| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2033772 = | 12 (0.140) | 8 (0.090) | 8/238 | NT | 34.4% | coding (1210/1665 nt) | pgi‑I | glucose 6‑phosphate isomerase |
| ? | NC_002947 | 2033794 = | 19 (0.220) | coding (1232/1665 nt) | pgi‑I | glucose 6‑phosphate isomerase | |||||
CGGCAAGAGCGTGCTGCAAGACGGTACCCCGGTGAAGACCGACACCGGGCCGGTGATCTGGGGCGGCGTGGGCTGCAACGGCCAGCATGCCTACCACCAGTTGCTGCACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAG > NC_002947/2033645‑2033916 | aggcctttagcgcgcaattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCggt > 2:1138668‑M1/128‑150 (MQ=255) cctttagcgcgcaattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcacccCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCggtggt > 1:901153‑M1/125‑150 (MQ=255) gcgcaattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCgg > 1:1479633‑M1/117‑138 (MQ=255) gcgcaattcggcttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCgg < 2:1479633‑M1/22‑1 (MQ=255) cttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGc > 2:886945‑M1/106‑110 (MQ=255) cttcagcttcctcgcgggttttgcccagcatcagcgcctggctctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGc < 1:886945‑M1/5‑1 (MQ=255) tctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCggtg < 2:1466884‑M1/24‑1 (MQ=255) tctgcgacaggcagttggcgtacagccactggtggtggtcggccaccgggttgaagctcaccaCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCggtg > 1:1466884‑M1/64‑87 (MQ=255) ctgcACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGaa < 2:1533275/150‑1 (MQ=32) cccAGGGCACCCACTTGATTCCGGC‑CGACTCCACAGTGCCGGTGGCGAGCCTCACCCCGGTGGCCGCCCACCCCCAGTGGCTGTACCCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGACGCTCATGCTGGGCAACACCCGCGACGCAGCTGCAGCCg > 2:152473/2‑150 (MQ=11) cAGGGCACCCAGTTGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGaa < 2:1423968/150‑1 (MQ=32) gCACCCAGTTGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTgc < 2:1400955/150‑1 (MQ=32) gCACCCAGTTGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTgc > 2:865542/1‑150 (MQ=32) aCCCAGTTGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTgcgc > 2:1983606/1‑150 (MQ=32) ccAGTTGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTgcgcgc > 2:812213/1‑150 (MQ=32) ttGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTaaa < 2:1198245/150‑1 (MQ=32) ttGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTaaa > 1:1352432/1‑150 (MQ=32) ttGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTaaa < 1:245711/150‑1 (MQ=32) ttGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTaaa < 2:240352/150‑1 (MQ=32) ttGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGATaaa > 2:250893/1‑150 (MQ=17) tcaccaCCGGCACGATGAAATCG‑GCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGcc < 1:1947539‑M1/76‑1 (MQ=255) tcaccaCCGGCACGATGAAATCG‑GCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGcc > 2:1947539‑M1/7‑82 (MQ=255) tGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAg < 2:570262/150‑1 (MQ=32) tGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAg < 1:1983606/150‑1 (MQ=32) | CGGCAAGAGCGTGCTGCAAGACGGTACCCCGGTGAAGACCGACACCGGGCCGGTGATCTGGGGCGGCGTGGGCTGCAACGGCCAGCATGCCTACCACCAGTTGCTGCACCAGGGCACCCAGTTGATTCCGGC‑CGATTTCATCGTGCCGGTGGTGAGCTTCAACCCGGTGGCCGACCACCACCAGTGGCTGTACGCCAACTGCCTGTCGCAGAGCCAGGCGCTGATGCTGGGCAAAACCCGCGAGGAAGCTGAAGCCGAATTGCGCGCTAAAG > NC_002947/2033645‑2033916 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |