| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 6013891 | 44 (0.500) | 9 (0.130) | 9/194 | NT | 21.1% | intergenic (+40/+70) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| ? | NC_002947 | = 6013919 | 33 (0.480) | intergenic (+68/+42) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
AGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTG > NC_002947/6013742‑6014038 | agaAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGT < 1:1901606‑M1/150‑1 (MQ=255) aGTCGTTCCGCGGCGACCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTgca < 2:1226871/150‑1 (MQ=255) tCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGCATGATCGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTGCAGCACAg < 1:1227752/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTacggcacagcg > 2:702431‑M1/1‑139 (MQ=255) cAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTGCAGCACAG‑Gt > 1:2176981/1‑150 (MQ=255) aGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTGCAGCACAG‑Gtc < 1:1119164/150‑1 (MQ=255) cGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGc < 1:740682/150‑1 (MQ=255) gCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCtgt < 1:1022443/150‑1 (MQ=255) cGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTacgg < 2:2297080‑M1/129‑5 (MQ=255) cGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTacgg > 1:2297080‑M1/1‑125 (MQ=255) cGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGc > 2:1757348/1‑150 (MQ=255) gAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTgcagcacagcgttcgagacctgtgct < 1:7262‑M1/150‑27 (MQ=255) gAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGcc < 1:1044941/150‑1 (MQ=255) tGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTac > 1:1098415‑M2/1‑148 (MQ=255) tGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTGCAGCACAG‑CCCTCGAACGCTGTGCCGTac > 1:1833922‑M2/1‑148 (MQ=255) gACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacct < 2:1233331‑M1/150‑33 (MQ=255) aGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtg < 1:876816‑M1/150‑36 (MQ=255) aGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtg < 1:702431‑M1/150‑36 (MQ=255) 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(MQ=255) cacaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCCTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCa > 1:675168/1‑150 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttc < 2:1083684‑M2/104‑71 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttc > 1:1083684‑M2/1‑34 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCaa > 1:1995733/1‑150 (MQ=255) aGGTGCAGCACAG‑GTCTCGCACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGACTGCCTGCGAATGTCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt < 1:512652/150‑1 (MQ=255) aGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtc < 2:1233331‑M2/150‑119 (MQ=255) gTacggcacagcgttcgagggctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtcca > 1:1833922‑M1/1‑2 (MQ=255) gTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtcca > 1:704553‑M1/1‑2 (MQ=255) gTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaacgcggtaaccctggctgtcca > 1:1098415‑M1/1‑2 (MQ=255) gTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaac < 2:73731‑M1/130‑129 (MQ=255) gTacggcacagcgttcgagacctgtgctgcacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattcgatgaagctgaccacaccaccttccagcgacttcacccgggccagcgattcaac > 1:73731‑M1/1‑2 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattc > 1:807462‑M2/1‑30 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagcaggtgtcgcgtttattc < 2:807462‑M2/76‑47 (MQ=255) gTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaa < 1:1343190/98‑1 (MQ=255) | AGAAGTCGTTCCAGGGCGGCCGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCG‑CTCCCACAGGTGCAGCACAG‑GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTG > NC_002947/6013742‑6014038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |