| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 591,085 | 0 | T | C | 5.4% | 323.5 / 3.9 | 105 | V110A (GTG→GCG) | PP_0501 | NAD‑dependent epimerase/dehydratase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (49/50); new base C (4/2); total (53/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.78e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TGCAGGGCTGGTCACTCAGGCTGCGGCTGGCTGCCGTGCTGTGGTGCATCTGGCGGCGGTAGCGTCGGTTCAGGCATCGGTCGAAGACCCGGTGCGTACCCACCAGAGTAACTTCATCGGTACCCTCAACGTTTGCGAAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCTGGACTTCT > NC_002947/590936‑591234 | tGCAGGGCTGGTCACTCAGGCTGCGGCTGGCTGCCGTGCTGTGGTGCATCTGGCGGCGGTAGCGTCGGTTCAGGCATCGGTCGAAGACCCGGTGCGTACCCACCAGAGTAACTTCATCGGTACCCTCAACGTTTGCGAAGCCATGCGCGt < 1:180651/150‑1 (MQ=255)tGCAGGGCTGGTCACTCAGGCTGCGGCTGGCTGCCGTGCTGTGGTGCATCTGGCGGCGGTAGCGTCGGTTCAGGCATCGGTCGAAGACCCGGTGCGTACCCACCAGAGTAACTTCATCGGTACCCTCAACGTTTGCGAAGCCATGCGCGt < 2:233903/150‑1 (MQ=255) gCAGGGCTGGTCACTCAGGCTGCGGCTGGCTGCCGTGCTGTGGTGCATCTGGCGGCGGTAGCGTCGGTTCAGGCATCGGTCGAAGACCCGGTGCGTACCCACCAGAGTAACTTCATCGGTACCCTCAACGTTTGCGAAGCCATGCGCGTg < 2:421413/150‑1 (MQ=255) 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cacgCCATGCACGCGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATg < 1:1633342/67‑1 (MQ=38) acgCCATGCACGCGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGGAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGAAACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTg > 1:892963/3‑128 (MQ=255) acgCCATGCACGCGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTg < 2:892963/126‑1 (MQ=255) aaGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGt < 1:1842868/150‑1 (MQ=255) gCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTAc < 1:18101/150‑1 (MQ=255) ccATGCGCGTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTAcc > 1:1987203/1‑150 (MQ=255) aTGCGCGTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATg < 1:2220371/64‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATg < 1:2220367/64‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATg > 2:2220371/1‑64 (MQ=255) aTGCGCGTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATg > 2:2220367/1‑64 (MQ=255) aTGCGCGTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGAccc < 2:811265/112‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCTg < 2:1836964/150‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCTg > 1:2196166/1‑150 (MQ=255) aTGCGCGTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCTg > 2:255896/1‑150 (MQ=255) gcgcGTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCTGGa < 1:218535/150‑1 (MQ=255) cgcgTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCTGGAc < 2:2196166/150‑1 (MQ=255) gcgTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTActaccgcg > 2:2053629/1‑143 (MQ=255) cgTGCATGGCGTGCGC‑‑CGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCTGGACtt < 1:443559/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |