| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4586100 | 7 (0.080) | 10 (0.160) | 10/172 | NT | 51.5% | intergenic (+139/+78) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
| ? | NC_002947 | = 4586128 | 14 (0.230) | intergenic (+167/+50) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCG > NC_002947/4585951‑4586247 | gttttgtcgacgagtacccgatgaccgtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAggg > 1:1551057‑M1/113‑150 (MQ=255) aaGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgc > 1:1857887‑M1/1‑148 (MQ=255) ttAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgc > 1:1362505‑M1/1‑143 (MQ=255) gacgagtacccgatgaccgtgaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGcc < 1:666326‑M1/46‑1 (MQ=255) aaGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCg < 2:1558173/150‑1 (MQ=255) aGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCgg < 2:1554130/150‑1 (MQ=255) tAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCtt < 1:367883/150‑1 (MQ=255) cggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGcccc > 1:2096446‑M1/82‑150 (MQ=255) tcaacaGCTGATCTGCGCTGCTCGATCGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccct < 2:456923‑M1/148‑33 (MQ=255) aaCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGAAGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctgg < 2:1348840‑M2/150‑7 (MQ=255) aCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggt < 1:594528‑M1/150‑36 (MQ=255) cAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggta < 2:1362505‑M1/150‑37 (MQ=255) aggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTa > 1:1093036‑M1/77‑150 (MQ=255) aggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTa > 2:666326‑M1/77‑150 (MQ=255) ggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAg > 1:998980‑M1/76‑150 (MQ=255) aGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAACGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTACTACAAGGGACCATGCCGTTTGTGTTTGC‑GGTGGTGCcccgggtag > 2:1552066‑M2/1‑141 (MQ=255) aGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGACGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGCACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtag > 1:1132353‑M2/1‑141 (MQ=255) cTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtagga < 2:695747‑M1/150‑40 (MQ=255) cTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtagga > 2:1761452‑M2/1‑139 (MQ=255) gcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTa > 1:1824643‑M1/73‑146 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgg < 1:1143140‑M1/150‑44 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgg > 1:1348840‑M2/1‑135 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgg > 2:1854531‑M2/1‑135 (MQ=255) gaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGCACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg > 1:878371‑M1/70‑150 (MQ=255) cTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcggg > 2:1476350‑M2/1‑134 (MQ=255) gcgcTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCCG‑CATTCAAGGCCGGCACGGTccctggtaggagcgggtt > 2:1857887‑M2/1‑132 (MQ=255) gctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggtttaccc > 1:1123598‑M2/1‑127 (MQ=255) ctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTTGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggta < 1:660873‑M1/134‑37 (MQ=255) ctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTTGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggta > 2:660873‑M1/1‑98 (MQ=255) tctgaAATGTTTAGTATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGCCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaa > 2:1125951‑M2/3‑122 (MQ=255) gAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagag > 1:819747‑M2/1‑119 (MQ=255) aaaGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgg > 1:506348‑M2/1‑118 (MQ=255) ggTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTTCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggt > 2:1791914‑M2/1‑115 (MQ=255) gggTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcg > 2:358220‑M2/1‑101 (MQ=255) gggTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcg < 1:358220‑M2/115‑15 (MQ=255) cTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATgc‑g < 2:259088/89‑1 (MQ=255) cTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATgc‑g > 1:259088/1‑89 (MQ=255) tGGCAAGGTGAAGATCTTGCGTTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctg > 1:1485105‑M2/1‑94 (MQ=255) gATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaa < 2:876194‑M2/110‑29 (MQ=255) gATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaa > 1:876194‑M2/1‑82 (MQ=255) gccggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtag < 1:665821‑M2/74‑10 (MQ=255) tctcttCACGGCTAAACCCCCTCCTACCACGTacaccgccgcattcaatgcccgcacggtcccttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggccctatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaaccttt < 1:1125951‑M1/149‑119 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttc > 1:819747‑M1/1‑31 (MQ=255) TCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCa < 1:1735340‑M1/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaagggcggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatactaaacatttcaga > 2:1125951‑M1/1‑28 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatc < 2:876194‑M1/110‑83 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatg < 2:819747‑M1/150‑124 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGGACGCATTGCCAGC‑CGCGGGAGGGCTGGTAGGAGAGGGTGATCTTGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCGGCCACACTGATCTCACGCAt > 1:988828/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtag < 2:741884‑M2/62‑10 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtag > 1:741884‑M2/1‑53 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagc > 1:1123598‑M1/1‑23 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtagg < 2:500457‑M1/59‑39 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtagg > 1:500457‑M1/1‑21 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACCAGGGaccgtgccggccttgaatgcggcgctgcccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgc > 2:1857887‑M1/1‑18 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgca > 2:735404‑M1/1‑17 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggaacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacc < 1:1791914‑M1/132‑116 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggaacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacc > 2:1791914‑M1/1‑17 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccct < 1:930126‑M2/49‑5 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccct > 2:930126‑M2/1‑45 (MQ=255) cccGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcag > 2:1476350‑M1/1‑16 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcaga > 1:1348840‑M1/1‑15 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcaga > 2:1854531‑M1/1‑15 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaaccttt < 2:506348‑M1/133‑119 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaaccttt > 1:506348‑M1/1‑15 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcaga < 1:1143140‑M2/150‑108 (MQ=255) CCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAAtctc > 2:2304950‑M1/1‑119 (MQ=255) CCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTc < 2:1979724‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTc < 1:709952‑M1/150‑1 (MQ=255) cGCTCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcaccc < 1:358220‑M1/115‑102 (MQ=255) cTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcagatca < 1:1701884‑M2/150‑111 (MQ=255) tCCTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcagatcag > 2:1761452‑M1/1‑11 (MQ=255) tCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcagatcag < 2:695747‑M2/150‑112 (MQ=255) ccTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggtttac > 1:500457‑M2/1‑38 (MQ=255) ccTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggtttac < 2:500457‑M2/59‑22 (MQ=255) cTACCCGGGgcaccaccgcaaacacaaacggcatggtcccttgtagtagcgggtttacccgcgaataggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaaccgttcaatggagcagcgcagatcagct > 2:1552066‑M1/1‑9 (MQ=255) cTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtgcgtggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcgtcaacctttcaatggagcagcgcagatcagct > 1:1132353‑M1/1‑9 (MQ=255) cTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggc < 1:665821‑M1/74‑66 (MQ=255) cTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggc > 2:665821‑M1/1‑9 (MQ=255) cTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgc > 1:741884‑M1/1‑9 (MQ=255) cTACCAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgc < 2:741884‑M1/62‑54 (MQ=255) CTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAAcc < 2:594055‑M1/92‑1 (MQ=255) CTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAAcc > 1:594055‑M1/1‑92 (MQ=255) CTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCAcc < 2:370037‑M1/150‑1 (MQ=255) tACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcagatcagctg < 2:1362505‑M2/150‑115 (MQ=255) tACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgcaaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggag > 2:660873‑M2/1‑36 (MQ=255) TACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCt > 2:485050‑M1/1‑144 (MQ=255) TACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCt < 2:452756‑M1/150‑1 (MQ=255) TACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCt < 1:1709765‑M1/150‑1 (MQ=255) TACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCt < 2:2255106‑M1/150‑1 (MQ=255) aCCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcatcctcaacctttcaatggagcagcgcagatcagctgt < 1:594528‑M2/150‑116 (MQ=255) ACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCtt < 2:801414‑M1/150‑1 (MQ=255) ccAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaatgcaagatcttcaccttgccaagcacccggtcttcctcaacctttcaatggagcagcgcagatcagctgtt < 2:1348840‑M1/150‑145 (MQ=255) cAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaacgcaagatcttcaccttgcca > 1:1485105‑M1/1‑5 (MQ=255) cAGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcccgatcaacgcaagatcttcaccttgcca < 2:1485105‑M1/99‑95 (MQ=255) CAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGc < 1:1605744‑M1/150‑1 (MQ=255) aGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggt > 2:930126‑M1/1‑4 (MQ=255) aGGGgcagcgccgcattcaaggccggcacggtccctggtaggagcgggt < 1:930126‑M1/49‑46 (MQ=255) AGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAg < 1:1418618‑M1/77‑1 (MQ=255) AGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAg > 2:1418771‑M1/1‑77 (MQ=255) GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCg > 1:1979724‑M1/1‑150 (MQ=255) | TGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATGC‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCG > NC_002947/4585951‑4586247 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |