New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCAGGAACTTGGCCGGCTCGGCCA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGCCGGCGATCTTCTGCTGGGCGGTCT > NC_002947/5164555‑5164848 | cGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCAGGAACTTGGCCGGCTCGGCCA‑GTTGCTgca < 1:1155555/150‑1 (MQ=255) gCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCAGGAACTTGGCCGGCTCGGCCA‑GTTGCTgcag < 1:477335/150‑1 (MQ=255) ccTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCAGGAACTTGGCCGGCTCGGCCA‑GTTGCTgcagc < 1:218357/150‑1 (MQ=255) 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cAGGAACTTGGCCGGCTCGGCCA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGtt > 2:1066324/1‑114 (MQ=255) cAGGAACTTGGCCGGCTCGGCCA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGtt < 1:1066324/114‑1 (MQ=255) aGGAACTTGGCCGGCTCGGCCA‑GTTGctgcgcggcaagctgccggggctgaccgagctgggcctgct > 1:172177‑M2/1‑26 (MQ=255) ggAACTTGGCCGGCTCGGCCA‑GTTCctgcgcggcaagctgccggggctgaccgagctgggcctgctgtaccgtgaaatggggcgggtagaagcgctggtcgaagacattctgctggccagcctggacagttgcatccttgaaggcgaaca < 2:618204‑M2/150‑126 (MQ=255) aCTTGGCCGGCTCGGCCA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGCCgg > 1:385324/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCGGCTCGGCCA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGAc > 1:1738185/1‑142 (MQ=255) cTTGGCCGGCTCGGCCA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGAc < 2:1738185/142‑1 (MQ=255) ttGGCCGGCTCGGCCA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGCCGGCg > 2:1547166/1‑150 (MQ=255) cGGCTCGGCCA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGCCGGCGAtctt > 1:912726/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGCCGGCGATCTTctg < 1:538699/150‑1 (MQ=255) cGGCCA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGCCGGCGATCTTctgct < 1:817078/150‑1 (MQ=255) ggCCA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGCCGGCGATCTTctgctg > 1:1409248/1‑150 (MQ=255) gCCA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGACTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGCCGGCGATCTTCTGCTgg > 1:2225824/1‑150 (MQ=255) cA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACTCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTTATCGACAGGCCGGCGATCTTCTGCTGGGc > 1:2194680/1‑150 (MQ=255) cA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGc < 1:936731/131‑1 (MQ=255) cA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGc > 2:936731/1‑131 (MQ=255) a‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGAGTCGAGACAATTTCACCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGCCGGCGATCTTCTGCTGGGCg < 1:1449899/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGaaa < 1:937698/43‑1 (MQ=255) gTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGaaa > 2:937698/1‑43 (MQ=255) ttGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGCCGGCGATCTTCTGCTGGGCGGt < 1:697435/150‑1 (MQ=255) gctgcAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGCCGGCGATCTTCTGCTGGGCGGTCt < 2:912726/150‑1 (MQ=255) | CGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCGCAGGAACTTGGCCGGCTCGGCCA‑GTTGCTGCAGCAACAGCCGTTGCAAGGCGCGGCGGTGCTGAAACTCCGCTTCGGCCTGGGTCGAGAAACGCCCTTCACGCACAGTGCCGTTGTCTTCCACCAGTGCCGGGTACACGGTCATCGACAGGCCGGCGATCTTCTGCTGGGCGGTCT > NC_002947/5164555‑5164848 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |