New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1622527 = | 80 (0.910) | 11 (0.150) | 9/212 | NT | 14.5% | intergenic (+7/+59) | PP_1421/PP_1422 | sensor histidine kinase TctE/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1622577 = | 61 (0.810) | intergenic (+57/+9) | PP_1421/PP_1422 | sensor histidine kinase TctE/hypothetical protein |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCGGGCGATCTGCAC > NC_002947/1622431‑1622726 | agaTCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTa < 2:1764648/150‑1 (MQ=255) tCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAg > 2:239609/1‑150 (MQ=255) gggCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGATGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAgc < 1:1375904/150‑1 (MQ=255) gggCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCaac < 1:1375958/150‑3 (MQ=255) gggCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGACTGTCTC‑CAGTGCGCAGGTGGCGCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAgc > 2:1228778/1‑150 (MQ=255) gcgcACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTg > 1:2145463/1‑136 (MQ=255) gcgcACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTg < 2:2145463/136‑1 (MQ=255) cTGGCGCCACGGCCCCTGCGCGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGCGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCTTGTGTCGCCCCTTTCAGG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATg < 1:280312/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATg > 2:2243131/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATg > 1:503745/1‑150 (MQ=255) gTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCgcgcg > 1:1981070/1‑149 (MQ=255) gTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGcc > 1:2061275/1‑150 (MQ=255) gACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTa > 2:1681244/1‑122 (MQ=255) gACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTa < 1:1681244/122‑1 (MQ=255) ccTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCTGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCcag < 1:1309610/150‑1 (MQ=255) ggCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCCCACGCTAAAGGGGTGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCcagca < 2:1153088/149‑1 (MQ=255) gCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCcagca < 2:2215638/149‑1 (MQ=255) gCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCcagca > 1:2215638/1‑149 (MQ=255) aTGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAgc > 2:817582/1‑120 (MQ=255) aTGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAgc < 1:817582/120‑1 (MQ=255) tGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGAGTGAGCTTTATCGCGGCCTGGTGGAACAGGGGGGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc < 2:62561/150‑1 (MQ=255) gggCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTTAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCTCCCCTTGCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATc < 2:85581/149‑1 (MQ=255) gagaAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGAcc < 2:492614/150‑1 (MQ=255) gagaAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGAcc > 1:492614/1‑150 (MQ=255) gaAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGAc < 1:2171139/147‑1 (MQ=255) gaAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGAc > 2:2171139/1‑147 (MQ=255) gggCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTg > 2:233490/1‑98 (MQ=255) gggCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTg < 1:233490/98‑1 (MQ=255) ggCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCATCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCAt < 1:866260/139‑1 (MQ=255) ggCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCATCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCAt > 2:866260/1‑139 (MQ=255) cGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTAc < 1:859826/99‑1 (MQ=255) cGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTAc > 2:859826/1‑99 (MQ=255) cGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTc < 1:2243131/150‑1 (MQ=255) gTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGt < 1:239609/150‑1 (MQ=255) gtgcgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAAc < 2:1586290/150‑1 (MQ=255) tgcgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACg < 2:948912/150‑1 (MQ=255) tgcgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACg < 1:2052436/150‑1 (MQ=255) gcgggtgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACgg < 1:2185966/150‑1 (MQ=255) tgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGAc < 1:1200989/124‑1 (MQ=255) tgAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGAc > 2:1200989/1‑124 (MQ=255) cTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAg > 2:1705924/1‑150 (MQ=255) tCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCcgc > 2:51387/1‑95 (MQ=255) 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gTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAAc > 1:699312/1‑127 (MQ=255) tttGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGgcagc > 2:2130052/1‑150 (MQ=255) CCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGgcagcgcag < 1:593304‑M1/150‑1 (MQ=255) CTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGgcagcgcagc < 1:611169‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAg < 1:77772‑M1/49‑1 (MQ=255) GCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAg > 2:77772‑M1/1‑49 (MQ=255) GCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCg > 2:784068‑M1/1‑125 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ctttcgcgggtgagcccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGt > 1:322456‑M2/38‑150 (MQ=255) aTG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCt < 2:1291151/64‑1 (MQ=255) aTG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCt > 1:1291151/1‑64 (MQ=255) gcgggtgagtccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGa < 2:1986264‑M2/79‑1 (MQ=255) gcgggtgagtccatgaaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGa > 1:1986264‑M2/33‑111 (MQ=255) gCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCcgc < 2:593304/150‑1 (MQ=255) cccGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGctga < 2:1981070/150‑1 (MQ=255) ccGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTg < 2:1439001/136‑1 (MQ=255) ccGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTg > 1:1439001/1‑136 (MQ=255) aaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATg < 2:957382‑M2/133‑1 (MQ=255) aaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATg > 1:1198590‑M2/18‑150 (MQ=255) aaaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATg < 1:1705924‑M2/133‑1 (MQ=255) aaggggcgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGc > 1:2016656‑M2/17‑150 (MQ=255) cgacacaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCggg < 2:1988527‑M2/140‑1 (MQ=255) acaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCg < 1:1303083‑M2/138‑1 (MQ=255) acaggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCg > 2:1303083‑M2/7‑144 (MQ=255) aggcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCGGGCGATCt > 1:1774109‑M2/5‑150 (MQ=255) gcTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCGGGCGATCTGc < 1:697006‑M2/148‑1 (MQ=255) tGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCGGGCGATCTGCAc > 2:822700/1‑150 (MQ=255) tGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCGGGCGATCTGCAc > 1:2063317/1‑150 (MQ=255) | GAGATCTGTCGGGCGCACCTGGCGCAAGTGACCCTGCACGATGGCGAGAAGGGCGGGTTGCGGGTGCGGGTGAGCTTTATCGCGGATTGATGGTTTGCCTGTGTCGCCCCTTTCATG‑GGCTCACCCGCGAAAGGGGCGACACAGGCTGGTACAGCTCAGCGCAACATGCTCCGCGCCTCCAGCAGTTCATCGACCTCCAGCTCGGTGCCAAACGGCAACCCCAGATGGCGGTACGCCGGCAGCGCAGCCAATGGCCGGTGACGCCCGCGCTGACTGATGCAGCGGGCGATCTGCAC > NC_002947/1622431‑1622726 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |