New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3917240 = | 76 (0.860) | 6 (0.070) | 5/232 | NT | 8.0% | coding (978/3129 nt) | mexB | multidrug resistance protein MexB |
? | NC_002947 | 3917268 = | 67 (0.810) | coding (1006/3129 nt) | mexB | multidrug resistance protein MexB |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGCCGTGATGCTGGCCATG > NC_002947/3917120‑3917417 | ggCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcgat < 2:314092/150‑1 (MQ=255) gCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcgatc < 1:640807/150‑1 (MQ=255) cTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcgatcga < 1:1087444/150‑1 (MQ=255) ttCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAg < 2:594903/150‑1 (MQ=255) aGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAg < 1:403734/150‑1 (MQ=255) gcacgaccagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatcgacacctcgccgttcgtcaaggtgtcgATCGAGCAGGtca > 1:2140025‑M2/138‑150 (MQ=255) cAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtcatc < 1:188369/150‑1 (MQ=255) acgaccagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatCGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcga < 1:883549‑M1/29‑1 (MQ=255) acgaccagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatCGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcga > 2:883549‑M1/108‑136 (MQ=255) cagggtcgggatcagcgtgtagcgcaggttctgcaggaacaggaacatgactgcgaacaccagcagcatggcctcgaacagggtgttgatgacctgctcgatcgacacctcgccgttcgtcaaggtgtcgATCGAGCAGGTCATCAacac < 2:2140025‑M2/20‑1 (MQ=255) tCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAg < 1:1018267/138‑1 (MQ=255) tCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAg > 2:1018267/1‑138 (MQ=255) aCCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCt > 2:691721/1‑150 (MQ=255) cccGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACGTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTg > 1:496370/1‑150 (MQ=255) cccGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCTCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTg < 1:1455934/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtcatc < 2:1789361/140‑1 (MQ=255) ccGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtcatc < 1:1669621/140‑1 (MQ=255) ccGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtcatc > 1:1789361/1‑140 (MQ=255) ccGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtcatc > 2:1669621/1‑140 (MQ=255) gcgcCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCg > 1:1980442/1‑150 (MQ=255) ccAACGCCATGGAAACCGATACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAgg < 2:637203/150‑1 (MQ=255) cAACGCCATGGAAACCGCTGCCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCGCGCGCTCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGc > 2:913423/1‑150 (MQ=255) gCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCAtg > 1:757679/1‑150 (MQ=255) cATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCAtgct > 1:745701/1‑150 (MQ=255) 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cGGGCGACGATGCAGGACCTGGCGTGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtgttc < 2:176231/150‑1 (MQ=255) cGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtgttc < 2:1238814/150‑1 (MQ=255) gggCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtca < 1:689730/102‑1 (MQ=255) gggCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtca > 2:689730/1‑102 (MQ=255) ggCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtgttcct < 1:691721/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtgttcct < 2:698643/150‑1 (MQ=255) 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gTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTc < 1:1444966/121‑1 (MQ=255) gTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTc > 2:1444966/1‑121 (MQ=255) gTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCAGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGc < 2:1105745/150‑1 (MQ=255) tCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAgg < 1:1247796/45‑1 (MQ=255) tCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAgg > 2:1247796/1‑45 (MQ=255) cGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCGCGGCCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGCCGt < 1:987296/150‑1 (MQ=255) gTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGCCGTg > 1:1869716/1‑150 (MQ=255) tCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGCCGTGa > 1:2078938/1‑150 (MQ=255) aaGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGCCGTGATg > 1:1835865/1‑150 (MQ=255) aggtgtcgATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGCCGTGATGc < 1:1886797‑M2/142‑1 (MQ=255) gtgtcgATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGCCGTGATGCTg < 1:1901828‑M2/144‑1 (MQ=255) tgtcgATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGCCGTGATGCTgg < 2:2078938‑M2/145‑1 (MQ=255) tcgATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGc < 1:1560065‑M2/134‑1 (MQ=255) tcgATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGc > 2:1560065‑M2/4‑137 (MQ=255) gATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGCCGt < 2:1281270‑M2/137‑1 (MQ=255) gATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGCCGt > 1:1281270‑M2/2‑138 (MQ=255) gATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGCCGTGATGCTGGCCAt > 1:1097524‑M2/2‑150 (MQ=255) atcgaGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGCCGTGATGCTGGCCATg < 2:1573582/150‑1 (MQ=255) | GGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCCCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCACCTTCGCCGTGATGCTGGCCATG > NC_002947/3917120‑3917417 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |