New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 836205 = | 92 (1.040) | 9 (0.110) | 8/226 | NT | 10.3% | intergenic (‑124/+53) | PP_0718/ychF | sulfate transporter/ribosome‑associated potassium‑dependent ATP/GTPase |
? | NC_002947 | 836237 = | 73 (0.910) | intergenic (‑156/+21) | PP_0718/ychF | sulfate transporter/ribosome‑associated potassium‑dependent ATP/GTPase |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GGCTCTGGGCGAGAAGGGCGCTGAACCTCAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGCCACTTACCGGCTTCCTTGGCACCGGCTTCACCCTTGAACTGGATGAAGTCGTCATAGGCCAC > NC_002947/836088‑836386 | ggCTCTGGGCGAGAAGGGCGCTGAACCTCAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTtg > 2:2058612/1‑150 (MQ=255) ctGGGCGAGAAGGGCGCTGAACCTCAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTtgtgtg < 1:2058612/150‑1 (MQ=255) cGAGAAGGGCGCTGAACCTCAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGtgctg < 1:2334900/150‑1 (MQ=255) gagaAGGGCGCTGAACCTCAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGtgctgc < 1:700617/150‑1 (MQ=255) gaAGGGCGCTGAACCTCAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAg > 1:1473603/1‑150 (MQ=255) aaggaagccggtaagtggcgtctggaaggcaaagactacatcgtcaaagacggcgacgtgatgcacttccgctttaacgtctaagcggtaacctgcagcacacacaaaccccttgaagcgcaagcctcaaggggtttGTGTGTGCTGCAg > 2:247359‑M2/138‑150 (MQ=255) aaggaagccggtaagtggcgtctggaaggcaaagactacatcgtcaaagacggcgacgtgatgcacttccgctttaacgtctaagcggtaacctgcagcacacacaaaccccttgaagcgcaagcctcaaggggtttGTGTGTGCTGCAg < 1:247359‑M2/13‑1 (MQ=255) aGGGCGCTGAACCTCAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGt < 1:843508/150‑1 (MQ=255) tGAACCTCAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCt < 2:1182112/150‑1 (MQ=255) taagtggcgtctggaaggcaaagactacatcgtcaaagacggcgacgtgatgcacttccgctttaacgtctaagcggtaacctgcagcacacacA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTtgt > 2:277405‑M1/95‑128 (MQ=255) ccTCAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCa > 2:1889550/1‑136 (MQ=255) ccTCAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCa < 1:1889550/136‑1 (MQ=255) cTCAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGAc < 2:1474861/150‑1 (MQ=255) tCAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACg > 1:1836659/1‑150 (MQ=255) cAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGt < 2:1473603/150‑1 (MQ=255) tAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAg < 1:457601/150‑1 (MQ=255) aTGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCgg < 2:1758656/150‑1 (MQ=255) gCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTGAAGGCGGaa > 1:1196972/1‑150 (MQ=255) tGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAAGGGGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGt > 2:1958627/1‑150 (MQ=255) aaGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGc < 1:1251236/150‑1 (MQ=255) aaGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGAGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGc > 1:176897/1‑150 (MQ=255) gCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATc < 1:1642174/150‑1 (MQ=255) gggCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCACAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGt < 1:1262097/150‑1 (MQ=255) tttGCGGCCTGGTACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTc > 2:36003/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGa > 1:161084/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGa > 1:172988/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGAc > 2:2325204/1‑150 (MQ=255) ccTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACg > 1:1431585/1‑150 (MQ=255) cTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGa > 1:1968825/1‑150 (MQ=255) tGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCACAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGAt > 2:1306962/1‑150 (MQ=255) cACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTa < 1:213955/150‑1 (MQ=255) gacgCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTc > 1:991603/1‑150 (MQ=255) cgCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAACACTACCATGGCCCT‑‑ACCTTTATCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCtt < 2:1228630/150‑1 (MQ=255) gCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGGGTTTGTTGGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCttt > 1:1228630/1‑150 (MQ=255) aaGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCg < 2:1117004/109‑1 (MQ=255) aaGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCg > 1:1117004/1‑109 (MQ=255) aaGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGc < 2:875421/150‑1 (MQ=255) ttccgctttaacgtctaagcggtaacctgcagcacacacaaaccccttgaagcgcaagcctcaaggggtttGTGTGTGCTGCAg < 2:2087942‑M2/13‑1 (MQ=255) gccCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCa > 2:2113163/1‑150 (MQ=255) ccccTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAg > 2:599574/1‑150 (MQ=255) cccTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTtgtgtgt < 2:424904/71‑1 (MQ=255) cccTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTtgtgtgt > 1:424904/1‑71 (MQ=255) ccTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGAc > 1:2187777/1‑150 (MQ=255) ccTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGAc < 1:2129900/150‑1 (MQ=255) tGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGc < 2:546404/150‑1 (MQ=255) 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ccttgaggcttgcgcttcaaggggtttGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGCCACTTACCGGCTTCCTTGGCACCGGCTTCACCCtt > 2:664374‑M2/28‑150 (MQ=255) CCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGCCACTTACCGGCTTCCTTGGCACCGGCTTCACCCtt > 1:990619‑M1/1‑150 (MQ=255) tgaggcttgcgcttcaaggggtttGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGCCACTTACCGGCTTCCTTGGCACCGGCTTCACCCTTGaa < 1:233613‑M2/126‑1 (MQ=255) TGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGCCACTTACCGGCTTCCTTGGCACCGGCTTCACCCTTGaa > 2:2187777‑M1/1‑150 (MQ=255) cgcAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGCCACTTACCGGCTTCCTTGGCACCGGCTTCACCCTTGAACTGGa < 2:1968825/150‑1 (MQ=255) 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1:807630‑M2/12‑150 (MQ=255) aaggggtttGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGCCACTTACCGGc > 2:1755024‑M2/10‑108 (MQ=255) aaggggtttGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGCCACTTACCGGCTTCCTTGGCACCGGCTTCACCCTTGAACTGGATGAAgtcgtc > 2:1525573‑M2/10‑150 (MQ=255) ggtttGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGCCACTTACCGGCTTCCTTGGCACCGGCTTCACCCTTGAACTGGATGAAGTCGTCATAg < 1:2113163‑M2/145‑1 (MQ=255) ggtttGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGCCACTTACCGGCTTCCTTGGCACCGGCTTCACCCTTGAACTGGATGAAGTCGTCATAg < 2:1836659‑M2/145‑1 (MQ=255) ggtttGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGCCACTTACCGGCTTCCTTGGCACCGGCTTCACCCTTGAACTGGATGAAGTCGTCATAg < 2:92022‑M2/145‑1 (MQ=255) 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gtgtgtgCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGAt > 1:146316/1‑66 (MQ=255) gtgtgtgCCGTAGGTGACCGCATAACGGTTAAAGCGGAGGTACATGACGTCGCCGGCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGCCACTTACCGGCTTCCTTGGCACCGGCTTCACCCTTGAACTGGATGAAGTCGTCATAGGccac > 2:90174/1‑150 (MQ=255) | GGCTCTGGGCGAGAAGGGCGCTGAACCTCAGCTTAGATGCTGAAGGCGGGGGCCGCTTTGCGGCCTGGCACGACGCAAGGCCGCCCCTGCCAAGGGCGCGCATGTCTGGGCAAAACAA‑‑AACCCCTTGAAGCGCAAGCCTCAAGGGGTTTGTGTGTGCTGCAGGTTACCGCTTAGACGTTAAAGCGGAAGTGCATCACGTCGCCGTCTTTGACGATGTAGTCTTTGCCTTCCAGACGCCACTTACCGGCTTCCTTGGCACCGGCTTCACCCTTGAACTGGATGAAGTCGTCATAGGCCAC > NC_002947/836088‑836386 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |