| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,199,349 | C→G | 5.6% | T66T (ACC→ACG) | gspF → | protein secretion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,199,349 | 0 | C | G | 5.6% | 334.6 / 10.1 | 108 | T66T (ACC→ACG) | gspF | protein secretion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (48/54); new base G (3/3); total (51/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
AGGCCAGCCTGCAGGCTGACAGTGAACGCCACGCCCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCT > NC_002947/1199201‑1199498 | aGGCCAGCCTGCAGGCTGACAGTGAACGCCACGCCCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGAccc < 2:42827/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTGACAGTGAACGCCACGCCCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACACCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGc > 2:1561180/1‑150 (MQ=255) ggCTGACAGTGAACGCCACGCCCGCCAGCTGTTGTGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCAc < 1:1631187/150‑1 (MQ=255) tGACAGTGAACGCCACGCCCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCtt > 2:744522/1‑150 (MQ=255) aCAGTGAACGCCACGCCCGCAAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCACGACGCCAGCGCGTTAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCAGTCAGCTGGCCACCTTGa > 2:1019697/1‑150 (MQ=255) aGTGAACGCCACGCCCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGAcc < 1:569702/150‑1 (MQ=255) gTGAACGCCACGCCCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCg > 2:368456/1‑150 (MQ=255) aaCGCCACGCCCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCgg‑gg > 1:2162484/1‑150 (MQ=255) aaCGCCACGCCCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGAGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCgg‑gg < 1:409238/150‑1 (MQ=255) cgccacgccCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGcc < 2:378929/150‑1 (MQ=255) gccacgccCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTTCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCg > 2:1497000/1‑150 (MQ=255) gccacgccCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCg > 2:290534/1‑150 (MQ=255) gccacgccCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAACCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGGTCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCg > 2:848946/1‑150 (MQ=255) cacgccCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGc < 2:180534/150‑1 (MQ=255) cacgccCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGc > 1:1187186/1‑150 (MQ=255) ccgccAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGCCCACCGCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGCACTGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTcc < 1:1354889/150‑1 (MQ=255) ccgccAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGc < 1:1435335/141‑1 (MQ=255) ccgccAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGc > 2:1435335/1‑141 (MQ=255) ccgccAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTcc > 1:923717/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGt < 2:694851/115‑1 (MQ=255) ccAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGt > 1:694851/1‑115 (MQ=255) cAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTg < 1:972993/150‑1 (MQ=255) cAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTg < 1:244918/150‑1 (MQ=255) cTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTc < 1:820328/150‑1 (MQ=255) ttGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGAt < 1:1077643/150‑1 (MQ=255) ttGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCAGCAAGTTGCAGCGTCAGGACGCCGGCAGCCGAATACCCCGCCAACATCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGAt < 1:1797151/150‑1 (MQ=255) cgcgAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCCTGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCGTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGcc > 1:11230/1‑150 (MQ=255) gcgAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGccc > 2:1707529/1‑150 (MQ=255) gcgAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGccc > 2:905231/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGCCCTCTTCGCCCGCAAGTCGCCCCGTCATTACGCCGCCTGCCGACAACACCGACGCGAGCGCCTGACCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTCACCCGTCACCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCtt < 2:923623/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGc < 1:838095/149‑1 (MQ=255) ggCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGGCGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCAcc > 2:2259142/1‑150 (MQ=255) ggCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAg < 1:1837773/99‑1 (MQ=255) ggCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCAcc < 1:1434566/150‑1 (MQ=255) tGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTg > 2:859857/1‑150 (MQ=255) gcccgccAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACgg < 1:1882774/150‑1 (MQ=255) gcccgccAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACgg < 1:880117/150‑1 (MQ=255) cccgccAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGc < 1:740019/150‑1 (MQ=255) ccgccAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCa > 1:628369/1‑150 (MQ=255) cgccAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACGGGTCAGCtcaca > 1:499513/1‑89 (MQ=255) cgccAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACGGGTCAGCtcaca < 2:499513/93‑5 (MQ=255) cgccAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACGGGTCAGCtcaca > 1:1705486/1‑89 (MQ=255) cgccAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACGGGTCAGCtcaca < 2:1705486/93‑5 (MQ=255) gccAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGGCGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGc > 1:2231593/1‑91 (MQ=255) gccAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGc < 2:2231593/91‑1 (MQ=255) cAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTg > 2:1743125/1‑150 (MQ=255) aGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGc < 2:1773264/150‑1 (MQ=255) aGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGc < 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cGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGaa < 1:57772/132‑1 (MQ=255) cATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGcctgcc > 2:1100373/1‑150 (MQ=255) cGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGca < 2:1930356/150‑1 (MQ=255) ccGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGcaca < 2:633717/150‑1 (MQ=255) tccAGCTGACAACCCCGACGTCAGCGCCTGAGCCGCGCCTAGCTTTGTGAGCTTATCCGTCAGCTGGCCCGCCT‑ACCGGTCGCCACGATTCTCTTCGTCGATGTCCTTCCCACCCTTGCCCTGCTCCTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAgt < 2:37903/148‑1 (MQ=255) ggCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCtt < 2:1059815/95‑1 (MQ=255) 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gcCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAg > 1:721386/1‑113 (MQ=255) gcCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAg < 2:721386/113‑1 (MQ=255) gcCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAggc < 1:2259142/150‑1 (MQ=255) cccAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGCAggcc > 2:429913/1‑150 (MQ=255) cccAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAggcc < 1:744522/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCt > 2:271914/1‑125 (MQ=255) cAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTgc < 2:758238/127‑1 (MQ=255) cAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAggcctg < 1:855882/150‑1 (MQ=255) aGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACCCGCCGAAggcctgg < 2:1750047/150‑1 (MQ=255) cTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAggcctgggc < 1:1100373/150‑1 (MQ=255) tgtgtgAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAggcctgggcc < 2:262593/150‑1 (MQ=255) gtgAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGcc < 1:2020553/59‑1 (MQ=255) gtgAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGcc > 2:2020553/1‑59 (MQ=255) gtgAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGgcctgggcctgg < 2:340290/150‑1 (MQ=255) gtgAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGgcctgggcctgg < 1:848946/150‑1 (MQ=255) aGCTGACGGGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTg > 1:913845/1‑116 (MQ=255) aGCTGACGGGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTg < 2:913845/116‑1 (MQ=255) gACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCtggt < 1:901781/105‑1 (MQ=255) gACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCtggt > 2:901781/1‑105 (MQ=255) gACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGccc < 2:1993148/146‑1 (MQ=255) gACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAg > 2:1363851/1‑150 (MQ=255) ccGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGcc > 1:1314709/1‑142 (MQ=255) ccGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGcc < 2:1314709/142‑1 (MQ=255) ccGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCt > 1:1339981/1‑150 (MQ=255) | AGGCCAGCCTGCAGGCTGACAGTGAACGCCACGCCCGCCAGCTGTTGCGCGAGCAGGGCCTGTTCGCCCGCCAGTTGCAGCGTCATGACGCCGGCAGCCGACAACCCCGACGCCAGCGCCTGAGCCGCGCCCAGCTGTGTGAGCTGACCCGTCAGCTGGCCACCTTGACCGG‑GGCCGGCATTCCCTTGGTCGATGCCCTTGCCACCCTTGAACGGCAACTGCGTCAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCT > NC_002947/1199201‑1199498 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |