| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 3359296 = | 87 (0.990) | 8 (0.100) | 7/226 | NT | 9.8% | coding (430/912 nt) | PP_2955 | CorA family magnesium/cobalt transporter |
| ? | NC_002947 | 3359328 = | 68 (0.850) | coding (398/912 nt) | PP_2955 | CorA family magnesium/cobalt transporter | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
ACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTACAACGCCGAATGAC > NC_002947/3359181‑3359474 | aCGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAgg < 1:297026/150‑1 (MQ=255) ggCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTa > 2:812481/1‑150 (MQ=255) ggCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTa > 2:1987808/1‑150 (MQ=255) aTTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATg < 2:1478914/150‑1 (MQ=255) ttGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATGTGCACCAGGTGTGGGGTGGCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTCCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGc < 1:1692718/150‑1 (MQ=255) ttGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGa > 2:870332/1‑147 (MQ=255) tttGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGc > 2:1060719/1‑150 (MQ=255) ttGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCt < 2:1343322/150‑1 (MQ=255) 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ACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCttt < 1:243434‑M1/150‑1 (MQ=255) GCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGt < 1:249327‑M1/96‑1 (MQ=255) CTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCt > 1:1518511‑M1/1‑150 (MQ=255) ttACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGa < 2:1366103/150‑1 (MQ=255) caccCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAg > 2:1605511/1‑109 (MQ=255) caccCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAg < 1:1605511/109‑1 (MQ=255) caccCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTAc > 2:2276592/1‑150 (MQ=255) caccCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTAc > 1:337957/1‑150 (MQ=255) caccCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTCCCAACAAGC‑GCCATATCGAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTAc > 1:1573467/1‑150 (MQ=255) cccGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCCCGCCAGCATGCCGGTAACGCTCTGCCTGTATCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTACaa < 1:1452645/150‑1 (MQ=255) cccGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTACaa < 2:556776/150‑1 (MQ=255) cccAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTACAACGCCGAATGAc < 1:2306548‑M2/147‑1 (MQ=255) cccAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTACAACGCCGAATGAc < 1:19598‑M2/147‑1 (MQ=255) cccAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTACAACGCCGAATGAc < 1:923750‑M2/147‑1 (MQ=255) ccAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATcaccac < 2:1941432‑M2/113‑1 (MQ=255) ccAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATcaccac > 1:1941432‑M2/3‑115 (MQ=255) cAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGa < 1:1328693‑M2/130‑1 (MQ=255) cAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGa > 2:1328693‑M2/2‑131 (MQ=255) | ACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTGGCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATC‑AGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTACAACGCCGAATGAC > NC_002947/3359181‑3359474 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |