Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,307,446 | C→G | 9.1% | G60R (GGC→CGC) | livK ← | branched‑chain amino acids ABC transporter substrate‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,307,446 | 0 | C | G | 9.1% | 274.7 / 17.3 | 88 | G60R (GGC→CGC) | livK | branched‑chain amino acids ABC transporter substrate‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/36); new base G (4/4); total (48/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.41e-01 |
GCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCGGCCAGTACCA > NC_002947/1307301‑1307592 | gctggctgGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCcgcg > 1:944028/1‑150 (MQ=255) tggctggGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCgcggc > 1:823531/1‑150 (MQ=255) gctggGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGt < 1:640138/150‑1 (MQ=255) ggTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCTTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGat < 1:461088/150‑1 (MQ=255) ggTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCAACGCCGCGGGCGGCGTGGat < 2:145939/150‑1 (MQ=255) tggagctggagcACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCAACGCCGCGGGCGGCGTGGat < 1:573832/148‑1 (MQ=255) tggagctggagcAAAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCAACGCCGCGGGCGGCGTGGat > 2:573832/1‑148 (MQ=255) gctggagcACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCtt > 2:1454313/1‑150 (MQ=255) gctggagcACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCtt > 1:621521/1‑150 (MQ=255) tggagcACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCTTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGa < 1:631645/150‑1 (MQ=255) gagcACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATg > 2:1702471/1‑150 (MQ=255) aGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGa < 1:322604/142‑1 (MQ=255) aGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGa > 2:322604/1‑142 (MQ=255) gTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGgcttgctt > 2:159287/1‑150 (MQ=255) gTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGgcttcctt > 1:249549/1‑150 (MQ=255) gCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGgc > 1:1817834/1‑150 (MQ=255) cGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGgcgc < 1:2184957/150‑1 (MQ=255) aCCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCGGGCGGCGt < 2:1522500/121‑1 (MQ=255) aCCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCGGGCGGCGt > 1:1522500/1‑121 (MQ=255) ccACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTCTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTCGCTTGGCACCGa > 2:10235/1‑150 (MQ=255) cACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGAt > 1:1671207/1‑150 (MQ=255) cACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGAt > 2:1825581/1‑150 (MQ=255) cACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGAt > 1:716080/1‑150 (MQ=255) ttGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGc < 1:1496852/150‑1 (MQ=255) ttGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGc < 1:318486/150‑1 (MQ=255) tGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCa < 1:1825581/150‑1 (MQ=255) aCGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATg < 1:2103478/150‑1 (MQ=255) tcgtTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCg < 2:31235/150‑1 (MQ=255) ttGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATgg < 2:729816/115‑1 (MQ=255) ttGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATgg > 1:729816/1‑115 (MQ=255) aCCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTgg > 1:584986/1‑150 (MQ=255) aCCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTgg < 2:1817834/150‑1 (MQ=255) aCTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCCTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTc < 2:2070937/150‑1 (MQ=255) cTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCa > 1:665838/1‑150 (MQ=255) tttGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTGCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCAc > 1:1336455/1‑150 (MQ=255) tgttgGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACgg < 2:1400561/150‑1 (MQ=255) gttgGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACggg > 1:788407/1‑150 (MQ=255) gttgGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACggg < 1:1499485/150‑1 (MQ=255) ttgGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGa > 2:35952/1‑150 (MQ=255) gACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGt < 2:2032984/150‑1 (MQ=255) tGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGCTGTCTTTCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCtt < 1:1454313/150‑1 (MQ=255) tGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACGTGGTCACGGGACCCGTCtt > 2:1535376/1‑150 (MQ=255) gagaCGGCCTGTTGAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCTCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATTGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCCCGGGACCCGTCTTg < 2:249549/147‑1 (MQ=255) gCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTg < 2:1609480/150‑1 (MQ=255) gCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTg < 1:1656200/150‑1 (MQ=255) ccACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTg < 1:2030351/130‑1 (MQ=255) ccACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTg > 2:2030351/1‑130 (MQ=255) ccACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTgg < 2:944028/150‑1 (MQ=255) ccACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTgg > 1:148112/1‑150 (MQ=255) aCGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGa > 1:1673458/1‑150 (MQ=255) gCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCg < 2:148112/150‑1 (MQ=255) cTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGc < 2:665838/150‑1 (MQ=255) tGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCg > 2:118376/1‑150 (MQ=255) ggTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGa > 1:77553/1‑150 (MQ=255) ggTCGCAGGCGTCGTCGTATTCATTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGa < 2:1973228/150‑1 (MQ=255) gTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGat > 2:1864951/1‑66 (MQ=255) gTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGat < 1:1864951/66‑1 (MQ=255) 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tcgtATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATcg > 1:1147717/1‑150 (MQ=255) cgtATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTCGCTATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATcgg < 1:512433/150‑1 (MQ=255) tATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGAccc < 1:1464795/111‑1 (MQ=255) tATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGAccc > 2:1464795/1‑111 (MQ=255) aTTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGa > 1:1237222/1‑75 (MQ=255) aTTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGa < 2:1237222/75‑1 (MQ=255) ttGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGAGGAGTTGCTCTAACTGCACGCTTGCTTGGCGCCGGGCAACGGCATGTCGCCGTACTGGGTCAGGGGAACCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAAc > 1:1212786/1‑150 (MQ=255) gCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGaa > 2:8189/1‑150 (MQ=255) cTTCTAGCAGCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAt > 2:1203243/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAtg < 1:159287/150‑1 (MQ=255) ttCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAtg > 1:806281/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAtg > 2:1635565/1‑150 (MQ=255) cGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAtggc < 1:118376/150‑1 (MQ=255) aTCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATggctggct > 1:1929124/1‑150 (MQ=255) aTCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATggctggct > 1:228942/1‑150 (MQ=255) tGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCgg < 1:469045/102‑1 (MQ=255) tGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCgg > 2:469045/1‑102 (MQ=255) gataTCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTAcccc > 1:2093390/4‑150 (MQ=255) cATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGTACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTAccc < 2:1957842/147‑1 (MQ=255) cATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTAccc > 1:1957842/1‑147 (MQ=255) aTCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGCTGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCgcc > 2:1974252/1‑148 (MQ=255) tcaaCGCCGCGGGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGAt > 2:2336102/4‑113 (MQ=255) tcaaCGCCGCGGGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGAt < 1:2336102/110‑1 (MQ=255) tCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCGGcc > 1:1259775/1‑150 (MQ=255) tCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGCGCTCCATCAGGGGACCGGCGATGCCGAGCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCGGcc > 1:145251/1‑150 (MQ=255) aaCGCCGCGGGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTGGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCAAGGGACCCGGCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCGGCCAg > 1:1355129/2‑150 (MQ=255) gccgccCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCGGCCAGTAc < 2:1892650/150‑1 (MQ=255) ccgcccgcGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATcggcg > 1:1433742/1‑117 (MQ=255) ccgcccgcGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATcggcg < 2:1433742/117‑1 (MQ=255) cgcccgcGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCGGCCAGTACCa > 1:957744/1‑150 (MQ=255) | GCTGGCTGGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATGTCGCCGTACTGGGTCACGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCGGCCAGTACCA > NC_002947/1307301‑1307592 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |