| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2798676 = | 74 (0.840) | 7 (0.080) | 6/232 | NT | 9.3% | coding (105/693 nt) | endX | extracellular DNA endonuclease |
| ? | NC_002947 | 2798707 = | 68 (0.820) | coding (74/693 nt) | endX | extracellular DNA endonuclease | |||||
ATCTGCCAGGCGGGTACGATGTGCTCCCACTCGATGCGTGACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACA > NC_002947/2798527‑2798823 | aacgtcaccctcgcccatcgcgacgatggcggtgtgcagattttctggacgataccgaaggaagattgactgcgcatgagagtttcgcttttcgcagcagcctgcctgttactgaccactccgcttgctcaagccgacgccccgcgcacc > 1:1959708‑M1/150‑150 (MQ=255) gtcaccctcgcccatcgcgacgatggcggtgtgcagattttctggacgataccgaaggaagattgactgcgcatgagagtttcgcttttcgcagcagcctgcctgttactgaccactccgcttgctcaagccgacgccccgcgcacCTTc < 2:1548527‑M1/4‑1 (MQ=255) gCCAGGCGGGTACGATGTGCTCCCACTCGATGCGTGACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTcc > 2:469067/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGGTACGATGTGCTCCCACTCGATGCGTGACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCa > 1:1414744/1‑150 (MQ=255) caccctcgcccatcgcgacgatggcggtgtgcagattttctggacgataccgaaggaagattgactgcgcatgagagtttcgcttttcgcagcagcctgcctgttactgaccactccgcttgctcaagccgacgccccgcgcacCTTCCa > 1:832939‑M1/145‑150 (MQ=255) cAGGCGGGTACGATGTGCTCCCACTCGATGCGTGACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAg < 2:659596/150‑1 (MQ=255) cctcgcccatcgcgacgatggcggtgtgcagattttctggacgataccgaaggaagattgactgcgcatgagagtttcgcttttcgcagcagcctgcctgttactgaccactccgcttgctcaagccgacgccccgcgcacCTTCCAGGc < 1:586225‑M1/9‑1 (MQ=255) gTACGATGTGCTCCCACTCGATGCGTGACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACct > 1:894632/1‑150 (MQ=255) tACGATGTGCTCCCACTCGATGCGTGACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACctt > 2:1740234/1‑150 (MQ=255) aTGTGCTCCCACTCGATGCGTGACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTg < 2:894632/150‑1 (MQ=255) cccACTCGATGCGTGACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGcctcct < 2:2062244/150‑1 (MQ=255) ccACTCGATGCGTGACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTg > 2:269143/1‑150 (MQ=255) tCGATGCGTGACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAg < 1:269143/150‑1 (MQ=255) ggtgtgcagattttctggacgataccgaaggaagattgactgcgcatgagagtttcgcttttcgcagcagcctgcctgttactgaccactacgcttgctcaagccgacgccccgcgcacCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAg > 2:639857‑M1/120‑150 (MQ=255) tGCGTGACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCATTGTATTTACAGCTGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTgc < 2:79685/150‑1 (MQ=255) gTGACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGcgcg > 1:1189482/1‑150 (MQ=255) gACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCggg < 2:1189482/150‑1 (MQ=255) gACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCggg < 1:819675/150‑1 (MQ=255) tttctggacgataccgaaggaagattgactgcgcatgagagtttcgcttttcgcagcagcctgcctgttactgaccactccgcttgctcaagccgacgccccgcgcacCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGc > 2:586225‑M1/109‑150 (MQ=255) cgcgcgCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGc < 1:2132384/150‑1 (MQ=255) cgcgcgCTGGGCATGCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGc < 2:2246874/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACctt > 1:1018399/1‑120 (MQ=255) gcgcTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACctt < 2:1018399/120‑1 (MQ=255) tGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCt < 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aagccgacgccccgcgcagCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTAATAAGTAGAAGGCAGACTAGTTCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCg < 1:1106481‑M1/131‑1 (MQ=255) aTTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTcc > 1:38981/1‑150 (MQ=255) tggtgCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGc > 2:2005935/1‑60 (MQ=255) tggtgCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGc < 1:2005935/60‑1 (MQ=255) tggtgCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGaa > 2:1795089/1‑150 (MQ=255) ggtgCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTc > 1:1527764/1‑144 (MQ=255) ggtgCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTc < 2:1527764/144‑1 (MQ=255) gtgCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTc > 1:1392523/1‑123 (MQ=255) gtgCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTc < 2:1392523/123‑1 (MQ=255) gCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATc > 1:1055705/1‑150 (MQ=255) aTAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTg < 1:469067/150‑1 (MQ=255) gagCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAAcaggca < 2:1017061/81‑1 (MQ=255) gagCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAAcaggca > 1:1017061/1‑81 (MQ=255) agCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGcaca > 1:1548527/1‑150 (MQ=255) CTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCt < 1:1189164‑M1/143‑1 (MQ=255) CTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCt > 2:1189164‑M1/1‑143 (MQ=255) | ATCTGCCAGGCGGGTACGATGTGCTCCCACTCGATGCGTGACGCGCGCTGGGCATTCTTGCGTGGGGCATAGCCGCAGGAGGCCAGGTTGACCTTGTTGCCCTTGTATTTACAGCCGCAATAAAACTCGGTCGATTGTGGTGCATAGAGCTTCCAGGCGACCTTCTTGGCCTCCTGGAAGGTGCGCGGGGCGTCGGCTTGAGCAAGCGGAGTGGTCAGTAACAGGCAGGCTGCTGCGAAAAGCGAAACTCTCATGCGCAGTCAATCTTCCTTCGGTATCGTCCAGAAAATCTGCACA > NC_002947/2798527‑2798823 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |