New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5943678 | 111 (1.260) | 6 (0.080) | 6/204 | NT | 5.7% | intergenic (+30/+55) | PP_5210/PP_5211 | alcohol dehydrogenase/ChaC‑related protein |
? | NC_002947 | = 5943699 | 106 (1.460) | intergenic (+51/+34) | PP_5210/PP_5211 | alcohol dehydrogenase/ChaC‑related protein |
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
GGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCAT > NC_002947/5943552‑5943848 | gCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttac < 2:1225087‑M2/150‑9 (MQ=255) gCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttac > 2:2040411‑M2/1‑142 (MQ=255) cAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGACGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacc < 1:2234539‑M2/150‑10 (MQ=255) cAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacc < 2:657429‑M2/150‑10 (MQ=255) tATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaa > 2:459281‑M2/1‑135 (MQ=255) tATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaa > 2:53076‑M2/1‑135 (MQ=255) aTCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaag < 1:296735‑M2/150‑17 (MQ=255) tCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaaga > 2:2064928‑M2/1‑133 (MQ=255) aCTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggc < 2:1089165‑M2/150‑21 (MQ=255) tGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccg > 2:1651275‑M2/1‑128 (MQ=255) gCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAggg > 1:797672‑M2/1‑126 (MQ=255) aGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAAc < 2:2234539/150‑1 (MQ=255) aaGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAg < 2:1445778/150‑1 (MQ=255) aGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAgg < 2:1339338/150‑1 (MQ=255) ggcGGGGGTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTATACCCGCTCCTACAGGCGAACGTGGAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGt < 1:891688/148‑1 (MQ=255) gCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagag > 2:209216‑M2/1‑120 (MQ=255) gCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagag < 1:209216‑M2/138‑19 (MQ=255) gCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGt > 1:1585716/1‑150 (MQ=255) ccGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGtt > 1:1300176/1‑150 (MQ=255) gTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGc > 1:1317167/1‑147 (MQ=255) ttGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTca < 2:243200/149‑1 (MQ=255) tATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGGTCACACtt > 1:1931689/1‑150 (MQ=255) tATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACtt > 2:1830670/1‑150 (MQ=255) tATCGAGAAGCTGGGGAAAAGGCAGGCTGTGGGTAAGATGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGAGCGTGCAGGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGTTTGCGCACACtt > 1:2219952/1‑150 (MQ=38) aTCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccg < 2:177676‑M2/130‑23 (MQ=255) aTCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccg > 1:177676‑M2/1‑108 (MQ=255) ggCTGGGGCAACGGCAGGGTGTGGGTAAGGTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGa < 2:1300176/149‑1 (MQ=255) cTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGAtt > 2:684782/1‑150 (MQ=255) gggCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATtgtg < 1:524946/150‑1 (MQ=255) gggCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATtgtg > 1:378678/1‑150 (MQ=255) gggCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATtgtg > 1:2314937/1‑150 (MQ=255) ggCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTgg < 1:2298147/150‑1 (MQ=255) gCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGc > 1:2147455/1‑150 (MQ=255) aaCGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCGAGGATAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCaa > 1:776754/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCt < 2:2147455/150‑1 (MQ=255) tgtgGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATc < 1:581599/150‑1 (MQ=255) tgGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGCGCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATcgc < 1:1918623/150‑1 (MQ=255) ggTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCgcgc > 2:1559961/1‑150 (MQ=255) gTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCt < 1:202418/150‑1 (MQ=255) tAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGt < 2:1788113/106‑1 (MQ=255) aaGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTc < 2:1130564/150‑1 (MQ=255) gTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCt < 2:2303290/107‑1 (MQ=255) ttGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATtgt < 1:1636651/125‑1 (MQ=255) ttGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAg < 1:434093/150‑1 (MQ=255) gtggtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGa > 2:589862/1‑134 (MQ=255) tggtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTg < 1:1056487/150‑1 (MQ=255) gtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaa < 2:1487230‑M2/81‑16 (MQ=255) gtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaa > 1:1487230‑M2/1‑66 (MQ=255) gtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCg < 1:701519/150‑1 (MQ=255) gtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCg > 1:1231562/1‑150 (MQ=255) tgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGAtt > 1:563453/1‑116 (MQ=255) tgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGAtt < 2:563453/116‑1 (MQ=255) tgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGa > 2:1221905/1‑150 (MQ=255) tgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGa > 1:1760666/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGCGACCACCGGGTTCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCgg < 2:776754/150‑1 (MQ=255) gCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATtgtg > 1:1430250/1‑114 (MQ=255) gCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATtgtg < 2:1430250/114‑1 (MQ=255) cAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGaa < 1:2225581/83‑1 (MQ=255) cAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCa > 1:2308997/1‑150 (MQ=255) cAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATCACATCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCa > 1:614072/1‑150 (MQ=39) ggTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATc < 1:2138529/150‑1 (MQ=255) gTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGaa < 1:2031904/80‑1 (MQ=255) tAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggc > 1:1182734‑M2/1‑54 (MQ=255) tAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTg < 2:2314937/150‑1 (MQ=255) aGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGt > 1:1425275/1‑150 (MQ=255) gCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGa < 1:657429/150‑1 (MQ=255) gCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGa < 1:1830670/150‑1 (MQ=255) aGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGGGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACt > 1:160725/1‑150 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCt > 1:122812/1‑106 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCa < 2:1231562/150‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGt > 2:419500/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTACAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGc > 1:11786/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAg > 2:448074/1‑66 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAg < 1:448074/66‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGt > 1:682413/1‑147 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGt < 2:682413/147‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgc < 1:1791396‑M2/109‑74 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATc > 2:714979/1‑101 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATc < 1:714979/101‑1 (MQ=255) cgGGTAACCCCGCTCCTAGCGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAACCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAg < 2:1580777/150‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccggtactgccttacctggccagcaccaccaacttac > 1:577488‑M2/1‑31 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccggtactgccttacctggccagcaccaccaacttac < 2:577488‑M2/87‑57 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGTCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCaa < 1:516198/147‑1 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGTCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCaa > 2:516198/1‑147 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttaccggcgaagaggccgctactgccttacctg < 2:1351938‑M2/66‑38 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctg > 1:1351938‑M2/1‑29 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGc > 2:2297610/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCg > 2:801753/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGACGAGGCCGGAACAGGTTGCACACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGACTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGCGCATGTGGTGACTGCGCAGTGCATTGAAGGTCTGCTCGAc > 2:1921511/1‑150 (MQ=255) ttcTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACAt > 2:2233684/3‑150 (MQ=255) cTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGt > 2:1878219/1‑126 (MQ=255) tACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGAc > 2:1307062/1‑145 (MQ=255) gACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCgt > 2:297040/1‑150 (MQ=255) cGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCgtggt < 1:2297610/150‑1 (MQ=255) cGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGACGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCgtggt < 2:160725/150‑1 (MQ=255) cGTGCAGGGTTTACCAGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCgtggt < 2:2219952/150‑1 (MQ=255) gTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCa < 2:412235/121‑1 (MQ=255) gTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCa > 1:412235/1‑121 (MQ=255) gCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGcc > 1:1093436/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGAATCTGGTGGCTGCGGAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGcc > 2:1593263/1‑150 (MQ=255) | GGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCAT > NC_002947/5943552‑5943848 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |