGCCACCTTTGGCCCCAACCCCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGTCCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGAAGATCATCCTGCCATC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGAGTGGGCTGGGGGCTGCCGCAGGAc > 1:705812/1‑150 (MQ=255) tACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGAc > 1:2242025/1‑150 (MQ=255) aCGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGc < 1:1572370/82‑1 (MQ=255) cGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGAccc > 2:2186805/1‑150 (MQ=255) gCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCg > 2:2223234/1‑150 (MQ=255) cccTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGc < 1:632189/150‑1 (MQ=255) ccTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCa < 2:473077/113‑1 (MQ=255) ccTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCt > 1:985179/1‑150 (MQ=255) tGACCGCCACCTTTGGCCCCACCCtcggcacgccgctggcggggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggccatagaccttgatacctggcgg < 2:712245‑M1/106‑83 (MQ=255) tGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCtcggcacgccgctggcggggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggccatagaccttgatacctggcgg > 1:712245‑M1/1‑24 (MQ=255) tGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTgc > 2:239147/1‑150 (MQ=255) tGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTgc < 2:624000/150‑1 (MQ=255) tGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATCGGCGTTCTGGCAGATCATCCTCCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTgc < 2:76751/150‑1 (MQ=255) aCCGCCACCTTTGGCCCCATCCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTgg > 1:1843167/1‑126 (MQ=255) ccGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGcc > 1:1052697/1‑150 (MQ=255) cGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGatcat > 1:1566710/1‑87 (MQ=255) cGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGatcat < 2:1566710/87‑1 (MQ=255) cGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGCATGGCGAGTCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCt > 2:2301680/1‑150 (MQ=255) cACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCGATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCGGGACCCGCTGCGCCgggg > 1:1081372/1‑149 (MQ=255) aCCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGggttgtggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggc < 1:1794711‑M2/76‑43 (MQ=255) aCCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGggttgtggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggc > 2:1794711‑M2/1‑34 (MQ=255) aCCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAg > 1:675068/1‑150 (MQ=255) cccAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggccatagaccttgatacctggcggcagaaagcgcagggccacgctcatcagcatcggcggcaaggcgccagcggcaaagccctgc < 1:445253‑M2/150‑126 (MQ=255) cccAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATTATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGCACCGCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCTTTTCaaa < 1:1939612/150‑1 (MQ=255) cccAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCt < 2:2009667/137‑1 (MQ=255) cccAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCaaa < 2:93915/150‑1 (MQ=255) cccAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCaaa > 1:458344/1‑150 (MQ=255) cccAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCaaa < 1:770124/150‑1 (MQ=255) cccAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGACGGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCaaa < 1:2301680/150‑1 (MQ=255) ccAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggccatagaccttgatacctggcggca > 2:737689‑M2/1‑24 (MQ=255) ccAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGt > 1:390914/1‑143 (MQ=255) ccAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGt < 2:390914/143‑1 (MQ=255) cAACCccgccagcggcgtgccgaggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggccatagaccttgatacctggcggcagaaagcgcagggccacgctcatcagcatcggcggcaaggcgccagcgtcaaagccctgcag > 2:2243962‑M1/1‑5 (MQ=255) cAACCccgccagcggcgtgccgaggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggccatagaccttgatacctggcggcagaaagcgcagggccacgctcatcagcatcggcggcaaggcgccagcggcaaagccctgcag > 2:727845‑M1/1‑5 (MQ=255) cAACCccgccagcggcgtgccgaggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggccatagaccttgatacctggcggcagaaagcgcagggccacgctcatcagcatcggcggcaaggcgccagcggcaaagccctgcag < 2:543109‑M1/150‑146 (MQ=255) cAACCccgccagcggcgtgccgaggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggccatagaccttgatacctggcggcagaaagcgcagggccacgctcatcagcatcggcgg < 2:2131238‑M1/123‑119 (MQ=255) cAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCAAACa > 2:1136405/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCAAACAGtt < 1:239147/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGCGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCAAACAGtt < 2:1117752/150‑1 (MQ=255) cTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGttt < 2:1836804/140‑1 (MQ=255) | CTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCA‑CGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTC‑GCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCAAACAGTTC > NC_002947/1452209‑1452502 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |