| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 4755172 = | 102 (1.160) | 5 (0.060) | 5/230 | NT | 5.1% | coding (368/1965 nt) | pvdT | pyoverdine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| ? | NC_002947 | 4755215 = | 91 (1.110) | coding (411/1965 nt) | pvdT | pyoverdine ABC transporter ATP‑binding protein/permease | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CGTTGCCGAGCTGGACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAA > NC_002947/4755023‑4755320 | ccatcacctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgg < 2:218469‑M1/1‑1 (MQ=255) ggggCCGAGCTGGACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGAGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCAGGCTCAGCCCATGGAAACGTCGGGATGCCATGCAGCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGc > 1:2089471/4‑150 (MQ=255) gTTGCCGAGCTGGACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGc < 1:1434647/150‑1 (MQ=255) catcacctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGc > 1:2006536‑M1/149‑150 (MQ=255) cctctgcgccgctatggctgttgagggcgcccgtttgttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGc > 2:1760555‑M1/144‑150 (MQ=255) ctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGcc < 1:1986847‑M1/8‑1 (MQ=255) ctcggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGcc < 1:1578265‑M1/8‑1 (MQ=255) ggcgccgctatggctgtcgagggcgccggttggttcgtcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGCCcgc < 1:626946‑M1/11‑1 (MQ=255) cTGAACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGACCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCAAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCcgc < 1:1336299/150‑1 (MQ=255) ggACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCgcgc < 1:510691/150‑1 (MQ=255) gacgaACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGcc > 2:1224126/1‑150 (MQ=255) gacgaACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGCGCTACGACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGcc > 1:1334313/1‑150 (MQ=255) acgaACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGccc < 1:1389482/150‑1 (MQ=255) gaACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTg > 2:1986847/1‑150 (MQ=255) ctggcctggcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTc < 1:1754076/150‑1 (MQ=255) ggcctggcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCgg < 1:1256387/150‑1 (MQ=255) tggcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAg < 1:2328477/123‑1 (MQ=255) ggcTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGgccgcc < 1:1074846/150‑1 (MQ=255) 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gcgAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCgcctgggcctgg > 1:576873/1‑150 (MQ=255) cgAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGATCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCTCCTGGGCCTGGc > 1:479463/1‑150 (MQ=255) aGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCa < 1:1320188/150‑1 (MQ=255) tcggccaggatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGGTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGcc > 2:626946‑M1/103‑150 (MQ=255) gatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCgcctgggcc > 2:459543‑M1/95‑133 (MQ=255) gatgatgtggccaccgttcatcaaggcccgggcaatcgagacccgttgctgctggccaccggataattgatgcggacggttggcggtgcggctgGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCgcctgggcc < 1:459543‑M1/39‑1 (MQ=255) cAGGCCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGCACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCTTGGCCAGCCGCACCGCCAACCCTCCg > 2:1156761/1‑150 (MQ=255) aGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGc > 1:51209/1‑150 (MQ=255) ggCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCAt > 1:2318765/1‑150 (MQ=255) cTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCa > 1:1492895/1‑150 (MQ=255) 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agccaTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtgat < 1:1224126/150‑1 (MQ=255) agccaTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtgat < 2:1285981/150‑1 (MQ=255) agccaTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtgat > 1:218469/1‑150 (MQ=255) gccaTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtgatg < 2:576873/150‑1 (MQ=255) ccaTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtgatga > 1:1743946/1‑150 (MQ=255) aTCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAAc < 2:1991818/150‑1 (MQ=255) aCGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGTCGTTGATGAACGGTg < 2:2089471/150‑1 (MQ=255) aCGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtgat < 2:2224685/142‑1 (MQ=255) aCGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTtgat > 1:2224685/1‑142 (MQ=255) aCGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTg < 2:1743946/150‑1 (MQ=255) cGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTgg < 1:2057005/150‑1 (MQ=255) gCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGc < 1:1068224/150‑1 (MQ=255) gCCGGTACCCCAGCCGCCGAACACCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCACGGCCGCCTGGGCCTGGCCAACCGCACCGCCAACCGTACGAATCAATTATCCGGTGGACAGCAACAACGAGACTCGATTGCCCAGGACTTGATGAACGGTGGc > 2:155333/1‑150 (MQ=255) cGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGCGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCca > 2:1379786/1‑150 (MQ=255) ccccAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCAcatca > 1:226214/1‑150 (MQ=255) aGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCTGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCt > 1:52564/1‑150 (MQ=255) aGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGTCACATCATCCt < 2:2254317/150‑1 (MQ=255) gccgccGAACGCCAGGCCCGGGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTg < 1:1287968/150‑1 (MQ=255) gccgccGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTg < 1:423299/150‑1 (MQ=255) ccgccgAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAAc > 1:99941/1‑102 (MQ=255) ccgccgAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGCCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTgg < 2:2177646/150‑1 (MQ=255) cgccgAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTggt < 2:1876367/150‑2 (MQ=255) ccgAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCCACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCcg > 1:782848/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCcgacga < 2:285463/150‑1 (MQ=255) cGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGaa < 1:2190952/150‑1 (MQ=255) | CGTTGCCGAGCTGGACAGCGACGAACTGGCCTGGCTGCGCCGCGAGGCCTTCGGGTTCGTGTTCCAGGGCTACCACCTGATCCCCTCCGGCTCAGCCCAGGAAAACGTCGAGATGCCAGCCATCTACGCCGGTACCCCAGCCGCCGAACGCCAGGCCCGCGCCAGCGCCCTGCTCGGCCGCCTGGGCCTGGCCAGCCGCACCGCCAACCGTCCGCATCAATTATCCGGTGGCCAGCAGCAACGGGTCTCGATTGCCCGGGCCTTGATGAACGGTGGCCACATCATCCTGGCCGACGAA > NC_002947/4755023‑4755320 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |