| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 122,650 | A→C | 7.7% | R103R (CGT→CGG) | PP_0116 ← | putative lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 122,650 | 0 | A | C | 7.7% | 252.8 / 12.9 | 91 | R103R (CGT→CGG) | PP_0116 | putative lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/45); new base C (3/4); total (42/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.62e-01 | |||||||||||
GCGCTGTCGGGTCGATGATGCGTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGTTCCAGGCGTGCATCATCCGGCGACTGGGCCTGCAGAGCT > NC_002947/122505‑122785 | gcgcTGTCGGGTCGATGATGCGTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACggg < 2:560488/150‑1 (MQ=255) ggacGGGTCGAGGATGCGTGCCTCGGGCTAGGCTTTGACGGCTTTCATCGCCGCTTCAGCCTTTTTCAGCTCGTCCTTGCTAGGCTGGGTCACGGCATCCCCCCCAGTGACCCCTAGCGCCTACGGCATCAGGGCCCCGTCACGGGCCAg > 2:150467/4‑150 (MQ=255) tCGGGTCGATGATGCGTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGTGCCCGGGccctga < 2:1348454/150‑5 (MQ=255) gggTCGATGATGCGTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGcgcg > 2:1979694/1‑150 (MQ=255) ggTCGATGATGCGTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCgg < 2:937507/150‑1 (MQ=255) atgatgCGTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCt < 1:226815/150‑1 (MQ=255) tgatgCGTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTg < 2:1216300/150‑1 (MQ=255) gatgCGTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGTGCCCGGGccctgat < 1:1053166/141‑6 (MQ=255) gatgCGTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGTGCCCGGGccctgat > 2:1053166/1‑136 (MQ=255) gatgCGTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGc > 1:2062141/1‑150 (MQ=255) cGTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCcgcg > 2:297010/1‑150 (MQ=255) cGTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCcgcg < 1:1979694/150‑1 (MQ=255) gTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGt > 2:1053659/1‑150 (MQ=255) gTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGt > 2:1760434/1‑150 (MQ=255) gTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCAGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGt > 1:1626164/1‑150 (MQ=255) tGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGt‑t < 2:595735/150‑1 (MQ=255) tGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTCCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGt‑t < 1:226111/150‑1 (MQ=255) tCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑Tcaca > 2:2220501/1‑150 (MQ=255) cGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACAt > 2:2205688/1‑150 (MQ=255) cttggcttCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCggt < 1:1248888/150‑3 (MQ=255) cttggcttCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGcc < 2:2062141/150‑1 (MQ=255) ttCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTg > 1:1069136/1‑150 (MQ=255) gcggcTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAgg > 2:1774528/1‑150 (MQ=255) tttCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCAc < 2:5715/101‑1 (MQ=255) tttCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCAc > 1:5715/1‑101 (MQ=255) tttCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGAt > 2:1285360/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCt > 1:2113145/1‑150 (MQ=255) aGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGTGCCCGGGccc > 2:250454/1‑102 (MQ=255) aGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGTGCCCGGGccc < 1:250454/103‑2 (MQ=255) gcgcCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGCCCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGACCTGGc > 2:723671/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGACCTgtc > 2:1079534/1‑148 (MQ=255) ccgcTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGc < 1:378525/112‑1 (MQ=255) ccgcTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGc > 2:378525/1‑112 (MQ=255) ctgcAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACgg > 1:2334933/4‑92 (MQ=255) cTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACgg < 2:2334933/92‑1 (MQ=255) tCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGt‑t < 1:2335707/113‑1 (MQ=255) tCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGt‑t > 2:2335707/1‑113 (MQ=255) ccAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGc < 1:230740/149‑1 (MQ=255) aGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCTGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATAAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAg < 2:1687223/150‑1 (MQ=255) ccTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGAc > 2:1147416/1‑130 (MQ=255) ccTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGAc < 1:1147416/130‑1 (MQ=255) cTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGt‑t < 2:686897/108‑1 (MQ=255) cTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGt‑t > 1:686897/1‑108 (MQ=255) ttttCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGAt < 1:1641771/131‑1 (MQ=255) ttttCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGAt > 2:1641771/1‑131 (MQ=255) ccAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCAACTA‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCtt > 1:1310972/1‑150 (MQ=255) cAGCTCGGCCTTGCGAGCCTAGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTc < 1:1056147/150‑1 (MQ=255) aGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCg < 1:1285360/150‑1 (MQ=255) aGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCg < 1:278665/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGc < 2:1054047/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGc < 2:2204326/150‑1 (MQ=255) ggCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCAGCCAGTAACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGAGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAg > 2:404846/1‑150 (MQ=255) cTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTg < 1:2220501/150‑1 (MQ=255) ttGCGAGCCTGGGTCGAGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGTGCCCGGGccc > 2:1391741/1‑72 (MQ=255) ttGCGAGCCTGGGTCGAGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGTGCCCGGGccc < 1:1391741/73‑2 (MQ=255) ttGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTgg > 1:957100/1‑150 (MQ=255) tgggAGCCTGGGTCAAGCCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGgc < 2:1302292/147‑1 (MQ=255) aGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTg < 1:1774528/150‑1 (MQ=255) ccTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGAGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTGCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGt > 1:2231523/1‑150 (MQ=255) gggTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATc < 2:1738327/107‑1 (MQ=255) gggTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATc > 1:1738327/1‑107 (MQ=255) gTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTg > 1:630631/1‑143 (MQ=255) gTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTg < 2:630631/143‑1 (MQ=255) aCGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGTTcc > 1:978434/1‑150 (MQ=255) cGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCt < 2:1295324/90‑1 (MQ=255) cGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCt > 1:1295324/1‑90 (MQ=255) cGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGTTCCa < 1:597987/150‑1 (MQ=255) cATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGTTCCAGGc < 2:978434/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGTGACCGCTGGCGCGTGCGGCATCAGTGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGTCTCGGTTTTGCC‑ACGGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGTTCCAGGCGTGca < 2:671698/150‑1 (MQ=255) cGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGTTCCAGGCGTGcat > 1:1417728/1‑150 (MQ=255) tGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGTTCCAGGCGTGCATCATCCg < 1:1053659/150‑1 (MQ=255) aCCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGTTCCAGGCGTGCATCATCCGGc > 1:696095/1‑150 (MQ=255) cGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCt > 2:568063/1‑71 (MQ=255) cGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCt < 1:568063/71‑1 (MQ=255) gCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGTTCCAGGCGTGCATCATCCGGCGAc < 1:1116557/150‑1 (MQ=255) cgcCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTAGCGCTGGTATTGTTCCAGGCGTGCATCATCCGGCGACTGGGc < 2:2113145/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGTTCCAGGCGTGCATCATCCGGCGACTGGGCCt < 2:1626164/150‑1 (MQ=255) tGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGc < 1:354763/84‑1 (MQ=255) tGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGc > 2:354763/1‑84 (MQ=255) cATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTgg < 1:2040080/106‑1 (MQ=255) cATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTgg > 2:2040080/1‑106 (MQ=255) aTCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGTCCAGTTGGCGCTGGTATTGTTCCAGGCGTGCATCATCCGGCGACTGGGCCTGCAGAGCt < 2:1486513/150‑1 (MQ=255) aTCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGTTCCAGGCGTGCATCATCCGGCGACTGGGCCTGCAGAGCt < 1:1760434/150‑1 (MQ=255) gggCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCa > 2:1337596/1‑75 (MQ=255) gggCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCa < 1:1337596/75‑1 (MQ=255) gCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGtt < 1:2174248/106‑1 (MQ=255) gCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGtt > 2:2174248/1‑106 (MQ=255) ccGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATc > 1:2243145/1‑58 (MQ=255) ccGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATc < 2:2243145/58‑1 (MQ=255) ccGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCt > 2:1326457/1‑95 (MQ=255) ccGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCt < 1:1326457/95‑1 (MQ=255) | GCGCTGTCGGGTCGATGATGCGTGCCTCGGGCTTGGCTTCGGCGGCTTTCAGCGCCGCTTCAGCCTTTTCCAGCTCGGCCTTGCGAGCCTGGGTCACGGCATCCCCGCCAGTGACCGCTGGCGCCTGCGGCATCAGGGCCCGGGCACGGGCCAGCGCGGTAGCTGCCGCGT‑TCACATCGCCCTTCTGCAGGACGATCTGGCTACGTTGCAGGTAAGCTTCGGCCAGTTGGCGCTGGTATTGTTCCAGGCGTGCATCATCCGGCGACTGGGCCTGCAGAGCT > NC_002947/122505‑122785 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |