| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5696617 = | 69 (0.780) | 6 (0.070) | 3/234 | NT | 10.9% | intergenic (+13/‑199) | pyrC'/hslV | dihydroorotase‑like protein/ATP‑dependent HslVU protease peptidase subunit |
| ? | NC_002947 | 5696692 = | 33 (0.400) | intergenic (+88/‑124) | pyrC'/hslV | dihydroorotase‑like protein/ATP‑dependent HslVU protease peptidase subunit | |||||
TGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCG‑GGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCAGGCACTTTCGCCCCGCTGCGTGGAGACTCTCCCCTTGACCACAATCGTTTCT > NC_002947/5696545‑5696833 | tgcctgccGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCG‑GGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaa > 1:1047053/1‑150 (MQ=255)tgcctgccGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCG‑GGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaa > 2:2023612/1‑150 (MQ=255) gcggggCGGGGTGCGTTTTTTCTTGGTCGATGGCCACATCTCCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGGC‑GGTGCGCCCGATCCCACAGGATCACCACATTTCCAAGGCAGGTTGTAACCCATGGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCt < 2:1643176/147‑1 (MQ=255) cGGGCGCGGAGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTAACATGCTTAGCG‑AGCACGCCCGATACAACAGGAAAACCAAAATACCACTGCATGTGGTACCTATGTTGGAACGGGAATAGCCACGAGTGccata > 2:999316/1‑147 (MQ=255) cagggcgGGGCGGTATCCCTTGCTAGATGGCCCCCTCTGCCACGAGCGGTGACTACCTTGCGTGGCG‑GGCGCGCTCTCTCCCACAGGATCACCACATCTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGTGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTca < 2:2005705/146‑1 (MQ=255) ggcgGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATGTGCCACGAGGCATGAGTACCATGCGTAGGG‑GGCACGTCCGACCCCACTGGATGACCACAATTCCCAGGCAGGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACAt < 2:1047053/149‑1 (MQ=255) ggTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCG‑GGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAAGTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGGCCGCGAATGCCTTAACATAGt > 1:798603/1‑150 (MQ=255) ccTTGGTCGATGGCCACATCTCCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCG‑GGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGCGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCGCGCaaa > 1:693696/1‑150 (MQ=255) cTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCG‑GGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGccgaa > 1:1754090/1‑147 (MQ=255) cgTCGAGGGCCACATCCGCCACGAGGCGTGACTGCCAGGCTT‑GCGCGGTGCGTTAGCTCTCAGTGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTTGTATACCTGGGTGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAgcgc < 2:863451/149‑1 (MQ=255) tCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCG‑GGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGAGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATGGTCTCCCCTCCCATCGCGa > 2:1388464/1‑150 (MQ=255) gATGGCCACATCTGCCACGAGGCGTGAGTACCATGCTTAGCG‑GGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTACACCCGCCCAGCGCGAcc > 2:794926/1‑150 (MQ=255) ccACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCG‑GGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCTCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑a > 1:1278049/1‑150 (MQ=255) gCCTGAGTACCATGCTTAGCG‑GGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTCGTATccccccctccaca > 2:1652104/1‑144 (MQ=255) gCCTGAGTACCATGCTTAGCG‑GGAAGGGCTTTTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGaaa > 1:1815539/1‑150 (MQ=255) ccTGAGTACCATGCTTAGCC‑GGTACGCCAGCTCCTGCAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAAt < 2:460796/150‑1 (MQ=255) aGCG‑GCCACGCCCGCCCCCACAGGATCACCACAATTCCCAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCcccccaccccc < 2:2321256/150‑1 (MQ=255) GCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATccc > 1:2202843‑M1/1‑116 (MQ=255) GCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATccc < 2:2202843‑M1/116‑1 (MQ=255) ctcttccgatctcacagggttaccacatgcattcgcggtttggtgatcctgtgggagcgggcatgcccgcGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ACCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGa < 2:1355116‑M2/80‑1 (MQ=255) atctcccgctcccacagggttaccacatgccttggaattgtggtgatcctgtgggagcgggcgtgcccgcGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGa < 1:1533367‑M2/80‑1 (MQ=255) CACGCCCCTACCCACAACATCACCACAATTCCAAGGCCTGTCGAACCCCAGTCGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATCTGa > 1:921630‑M1/1‑150 (MQ=255) ACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCaa < 2:1767187‑M1/97‑1 (MQ=255) ACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCaa > 1:1767187‑M1/1‑97 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCt > 2:2267967/1‑126 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCt < 1:2267967/126‑1 (MQ=255) cccgcgggATGACCACATTTCCAAGGCAGGGTGAAACCCTGGGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCa < 2:1012954/144‑1 (MQ=255) cccACATGCTCACCACAACTCCAAGGCACGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCa < 1:1613123/150‑1 (MQ=255) ttacacGATCCCCACAATTCCAAGGCATCCGGTATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCAg < 1:836631/148‑1 (MQ=255) ccacagggttaccacatgccttggaattgtggtgatcctgtgggagcgggcgtgcccgcAAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGtt < 1:1848778‑M2/53‑1 (MQ=255) ccacagggttaccacatgccttggaattgtggtgatcctgtgggagcgggcgtgcccgcAAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGtt > 2:1848778‑M2/60‑112 (MQ=255) ccACAGGATCACCCCACTCCCCAGTCCTCTGGTATCCCTGTGCGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCAg < 2:548650/150‑1 (MQ=255) ccACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑At < 2:1471686/101‑1 (MQ=255) ccACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑At > 1:1471686/1‑101 (MQ=255) cactcgATCACCACAATTCCAAGGAATCCGGTATCCCTGGCTGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCAgg < 1:2023612/145‑1 (MQ=255) acagggttaccacatgccttggaattgtggtgatcctgtgggagcgggcatgcccgcGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGaaa < 1:1045939‑M2/57‑1 (MQ=255) acagggttaccacatgccttggaattgtggtgatcctgtgggagcgggcatgcccgcGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGaaa > 2:1045939‑M2/58‑114 (MQ=255) acaGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATccccc < 2:1512434/104‑1 (MQ=255) acaGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATccccc > 1:1512434/1‑104 (MQ=255) tCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGt > 2:1062614/1‑103 (MQ=255) tCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGt < 1:1062614/103‑1 (MQ=255) cacaATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTcc > 1:411155/1‑111 (MQ=255) cacaATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTcc < 2:411155/111‑1 (MQ=255) aaTTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑At < 2:233168/86‑1 (MQ=255) aaTTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑At > 1:233168/1‑86 (MQ=255) cagtgGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCAGGCACTTTCGCCCCGCTGCGTGGAGACTCTCCCCTTGa < 1:317891/148‑1 (MQ=255) gcgtgcccgcGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCAGGCACTTTCGCCCCGCTGCGTGGAGACTCTCCCCTTGACCACAATCGttt < 2:2114594‑M2/140‑1 (MQ=255) gCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCAGGCACTTTCGCCCCGCTGCGTGGAGACTCTCCCCTTGACCACAATCGttt < 1:1649465/150‑1 (MQ=255) gCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCACCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCAGGCACTTTCGCCCCGCTGCGTGGAGACTCTCCCCTTGACCACAATCGttt < 2:798603/150‑1 (MQ=255) cATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCAGGCACTTTCGCCCCGCTGCGTGGAGACTCTCCCCTTGACCACAATCGTTTc < 1:919532/150‑1 (MQ=255) aTGCCCGCGAATGTCTTCACATACTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAACCCTACCCCCCTCCCCCAGATACGATTGCCCAAGGCACTTTCGCCCCGCTGCGTGGAGACTCTCCCCTTGACCACAATCGTTTCt < 1:357064/150‑1 (MQ=255) | TGCCTGCCGGGCGCGGTGCGTTATACCTTGGTCGATGGCCACATCTGCCACGAGGCCTGAGTACCATGCTTAGCG‑GGCACGCCCGCTCCCACAGGATCACCACAATTCCAAGGCATGTGGTAACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCCTTCACATAGTCCCCCCGCCAAGCGCGACCATTC‑‑ATCCCCCCCGGTTGAAATCCTTCCCCCCACCCCCATATGAGTCTGCATCAGGCACTTTCGCCCCGCTGCGTGGAGACTCTCCCCTTGACCACAATCGTTTCT > NC_002947/5696545‑5696833 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |