Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,625,249 | G→T | 5.2% | intergenic (+30/+27) | PP_1425 → / ← nadB | hypothetical protein/L‑aspartate oxidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,625,249 | 0 | G | T | 5.2% | 301.8 / 3.1 | 96 | intergenic (+30/+27) | PP_1425/nadB | hypothetical protein/L‑aspartate oxidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/52); new base T (3/2); total (42/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.51e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.04e-01 |
GTTGGCTGGGGGAAAGCCAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAGCTCGGCCACTT > NC_002947/1625101‑1625397 | gTTGGCTGGGGGAAAGCCAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGa < 1:1284928/150‑1 (MQ=255) tGGCTGGGGGAAAGCCAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGc < 2:2277743/150‑1 (MQ=255) tGGGGGCAAGCCAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCcgc > 1:1735240/1‑150 (MQ=255) tGGGGGAAAGCCAGGGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGGATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCcgc > 1:2135499/1‑150 (MQ=255) gggAAAGCCAGTCTATACCTCAGGAGGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGGGGTGGGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGaa < 1:1001759/150‑1 (MQ=255) ccAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCacg > 2:1796360/1‑150 (MQ=255) cAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCacga > 1:608453/1‑150 (MQ=255) cAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCacga > 1:2331249/1‑150 (MQ=255) tgtATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGc < 2:1211495/150‑1 (MQ=255) tgtATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCACTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGc < 2:647120/150‑1 (MQ=255) taCCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGat > 1:1708295/1‑150 (MQ=255) aCCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGCCGCCGtta < 2:2331249/150‑1 (MQ=255) ccTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGatat > 1:1090598/1‑150 (MQ=255) cTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATc < 2:1708295/150‑1 (MQ=255) tGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCACAGATCGAGCCCGCGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCgg < 2:1557734/150‑1 (MQ=255) tAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTaa > 2:834735/1‑150 (MQ=255) tAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTGGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGTGGCGAGCTG‑TGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTaa < 1:1570809/150‑1 (MQ=255) ggggCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAgg > 1:1933720/1‑150 (MQ=255) ggCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGTTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGAt < 1:341646/150‑1 (MQ=255) gCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATg > 2:802317/1‑150 (MQ=255) gCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGAGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATg < 1:540395/150‑1 (MQ=255) tGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGgt < 2:1933720/150‑1 (MQ=255) tGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGAGGTGAGCTG‑TGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGgt < 2:71100/150‑1 (MQ=255) gACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGgtg < 1:662398/150‑1 (MQ=255) cGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGT‑AGTCGTGGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTc < 1:1551929/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTc < 2:1420658/150‑1 (MQ=255) gAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTcc > 1:1958064/1‑150 (MQ=255) gCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATg > 1:816836/1‑142 (MQ=255) gCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATg < 2:816836/142‑1 (MQ=255) cATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTg < 1:802317/150‑1 (MQ=255) cATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTg < 1:72662/150‑1 (MQ=255) aTCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGACGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTgg > 1:1255669/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGCGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGc < 2:1260189/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTc > 2:780915/1‑150 (MQ=255) gcTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGt > 2:931853/1‑150 (MQ=255) ttGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTcc > 2:1374113/1‑150 (MQ=255) ttGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTcc > 1:1973251/1‑150 (MQ=255) tGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCa < 2:1735240/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAg < 2:1973251/150‑1 (MQ=255) ggTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCTGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTg < 2:548505/150‑1 (MQ=255) gTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATc > 1:38792/1‑104 (MQ=255) gTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATc < 2:38792/104‑1 (MQ=255) gTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTgg < 1:1374113/150‑1 (MQ=255) gTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTgg > 2:1831646/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGa < 2:1090598/150‑1 (MQ=255) tGAATTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGAt < 1:931853/150‑1 (MQ=255) aaGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCAGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATaa > 1:2185410/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATc < 2:1748199/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTCCTTCGCGGGCTCGCCCGCGAAgaa < 1:217582/83‑3 (MQ=38) gTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTCCTTCGCGGGCTCGCCCGCGAAgaa > 2:217582/1‑81 (MQ=38) ttCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATcc > 2:1033089/1‑150 (MQ=255) aGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAgt < 1:2117474/150‑1 (MQ=255) aGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAgt < 1:1070807/150‑1 (MQ=255) ggcggcGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAgtgtgt > 1:1201193/1‑150 (MQ=255) gcggcgCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAgtgtgt < 1:1647928/149‑1 (MQ=255) gcggcgCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAgtgtgt > 2:1647928/1‑149 (MQ=255) cTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGACCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTc > 1:948144/1‑150 (MQ=255) cTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAAAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCAAGTGTCTAATGCGAcccgc > 2:1661729/1‑148 (MQ=255) gCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCgg < 2:1201193/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAgtgt < 1:2167541/132‑1 (MQ=255) ggTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAgtgt > 2:2167541/1‑132 (MQ=255) gAGCCG‑GGCATAGCTCGAGACCGGGTTAGATTCTTTGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTTCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAGCCCTCTGCTTTc < 2:1255669/150‑1 (MQ=255) gAGCCG‑GGCATAGACCGAGCCCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTc < 1:696673/150‑1 (MQ=255) gCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCt > 2:2117442/1‑150 (MQ=255) g‑ggCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTgc < 1:780915/150‑1 (MQ=255) 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ggTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGACACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATCGAGTAATTGAACTCGTCCAGCATCCCCCGATAATCGCGTGTGTTATGAAACCTTCGGCTTTCCTTGCGCGGAATGGCTGAAAGGa > 2:780293/1‑150 (MQ=255) gTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGat > 1:1741395/1‑150 (MQ=255) aGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGCTAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGatcat < 2:1958064/150‑1 (MQ=255) gCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTTCGCTTCATGGCTGACAGGatcatc > 2:2292376/1‑150 (MQ=255) gCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGatcatc > 1:1359202/1‑150 (MQ=255) cttcttCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAgt < 2:920381/98‑1 (MQ=255) cttcttCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAgt > 1:920381/1‑98 (MQ=255) ttcttcGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATg > 2:1359866/1‑58 (MQ=255) ttcttcGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATg < 1:1359866/58‑1 (MQ=255) ttcttcGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAg > 1:1658675/1‑150 (MQ=255) tcttcGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAGc < 2:169902/150‑1 (MQ=255) cttcGCGGGCTCGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAGCt > 2:1867243/1‑150 (MQ=255) cttcGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATc < 2:1637933/91‑1 (MQ=255) cttcGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATc > 1:1637933/1‑91 (MQ=255) tcGCGGGCTCGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTcc > 2:1274573/1‑117 (MQ=255) tcGCGGGCTCGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTcc < 1:1274573/117‑1 (MQ=255) gcgGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGCATGGTGTCATTTGGCTCGTGCGGCAGCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAGCTCGGc < 1:275709/150‑1 (MQ=255) gCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAAt < 1:2134000/82‑1 (MQ=255) gCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAAt > 2:2134000/1‑82 (MQ=255) cGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGTCCTCGTCCACCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCTGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAGCTCGGCCACtt < 2:608453/150‑1 (MQ=255) | GTTGGCTGGGGGAAAGCCAGTGTATACCTCAGGATGCGCTAGGGGCTGACGAGCATCGGCGCTTGCGGGTGCGGTTGAAGTTCAGCCGGCGGCGCTGGGCTGCGGTGAGCCG‑GGCATAGATCGAGACCGGGTTAGCTTCTTCGCGGGCGAGCCCGCGAAGGCCACGACGCCGATATCAGAGCGGGTTAAGGATGGTGTCCTTGGCCTCGTCCAGCATCCCTGGATAATCCAGTGTGTAATGCAACCCTCGGCTTTCCTTGCGCTGCATGGCTGACAGGATCATCAGCTCGGCCACTT > NC_002947/1625101‑1625397 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |