| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 608667 | 78 (0.880) | 5 (0.060) | 5/238 | NT | 6.1% | coding (535/813 nt) | PP_0524 | cobalamin‑binding protein HutB |
| ? | NC_002947 | = 608679 | 79 (0.930) | coding (547/813 nt) | PP_0524 | cobalamin‑binding protein HutB | |||||
ATACGCGCGAGCCCTGCGTGAGCGGCTGCAGCAGCTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCT > NC_002947/608531‑608828 | aTACGCGCGAGCCCTGCGTGAGCGGCTGCAGCAGCTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATAACGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGg < 1:1898789‑M2/150‑2 (MQ=255) tACGCGCGAGCCCTGCGTGAGCGGCTGCAGCAGCTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGgg > 1:1923870‑M2/1‑148 (MQ=255) ggcgcgccAGCCCTTCGTGAGCTGCTGGAGAGGCTGGGCCAGAGCAATGAGGGTGATGATCCCGGCCGCGTGTTTGATCAAGTCTCGTGCCGGCCGGTGTCCACGGTCGGTGCCCGCCACGTGGTGACCGACGCCCTGGACGTGTGCggg < 2:262655/148‑1 (MQ=255) agcgcgaGCCCAACGTGAGCGGCTGCGGCAGCTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCGGGTATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGgggc > 2:54808‑M2/2‑146 (MQ=255) gcgcgAGCCCTGCGTGAGCGGCTGCAGCAGCTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGgggcg < 1:2091888‑M2/150‑6 (MQ=255) gcgcgAGCCCTGCGTGAGCGGCTGCAGCAGCTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCAGGCCGTGTGCGgggcg < 1:1011161‑M2/150‑6 (MQ=255) gCCCTGCGTGAGCGGCTGCAGCAGCTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAAt < 1:835303/150‑1 (MQ=255) cccTGCGTGAGCGGCTGCAGCAGCTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCaagg > 1:1841433/1‑148 (MQ=255) ccTGCGTGAGGCGTTGCGGCGGCTGGGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCGCGGTGGCCGCCAGGTGGTTACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAAtgt < 2:498735/150‑1 (MQ=255) cGTGAGCGGCTGCAGCAGCTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTc < 2:377081/150‑1 (MQ=255) gAGCGGCTGCAGCAGCTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGcc > 2:767767/1‑150 (MQ=255) ggCTGCAGCAGCTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACACTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGAcc < 1:1550955/150‑1 (MQ=255) tGCAGCAGCTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTg < 2:977987/150‑1 (MQ=255) gcagcTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGATCGGTGGGAACCGGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCa > 1:1692851/1‑150 (MQ=255) gcagcTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGCTTAAACAAGGCGGGGATCTGCCGTTGTACGCGCTGGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCa < 1:523386/150‑1 (MQ=255) gcTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGcc > 2:320489/1‑150 (MQ=255) gcTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGcc > 1:261357/1‑150 (MQ=255) tGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCgg > 1:2214797/1‑150 (MQ=255) 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cGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGcc > 2:1618198/1‑150 (MQ=255) cGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGcc > 1:2337935/1‑150 (MQ=255) gACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCg > 2:2121288/1‑150 (MQ=255) gCCCTGGCCGTGTGCGgggcgtcggtcaccacctggcggccaccgagcgtgta < 2:138839‑M2/53‑38 (MQ=255) gCCCTGGCCGTGTGCGgggcgtcggtcaccacctggcggccaccgagcgtgta > 1:138839‑M2/1‑16 (MQ=255) cccTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGACAATTTTGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGa > 1:513044/1‑150 (MQ=255) tGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAg < 2:818826/134‑1 (MQ=255) tGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAg > 1:818826/1‑134 (MQ=255) ggCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCCGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCg > 2:1816816/1‑150 (MQ=255) ccGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCggg < 2:261357/150‑1 (MQ=255) tgtgtGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGc > 2:2163806/2‑150 (MQ=255) gtgCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGt < 2:1898789/150‑1 (MQ=255) tgCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGAACTTGGCCAGCCGGAGCACCCGGCCAAGTGAGGGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCGGCTGATGTGGCGCAAGTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGGTTCGGGCGGTg > 1:1813777/1‑150 (MQ=255) gCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTgg < 2:1011161/150‑1 (MQ=255) ggggCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAATGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCt < 1:470696/150‑1 (MQ=255) ggggCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCt > 1:1295241/1‑150 (MQ=255) | ATACGCGCGAGCCCTGCGTGAGCGGCTGCAGCAGCTGCGCCAGCAGTATCGGCGTGACGAACCCTTGCAGGTGTTTTATCAAGTCTGGGATCGGCCGTTGTACACGCTCGGTGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCT > NC_002947/608531‑608828 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |