| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,652,585 | A→G | 5.3% | I1409T (ATC→ACC) | PP_1449 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,652,585 | 0 | A | G | 5.3% | 280.0 / 3.1 | 94 | I1409T (ATC→ACC) | PP_1449 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (44/45); new base G (2/3); total (46/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 | |||||||||||
GTTGGACGCATCCAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAACCGGCCTTTTTCTCGACCTTGCCTCCCAGCGGCC > NC_002947/1652437‑1652732 | gTTGGACGCATCCAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGAt < 2:1426443/150‑1 (MQ=255) ttGGACGCATCCAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATg > 2:183195/1‑150 (MQ=255) ttGGACGCATCCAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCACATGATCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATg > 2:233136/1‑150 (MQ=255) ttGGACGCATCCAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGGCGCCTTTGGCCGTCAGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATg > 2:1009989/1‑150 (MQ=255) tGGACGCATCCAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGGTgg < 1:1040476/150‑2 (MQ=255) ggACGCATCCAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGcc > 2:342564/1‑150 (MQ=255) ggACGCATCCAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGcc < 1:487171/150‑1 (MQ=255) cGCATCCAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTc < 2:346901/150‑1 (MQ=255) ccAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTAGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGCACGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCgctgc > 2:776749/1‑150 (MQ=255) cAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCgctgct > 1:1540902/1‑150 (MQ=255) cAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCgctgct > 1:2157455/1‑150 (MQ=255) cAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACATGCAGGTCGATGCCGTCgctgct > 1:645874/1‑150 (MQ=255) aaCGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCtt > 2:2223443/1‑150 (MQ=255) aaCGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCtt < 1:2312417/150‑1 (MQ=255) aaCGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCtt < 1:183195/150‑1 (MQ=255) aCGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCttt < 2:791475/150‑1 (MQ=255) aCAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTaa < 1:342564/150‑1 (MQ=255) aCAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTaa > 1:1066437/1‑150 (MQ=255) ggCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCt > 1:1587435/1‑150 (MQ=255) gATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGAc < 1:2223443/150‑1 (MQ=255) gTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACgcgc < 2:74823/150‑1 (MQ=255) gTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACgcgc < 1:2130807/150‑1 (MQ=255) tCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGcc > 1:1497775/1‑150 (MQ=255) aTTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCcac > 2:455084/1‑150 (MQ=255) aTTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCcac > 1:273123/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTCCCCTCACCAGATGAGAGTTGACATTCTATTTTATGACTATGCGTTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCcaca > 1:1685724/1‑150 (MQ=255) ccGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTg > 2:2023293/1‑150 (MQ=255) ccGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTg > 2:2121967/1‑150 (MQ=255) cGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGt > 1:2153659/1‑150 (MQ=255) cTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGGCa < 2:273123/150‑1 (MQ=255) gTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCtgt > 2:517703/1‑150 (MQ=255) gTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGGTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCtgt < 1:1679265/150‑1 (MQ=255) tttCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCtgtg > 1:416454/1‑150 (MQ=255) tCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCa > 1:1623540/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGACCGATTTGCCGACGAGCCGCACTACGCCTTTGGCAGACTGTAAGCCTGCACCCACCAACTTCGCGTTTACACCGCCCCGCAGGCCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAACGTGGTCTGACGCGCGACATTGGCACTCtgtctatg < 2:258219/150‑6 (MQ=255) cTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTc > 2:1812202/1‑102 (MQ=255) cTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATg < 1:517703/150‑1 (MQ=255) cTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGAAAGCGTGCTCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTc < 1:1812202/102‑1 (MQ=255) tGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGc < 1:2121967/150‑1 (MQ=255) aCCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCg < 1:595015/96‑1 (MQ=255) aCCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCg > 2:595015/1‑96 (MQ=255) ccGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCgctgct > 1:19309/1‑100 (MQ=255) ccGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCgctgct < 2:19309/100‑1 (MQ=255) cGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTc < 2:1066437/150‑1 (MQ=255) aGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGa < 2:1543091/150‑1 (MQ=255) aGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGa > 2:1500232/1‑150 (MQ=255) gTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAg > 2:109388/1‑150 (MQ=255) tagCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCATGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGc < 1:776749/148‑1 (MQ=255) aGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACATGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTc < 2:645874/150‑1 (MQ=255) ccTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACCCGTCGAGGCTGCCGGTTgg < 2:623729/150‑1 (MQ=255) ccTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCgg > 1:1883272/1‑150 (MQ=255) aCGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGa > 2:1225848/1‑133 (MQ=255) aCGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGa < 1:1225848/133‑1 (MQ=255) cGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCgaga < 1:1500232/150‑1 (MQ=255) gCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAAccc > 1:656989/1‑150 (MQ=255) gCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAAccc > 1:2131890/1‑150 (MQ=255) ccTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCt > 1:1760205/1‑150 (MQ=255) tttGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCcaca > 2:144031/1‑97 (MQ=255) tttGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCg > 1:2253940/1‑140 (MQ=255) tttGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCg < 2:2253940/140‑1 (MQ=255) tgtGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCcaca < 1:144031/95‑1 (MQ=255) gCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCt > 2:1470526/1‑150 (MQ=255) ccGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTgg < 1:264753/145‑1 (MQ=255) ccGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTgg > 2:264753/1‑145 (MQ=255) gACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGcc < 2:416454/150‑1 (MQ=255) cTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCtt < 2:2010009/150‑1 (MQ=255) ggaaGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGc < 2:532637/148‑1 (MQ=255) gCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCt > 2:2324241/1‑92 (MQ=255) gCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCt < 1:2324241/92‑1 (MQ=255) cGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAgg < 2:2153659/150‑1 (MQ=255) cGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAgg < 2:376580/150‑1 (MQ=255) cccccACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACAtt > 1:358434/1‑79 (MQ=255) cccccACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACAtt < 2:358434/79‑1 (MQ=255) cccACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGATGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGaa > 2:56561/1‑150 (MQ=255) caccaGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAAcc < 1:1470526/150‑1 (MQ=255) aGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTTGTTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAACCGGcc < 1:1009989/150‑1 (MQ=255) gCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAACCGGCCTTTTtc < 2:656989/150‑1 (MQ=255) ttGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCca < 1:1004326/58‑1 (MQ=255) ttGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCca > 2:1004326/1‑58 (MQ=255) ggcatcGACCTGCAGGTCGGTGGCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAACCGGCCttt < 2:906164/137‑1 (MQ=255) ggcatcGACCTGCAGGTCGGTGGCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAACCGGCCttt > 1:906164/6‑142 (MQ=255) ggcatcGACCTGCAGGTCGGTGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTggg > 2:313734/6‑112 (MQ=255) ggcatcGACCTGCAGGTCGGTGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTggg < 1:313734/107‑1 (MQ=255) ccACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAACCGGCCTTTTTCTCGAcc < 2:2131890/150‑1 (MQ=255) aCCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAACCGGCCTTTTTCTCGACCtt > 2:1442357/1‑150 (MQ=255) aCCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAACCGGCCTTTTTCTCGACCtt > 1:2047830/1‑150 (MQ=255) cGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAACCGGCCTTTTTCTCGACCTTGc < 2:1497775/150‑1 (MQ=255) gACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAACCGGCCTTTTTCTCGACCTTGcc < 2:1587435/150‑1 (MQ=255) ccTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAACCGGCCTTTTTCTCGACCTTGCCTc > 1:991149/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCtgt > 1:889575/1‑59 (MQ=255) gCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCtgt < 2:889575/59‑1 (MQ=255) gCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGt < 2:1124758/102‑1 (MQ=255) gCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGt > 1:1124758/1‑102 (MQ=255) cGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAACCGGCCTTTTTCTCGACCTTGCCTCCCAGCGGcc < 1:455084/150‑1 (MQ=255) | GTTGGACGCATCCAACGACAGGTCTCGGCGATAGTCATTGCCGCTTAGCGTTTCCTGGGTGACCGAGTTGGCGTCGAGCCTCACGTCGCCTTTGGCCGACTGTAAGCGTGCCCCCACCAGATGAGCGTTGCCACCGACCTGCAGGTCGATGCCGTCGCTGCTTTTAAGCGTGGTCTGACGCGCCACATTGTCACGCTGTGCATGCGACACGTCGAGGCTGACGGTCGGCGAGAACCCTGGGTCTGCCTTGCTCAGGGCCGAACCGGCCTTTTTCTCGACCTTGCCTCCCAGCGGCC > NC_002947/1652437‑1652732 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |