| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 5731921 = | 98 (1.110) | 9 (0.110) | 7/234 | NT | 8.9% | coding (691/1206 nt) | hutI | imidazolonepropionase |
| ? | NC_002947 | 5731965 = | 91 (1.090) | coding (647/1206 nt) | hutI | imidazolonepropionase | |||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
CAGCACGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGATGTAGTCGTCG > NC_002947/5731772‑5732069 | cagcaCGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAg > 1:656236/1‑150 (MQ=255)cagcaCGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAg < 1:17300/150‑1 (MQ=255) gcctggcggcgcacgctttgcccccggagtacgcgggtcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccgg < 2:351975‑M1/2‑1 (MQ=255) tggcggcgcacgctttgcccccggagtacgcgggtcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGccc > 1:533976‑M1/146‑150 (MQ=255) tcGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGccc > 2:393443/2‑150 (MQ=255) cGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGtt < 1:843262/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTcgcgc < 1:542593/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTcgcgc > 1:1739691/1‑150 (MQ=255) 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cccccggagtacgcgggtcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccg < 1:1958409‑M1/1‑1 (MQ=255) ttGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTtgatga > 2:2293119/1‑150 (MQ=255) ccggagtacgcgggtcgggccgacgactacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgccGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGaa < 1:1283716‑M1/25‑1 (MQ=255) ccATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACa > 2:238413/1‑150 (MQ=255) cATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAg < 1:273734/150‑1 (MQ=255) 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tacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgccggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgcaGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGc < 1:262851‑M1/32‑1 (MQ=255) tacatcgcgcacatctgtgacgagatgttgacggccttggccggcgaaggcctggtggatgcggtggatgccttctgcgaacacctcgcgttctcgcaGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGc > 2:262851‑M1/99‑130 (MQ=255) aTGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCATGCGTGAGCCGTGCCACGATGGCTGGAGTTAGGCCTATTGCCTGACCGTCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGATCGACCTGCGCCTGCGAGCAc > 1:166153/1‑150 (MQ=255) aCTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGa < 1:817539/150‑1 (MQ=255) tCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAgg > 1:2142655/1‑150 (MQ=255) 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1:573064/150‑1 (MQ=255) gATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAAc < 2:907204/150‑1 (MQ=255) cAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACAtctc < 1:2122197/150‑1 (MQ=255) cAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACAtctc < 2:1514296/150‑1 (MQ=255) aGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGa > 1:1000790/1‑85 (MQ=255) aGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGa < 2:1000790/85‑1 (MQ=255) ttgttCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGgcatccac < 2:214952/105‑1 (MQ=255) cGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCgag < 1:57676/71‑1 (MQ=255) cGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCgag > 2:57676/1‑71 (MQ=255) ggCATGCAGCTTGCCCGGCCGGCCCAGCTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGAt < 2:122064/150‑1 (MQ=255) ggCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGAt < 2:639371/150‑1 (MQ=255) gCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTc > 1:1189931/1‑83 (MQ=255) gCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTc < 2:1189931/83‑1 (MQ=255) gCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGAtg > 1:1337875/1‑150 (MQ=255) cATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGAtgt < 2:656236/150‑1 (MQ=255) aTGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGAtgtg > 1:1387577/1‑150 (MQ=255) gCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTtcg > 2:1554979/1‑150 (MQ=255) gCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGa < 1:2081973/150‑1 (MQ=255) ccGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGGGATGTAgt > 1:1015072/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACAtctc > 2:18173/1‑124 (MQ=255) cAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGATGTAgtcgtc < 2:1176821/150‑1 (MQ=255) aGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGGGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGATGTAGtcgtcg < 2:2132888/150‑1 (MQ=255) aGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGAt > 1:101432/1‑140 (MQ=255) aGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGATGTAGtcgtcg < 1:493173/150‑1 (MQ=255) | CAGCACGGCGACCGTGCCGGCGCTTGCCATGGCCACGGCGTCTTCCTCTGTCATGAACTCCAGATGGTCAGCCGACAGTGCCTGGTAACGCGCGGCCAGGCTTGAGCCGTGCAACGATGACAGTTGTTCGGCATGCAGCTTGACCGGCAGGCCCAGTTCGCGCGCCTTGATGAACAGCCGCTCGACCTGGGCCGGCGAGAACGCGAGGTGTTCGCAGAAGGCATCCACCGCATCCACCAGGCCTTCGCCGGCCAAGGCCGGCAACATCTCGTCACAGATGTGCGCGATGTAGTCGTCG > NC_002947/5731772‑5732069 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |