| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5816927 | 53 (0.600) | 12 (0.160) | 8/212 | NT | 18.6% | intergenic (+57/+72) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein |
| ? | NC_002947 | = 5816954 | 60 (0.800) | intergenic (+84/+45) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCC > NC_002947/5816782‑5817071 | ccTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAgcgc < 2:2636/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCATTCGCGGGCACGGCCGCTCCCACAGTTAgcgct > 2:1085933/1‑149 (MQ=255) ttGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGt > 1:179887/1‑150 (MQ=255) cAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGctc < 1:459299/150‑1 (MQ=255) ttcagtgatgcagggcggggcggcggaggggatgctgacgatggagggggcgttgcggaggctgagggagcgagggttgatcaaaggcttgtagtacctgcaaaggccctttcgcgggcgCGCCCGCTCCCACAGGTAgcgc < 1:106053‑M1/22‑1 (MQ=255) cTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgcg > 2:1497025/1‑150 (MQ=255) tgcagggcggggcggcggaggggatgctgacgatggagggggcgttgcggaggctgagggagcgagggttgatcaaaggcttgtagtacctgcaaaggccccttcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCa < 2:1537263‑M1/38‑1 (MQ=255) cTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCa < 1:25956/150‑1 (MQ=255) gCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCt > 1:829165/1‑150 (MQ=255) gCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCACGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCt > 1:58715/1‑150 (MQ=255) agggcggggcggcggaggggatgctgacgatggagggggcgttgcggaggctgagggagcgagggttgatcaaaggcttgtagtacctgcaaaggccctttcgcgggcgCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCt < 2:1769973‑M1/41‑1 (MQ=255) aGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgc < 2:588308‑M1/150‑26 (MQ=255) aGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgc > 2:227721‑M1/1‑125 (MQ=255) aCTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTcac > 1:226696/1‑145 (MQ=255) aCTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA > 2:912442‑M1/1‑119 (MQ=255) aCTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTA < 1:912442‑M1/119‑1 (MQ=255) cTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgc > 2:1355899/1‑133 (MQ=255) tACGTGGTGGCCAAGCGG‑TGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACACCTACCCCGTCGCTCCCACCCGCAGCTCACCtacctct < 2:595616‑M2/150‑8 (MQ=255) gcggaggggatgctgacgatggagggggcgttgcggaggctgagggagcgagggttgatcaaaggcttgtagtacctgcaaaggccctttcgcgggcgCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgt > 1:1769973‑M1/99‑150 (MQ=255) gcggaggggatgctgacgatggagggggcgttgcggaggctgagggagcgagggttgatcaaaggcttgtagtacctgcaaaggccctttcgcgggcgCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgt > 2:1110909‑M1/99‑150 (MQ=255) aCGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgt < 2:277895‑M1/150‑35 (MQ=255) aCGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgt > 1:1085933‑M2/1‑143 (MQ=255) gtggtgGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgg < 1:37379‑M1/150‑37 (MQ=255) gtggtgGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgg > 1:1497025‑M2/1‑141 (MQ=255) ggaggggatgctgacgatggagggggcgttgcggaggctgagggagcgagggttgatcaaaggcttgtagtacctgcaaaggccccttcgcgggcaCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTgg > 1:1537263‑M1/97‑150 (MQ=255) ggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtggga < 1:333627‑M2/150‑12 (MQ=255) ggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtggga > 1:656050‑M2/1‑139 (MQ=255) tggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagc < 1:227721‑M1/150‑41 (MQ=255) gCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGCCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAcacctgtggcagcgg < 1:290742‑M2/150‑16 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCTTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacct > 2:1455491‑M1/1‑105 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCTTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacct < 1:1455491‑M1/137‑33 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcg < 2:1891260‑M2/150‑19 (MQ=255) gTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgt > 1:2114554‑M2/1‑126 (MQ=255) gctgcCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcgcg > 1:1420559/1‑150 (MQ=255) tgcCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGaa > 1:269544/1‑150 (MQ=255) gcCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGACGCTCAGATGCCGGTGTGAGCGGGGGGGCCCGCGaaa > 1:515588/1‑150 (MQ=255) ccGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAg < 2:783156/150‑1 (MQ=255) aaaGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGc > 1:906798/1‑150 (MQ=255) agagCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCTTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccg < 2:1858522‑M1/150‑63 (MQ=255) gagCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCtt > 1:704066/1‑150 (MQ=255) gcagcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTg > 2:1020909/1‑150 (MQ=255) agcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCa < 2:333627/150‑1 (MQ=255) gcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAg < 1:1020909/150‑1 (MQ=255) gctgagggagcgagggttgatcaaaggcttgtagtacctgcaaaggccctttcgcgggcgCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgtg > 2:365032‑M1/61‑113 (MQ=255) gctgagggagcgagggttgatcaaaggcttgtagtacctgcaaaggccctttcgcgggcgCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgtg < 1:365032‑M1/53‑1 (MQ=255) 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GCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAgcc < 2:1924125‑M1/150‑2 (MQ=255) ccGCTGCCACAGGTGtgtgagctgcgcgcgagagcggcgcgctacctgtgggagcgggcgggcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggc < 1:290742‑M1/150‑136 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggc > 2:829165‑M1/1‑15 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctcttt > 1:1477713‑M2/1‑42 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctcttt < 2:1477713‑M2/132‑91 (MQ=255) gCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggcca < 1:227721‑M2/150‑111 (MQ=255) GCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCATCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATccc < 1:1928473‑M1/150‑1 (MQ=255) GCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGAGCTCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATccc > 1:1172297‑M1/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccacc > 1:656050‑M1/1‑11 (MQ=255) TCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCt < 1:831499‑M1/150‑1 (MQ=255) ccACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccac > 1:1497025‑M1/1‑9 (MQ=255) ccACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccac < 1:37379‑M2/150‑115 (MQ=255) agaggtaggtgagctgcgggtgggagcgacggggtaggtgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcaccgcttggccaccacgta < 2:595616‑M1/148‑144 (MQ=255) acaGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcac < 2:2114554‑M1/133‑127 (MQ=255) acaGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtacc < 1:2147733‑M1/74‑68 (MQ=255) acaGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtacc > 2:2147733‑M1/1‑7 (MQ=255) acaGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggcca > 2:2187284‑M2/1‑34 (MQ=255) ACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCaa > 1:873185‑M1/1‑120 (MQ=255) ACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCaa < 2:873185‑M1/120‑1 (MQ=255) CAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccgcc < 2:864918‑M1/150‑1 (MQ=255) aGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaagggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgctt < 1:1455491‑M2/137‑106 (MQ=255) aGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaagggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgctt > 2:1455491‑M2/1‑32 (MQ=255) | CCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCC > NC_002947/5816782‑5817071 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |