| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 999,628 | C→G | 5.9% | G165A (GGC→GCC) | PP_0861 ← | outer membrane ferric siderophore receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 999,628 | 0 | C | G | 5.9% | 323.6 / 10.4 | 103 | G165A (GGC→GCC) | PP_0861 | outer membrane ferric siderophore receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (48/48); new base G (3/3); total (51/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.31e-01 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TCAGGCGACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCG > NC_002947/999479‑999770 | tCAGGCGACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGgccgcgc < 2:285144/150‑1 (MQ=255) ggCGACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGgccgcggcgc > 2:366696/1‑150 (MQ=255) gCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGGCGCGGccggcg < 1:366696/150‑5 (MQ=255) gCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCg > 2:2076442/1‑150 (MQ=255) aCGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGGCGCGGccggcggtc < 2:1606013/150‑8 (MQ=255) gTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGTTTCCGGACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGcc > 2:1230272/1‑150 (MQ=255) gTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGACGGcc < 2:1844781/150‑1 (MQ=255) cGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGt < 1:2076442/150‑1 (MQ=255) gCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGtt > 1:1682873/1‑150 (MQ=255) cTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTc > 2:1911644/1‑150 (MQ=255) cTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCAAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTc > 1:1167905/1‑150 (MQ=255) tGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTCAAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCg > 1:315726/1‑150 (MQ=255) aaCTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGc > 1:1271481/1‑150 (MQ=255) gTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCACtt > 1:1169948/1‑150 (MQ=255) tAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCACCAGGTCCAGGGTCCGGCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTg < 1:1686442/150‑1 (MQ=255) aGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTgg < 1:1381448/150‑1 (MQ=255) gTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGTTACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGc < 1:1230272/150‑1 (MQ=255) gTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGc < 2:832885/150‑1 (MQ=255) ttGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGcc > 2:1389364/1‑150 (MQ=255) ccATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACt > 2:290271/1‑150 (MQ=255) cATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGccgcgccgcg < 1:1265644/115‑1 (MQ=255) cATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGccgcgccgcg > 2:1265644/1‑115 (MQ=255) cATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCCCCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACtt > 2:862330/1‑150 (MQ=255) cATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGc > 1:1282459/1‑145 (MQ=255) cATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGc < 2:1282459/145‑1 (MQ=255) cATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACtt < 2:2193823/150‑1 (MQ=255) cATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACtt > 1:16628/1‑150 (MQ=255) tCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCa > 2:838283/1‑150 (MQ=255) cGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCaa < 1:838283/150‑1 (MQ=255) gAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCCCTTCAAc > 1:976151/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAAc > 1:1611076/1‑150 (MQ=255) gtgtAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGAt < 1:1627186/150‑1 (MQ=255) tgtAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGAtt < 2:1030104/150‑1 (MQ=255) tAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCg < 1:814276/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGACCACTTCAACAGATTCGAt < 1:761991/150‑1 (MQ=255) tGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGAtt > 2:1201191/1‑150 (MQ=255) tGGTCGCTGCCCCAGGTCAAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGAtt < 2:1167905/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTc > 1:1999439/1‑150 (MQ=255) tCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTcg < 1:1182145/150‑1 (MQ=255) cgatGCGCCACGTCGAGGCGCCGCCCAGCGGGTTCCCCAGATGCGCGGGCTTGCTTACCAGGTTGATGGGACCGCCGGCGGCGCCGCGGCCTCCGATGGCCGCGTTAGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGGTTCGATGGCGAAGATTTcgc < 2:372566/147‑1 (MQ=255) gCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTcgcg > 1:1408527/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCATATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTAAGCGCTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTg > 1:23064/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTg > 1:1029822/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTAACAAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTg > 1:1812011/1‑150 (MQ=255) tCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTgg > 1:370597/1‑105 (MQ=255) tCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTgg < 2:370597/105‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGgcgc < 1:1546329/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAAGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAgtg < 1:1911644/150‑1 (MQ=255) cgcCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAgtgt < 1:2015746/150‑1 (MQ=255) ccGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTg > 2:534346/1‑96 (MQ=255) cGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTcac < 2:834739/150‑1 (MQ=255) ccAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTcacgca > 2:578751/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTcacgcac < 1:1389364/150‑1 (MQ=255) aGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATgg < 1:2000462/73‑1 (MQ=255) aGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATgg > 2:2000462/1‑73 (MQ=255) gCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTg < 1:1911641/89‑1 (MQ=255) gCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTg > 2:1911641/1‑89 (MQ=255) gTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTc < 2:1408527/150‑1 (MQ=255) tGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCa < 2:1999439/150‑1 (MQ=255) gCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAg < 2:1877574/150‑1 (MQ=255) ccAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTc > 2:1223265/1‑88 (MQ=255) ccAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTc < 1:1223265/88‑1 (MQ=255) cAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTa > 2:2034289/1‑150 (MQ=255) tGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTa < 2:1169948/150‑1 (MQ=255) ttgcttACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTgg > 2:1557670/1‑150 (MQ=255) ttgcttACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTgg > 1:900852/1‑150 (MQ=255) tgcttACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTggg < 2:257137/150‑1 (MQ=255) gcttACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGc > 1:318358/1‑150 (MQ=255) ttACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGt > 1:2326404/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGa > 2:1273237/1‑150 (MQ=255) cAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGAtt > 2:1332269/1‑88 (MQ=255) cAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGaa < 1:1932620/150‑1 (MQ=255) cAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGaa > 2:268633/1‑150 (MQ=255) cAGGTTGATGGTACCGCCAGCCACGAAGACCACCTCGATGGCCTTGTTCGGGCTTTTTGCCACTTAAAAAACGTTGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCCaa < 1:521172/150‑1 (MQ=255) cAGGTTGATGGTACCGCAGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGAtt < 1:1332269/88‑1 (MQ=255) ggTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTAGCCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGc < 1:1227704/150‑1 (MQ=255) ttGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGTCGGCGAATCcg > 2:59064/1‑150 (MQ=255) tGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCTCTTGACAGCATGAATAAAGCCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCcgc < 1:862330/150‑1 (MQ=255) tGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCAACGGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCCATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGNGTCACCNACGCCGTCCAGGNAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCcgc < 1:2284976/150‑1 (MQ=255) aTGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCgg < 1:290271/150‑1 (MQ=255) ggTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGTCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGAt > 2:2081176/1‑150 (MQ=255) tACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCTAGTTCGGcccc < 2:573503/44‑1 (MQ=255) tACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGcccc > 1:573503/1‑44 (MQ=255) tcggtggccgCGGCGCGGCCGGCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTc < 1:339577/129‑1 (MQ=255) tcggtggccgCGGCGCGGCCGGCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTc > 2:339577/6‑134 (MQ=255) ccgccgGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAg < 1:493492/72‑1 (MQ=255) ccgccgGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAg > 2:493492/1‑72 (MQ=255) ccgccgGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGt < 2:818188/115‑1 (MQ=255) ccgccgGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGt > 1:818188/1‑115 (MQ=255) ccgccgGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGc < 2:289075/124‑1 (MQ=255) ccgccgGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAAc < 2:1682873/150‑1 (MQ=255) ccgccgGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCAGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGc > 1:289075/1‑124 (MQ=255) cgccgGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACg > 1:1216801/1‑150 (MQ=255) gccggccgCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACgg > 1:1269340/1‑150 (MQ=255) gtggccgCGGCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACggg > 1:2258112/3‑150 (MQ=255) tggccgCGGCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGc > 2:47872/2‑150 (MQ=255) cggccgCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGc > 2:343528/1‑150 (MQ=255) ggccgCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCg < 1:2081176/150‑1 (MQ=255) gccgcgccgcGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTggg < 2:2220029/124‑1 (MQ=255) gccgcgccgcGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTggg > 1:2220029/1‑124 (MQ=255) | TCAGGCGACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCG > NC_002947/999479‑999770 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |