| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 138,700 | G→A | 6.0% | R534Q (CGG→CAG) | PP_0131 → | membrane‑anchored phosphodiesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 138,700 | 0 | G | A | 6.0% | 245.5 / 3.1 | 82 | R534Q (CGG→CAG) | PP_0131 | membrane‑anchored phosphodiesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/32); new base A (2/3); total (47/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
CGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTT > NC_002947/138552‑138847 | cGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGcggcgg < 2:1997341/150‑1 (MQ=255)cGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGcggcgg < 2:363864/150‑1 (MQ=255) gTAATTGCCGAAGGAATCGAGTCCACGCAGGAGGCGGTGCTGCTGAACAGGGAGGGGGTCAATTATGGCCCGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGTTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGgtg > 1:1816327/1‑150 (MQ=255) aTTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAg < 2:457889/150‑1 (MQ=255) aTTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAg < 2:346347/150‑1 (MQ=255) ttGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCCGCAGCGGCAGgtgccca < 1:124578/150‑5 (MQ=255) cGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGcgcg > 2:1174365/1‑150 (MQ=255) cGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGcgcg > 1:1557386/1‑150 (MQ=255) gAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGt > 2:2168131/1‑150 (MQ=255) gAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGt < 1:1219228/150‑1 (MQ=255) gAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGt < 1:2288451/150‑1 (MQ=255) aGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCg > 2:224826/1‑150 (MQ=255) aTCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGc < 2:188477/150‑1 (MQ=255) tCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCg > 1:1249721/1‑150 (MQ=255) gTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCa < 2:1043640/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAg > 2:1179366/1‑150 (MQ=255) gAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGAcc > 2:1237295/1‑150 (MQ=255) gAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGAcc < 1:2198235/150‑1 (MQ=255) gACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAgg > 2:605581/1‑127 (MQ=255) gACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAgg < 1:605581/127‑1 (MQ=255) cAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAAc < 2:1506834/150‑1 (MQ=255) gctgctGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTa < 1:1174365/150‑1 (MQ=255) gctgctGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGCGCCTCTTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTa > 2:663423/1‑150 (MQ=255) tgctgAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGa > 2:2216726/1‑150 (MQ=255) tgAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACt > 1:385445/1‑150 (MQ=255) aaCAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGTGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGTCGCTCGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTgg < 2:1816327/150‑1 (MQ=255) aaCAGCGAGGGGGGCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGNGTGNAGGCNCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTgg < 1:1818411/150‑1 (MQ=255) gggggTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTg < 2:1249721/150‑1 (MQ=255) ggTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTgg < 1:2286048/139‑1 (MQ=255) ggTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTgg > 2:2286048/1‑139 (MQ=255) aaTTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGc > 1:1598510/1‑150 (MQ=255) ttATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCcg > 1:730660/1‑150 (MQ=255) ttATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCCGCCGCGGCAGgtgcc > 2:1613060/1‑88 (MQ=255) ttATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCCGCCGCGGCAGgtgcc < 1:1613060/90‑3 (MQ=255) ccAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGaaaa > 1:1054067/1‑150 (MQ=255) aGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAaca < 1:1662557/150‑1 (MQ=255) gCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATc > 1:1183304/1‑96 (MQ=255) gCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATc < 2:1183304/96‑1 (MQ=255) cTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGCACTAGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGCAAACCCGcc > 2:419189/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGcc > 1:824959/1‑150 (MQ=255) tGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGTCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGccc > 2:346504/1‑150 (MQ=255) tGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGccc > 2:1798479/1‑150 (MQ=255) tttGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATgcgc < 1:2216726/150‑1 (MQ=255) cccGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCg > 1:1583704/1‑76 (MQ=255) cccGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCg < 2:1583704/76‑1 (MQ=255) cccGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGcgcccgc > 1:618821/1‑150 (MQ=255) tcagCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGcgcccgcc > 1:1616349/4‑150 (MQ=255) ccGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGcgcccgcc > 1:1680419/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTg > 1:82337/1‑150 (MQ=255) ccGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGc > 2:2313766/1‑75 (MQ=255) ccGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGc < 1:2313766/75‑1 (MQ=255) cTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGc > 1:201734/1‑150 (MQ=255) tGAACGCCCGGCAATTTCCCGAGTCGACAATTATTGGACCCCTGCCTCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCAAGCGCCCGCCGTGCAGCt < 2:1191829/150‑1 (MQ=255) ccGGCAGCTTGCCGAGACGGCGCCCCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTTTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAAt > 2:616101/1‑150 (MQ=255) cGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAAtt < 2:1598510/150‑1 (MQ=255) gCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGAGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTc > 2:1811667/1‑150 (MQ=255) cAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTcc < 1:2168131/150‑1 (MQ=255) aGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCt < 2:1189198/150‑1 (MQ=255) aGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCt < 1:1600409/150‑1 (MQ=255) aGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACCCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCt > 1:1043564/1‑150 (MQ=255) gTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGCAGCGATCAGTCCGTCAACGCCATGTCGGTCTGGGCCCACTGCCCCTACCGCCAATCCATGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCtt < 1:1798479/150‑1 (MQ=255) tttGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATACGCCGGCCGTGCATCTGCACAATTTCCTTg > 2:462928/1‑150 (MQ=255) cGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAg > 1:995177/1‑150 (MQ=255) gAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAgc < 1:1237295/150‑1 (MQ=255) tGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGa < 2:618821/150‑1 (MQ=255) tGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGa < 1:1376981/150‑1 (MQ=255) tGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGcc > 1:360367/1‑150 (MQ=255) tGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCcccagccc > 2:930432/1‑150 (MQ=255) 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2:2182993/1‑52 (MQ=255) ccgCCGCGGCAGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGc < 2:356537/86‑1 (MQ=255) ccgCCGCGGCAGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGc > 1:356537/3‑88 (MQ=255) tGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCGGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGcgccgc > 2:1012779/1‑150 (MQ=255) tGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGa > 2:1698647/1‑132 (MQ=255) tGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGa < 1:1698647/132‑1 (MQ=255) tGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGcgccgc > 1:798895/1‑150 (MQ=255) tGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGcgccgc > 1:353298/1‑150 (MQ=255) gCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCgccgcc > 2:317382/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCt > 1:827463/1‑150 (MQ=255) ctcggcggGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCtt < 1:2303588/148‑1 (MQ=255) gcggGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCtt < 2:353298/150‑1 (MQ=255) gcggGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCtt < 1:1622758/150‑1 (MQ=255) | CGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGTAGAACTGGGTCCCCTGCCCCGGCCGCGAAAACACGCCCATGCGCCCGCCGTGCAGCTGCACAATTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTT > NC_002947/138552‑138847 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |