| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,681,711 | C→G | 6.1% | A63G (GCC→GGC) | recJ → | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,681,711 | 0 | C | G | 6.1% | 300.9 / 9.7 | 99 | A63G (GCC→GGC) | recJ | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/42); new base G (3/3); total (53/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.18e-01 | |||||||||||
TTTCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACG > NC_002947/1681563‑1681857 | tttCGGGGTACCCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGcc < 2:1171545/150‑1 (MQ=255) ttCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCa < 1:137267/150‑1 (MQ=255) tCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCAt < 1:2089054/150‑1 (MQ=255) cTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATc < 1:1120908/150‑1 (MQ=255) gggcaCCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAc > 2:1162425/5‑150 (MQ=255) ggTAACCCGCCCCCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGCGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAc < 1:1415868/150‑1 (MQ=255) gTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGAGAGGAGGCGCTGTACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAcc > 2:2069615/1‑150 (MQ=255) aCCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagc < 1:1284974/150‑1 (MQ=255) ccTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcg > 2:2202101/1‑150 (MQ=255) tGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgcc > 2:1524560/1‑150 (MQ=255) ccTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgcc > 1:826556/1‑144 (MQ=255) ccTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgcc < 2:826556/144‑1 (MQ=255) ttGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCAGGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCAGCGAAGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATc > 2:851498/1‑150 (MQ=255) ttGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATc > 1:1260458/1‑150 (MQ=255) gCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGNGTGCAGAGCGAGNCCGAGCNGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCt > 1:1872248/1‑150 (MQ=255) gACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGa > 2:2208517/1‑129 (MQ=255) gACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGa < 1:2208517/129‑1 (MQ=255) gACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAt < 2:1472072/150‑1 (MQ=255) ccGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCCGCTC‑AAGGGCATCACAGCCGGTGCGGGACCAGC‑GGCAGAATCCAGCGACCGTCGCCATCGCCTcccacccga > 2:23075/1‑143 (MQ=255) ccGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtcgt > 1:118291/1‑150 (MQ=255) ccGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtcgt > 1:2169564/1‑150 (MQ=255) gCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtcgtcc > 2:531355/1‑149 (MQ=255) gCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGACGCCCATG‑TGGCCCTCCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGTGCTTCCTCAgcgtcg < 2:615856/150‑1 (MQ=255) tctgcaCGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCgg > 1:536751/6‑150 (MQ=255) tctgcaCGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCgg > 1:1296206/6‑150 (MQ=255) ttACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGa < 1:2202101/150‑1 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcaggtc < 2:1700261/126‑6 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcaggtc > 1:1700261/1‑121 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCa < 1:867411/112‑1 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCa > 2:867411/1‑112 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTc > 2:1327983/1‑150 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCGC‑TAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTc > 1:1330512/1‑150 (MQ=255) cgcgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGa < 1:495322/150‑1 (MQ=255) gcgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt < 2:1260458/150‑1 (MQ=255) gcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTCGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGc > 1:2223607/1‑150 (MQ=255) gcggcgTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTc > 1:357633/1‑128 (MQ=255) gcggcgTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTc < 2:357633/128‑1 (MQ=255) tGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTCCCGTGCCTTCTGCTCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTg < 2:775928/150‑1 (MQ=255) gCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTTTTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGc < 1:23075/150‑1 (MQ=255) gagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCCGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcag < 2:955402/106‑3 (MQ=255) gagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCCGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcag > 1:955402/1‑104 (MQ=255) gCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGc > 2:1179660/1‑150 (MQ=255) cTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTc < 1:2283456/150‑1 (MQ=255) cTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTc < 2:473361/150‑1 (MQ=255) cTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATACCCTCGGTGCCACCGCCAGCACCGTc < 1:1484148/150‑1 (MQ=255) ggACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccag < 1:393028/88‑1 (MQ=255) ggACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccag > 2:393028/1‑88 (MQ=255) gACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGCCGCCTCCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCggg > 1:744332/1‑150 (MQ=255) aaGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGt < 1:569100/149‑1 (MQ=255) aaGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGt > 2:569100/1‑149 (MQ=255) aaGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTg > 1:134522/1‑150 (MQ=255) agagCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGc < 1:1524560/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCCGATCAAAGGGACTGGAGTTCCG‑G‑TGTATCTGCTGGTCGAAGCCCAAGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTgg < 1:1685485/150‑1 (MQ=255) ccTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTCCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTggg > 2:1092271/1‑150 (MQ=255) ccTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGCTGCATCGCTCTTGCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTTGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTggg < 1:1571890/150‑1 (MQ=255) tGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCa < 2:684381/129‑1 (MQ=255) tGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCa > 1:684381/1‑129 (MQ=255) ccTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcgcct < 2:1872248/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcct < 2:1016749/144‑1 (MQ=255) ccTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGCGCTGGgcct > 1:1016749/1‑144 (MQ=255) gctgcCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCctgct > 2:869966/1‑150 (MQ=255) gctgcCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAACACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCctgct < 2:2169564/150‑1 (MQ=255) ctgcCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCctgctg < 1:647492/150‑1 (MQ=255) cccTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGt < 1:1179660/150‑1 (MQ=255) ccTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTg > 1:1692161/1‑150 (MQ=255) tACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCg > 1:1183347/1‑150 (MQ=255) tACCAGCAGCCC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCg > 2:718649/1‑150 (MQ=255) aCCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCgg < 2:536751/150‑1 (MQ=255) cagcagCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCt > 2:973394/1‑125 (MQ=255) cagcagCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCt < 1:973394/125‑1 (MQ=255) tC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCg > 2:102817/1‑150 (MQ=255) tC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCg > 2:374032/1‑150 (MQ=255) gggCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTa > 1:934393/1‑150 (MQ=255) gggCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTa > 2:1000142/1‑150 (MQ=255) gCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTAcc > 2:1872263/1‑150 (MQ=255) cagcGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCt < 1:851498/147‑1 (MQ=255) aTCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTg > 1:1706190/1‑150 (MQ=255) aGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt < 1:2265811/71‑1 (MQ=255) aGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt > 2:2265811/1‑71 (MQ=255) cGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCaa > 1:1242663/1‑150 (MQ=255) ggTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAAc < 2:1183347/150‑1 (MQ=255) gACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTAAAGGCCGGCGGTGGCACGGCGGGCACCGTCGGGGTGCTGGGACTGCGCCTTCTGGGTGCTGGTCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTc < 1:531355/150‑1 (MQ=255) gACCTGCTGGTCGAAGACATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTc < 1:1872263/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCCACCTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGCGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGa < 2:118291/150‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCAcc > 2:1268165/1‑81 (MQ=255) ctgctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCAcc < 1:1268165/81‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAg > 1:2132060/1‑150 (MQ=255) ctgctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAg > 1:1412818/1‑150 (MQ=255) gctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTa > 2:1534442/1‑150 (MQ=255) gctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTa > 2:1457818/1‑150 (MQ=255) gctgGGCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTa > 1:98150/1‑150 (MQ=255) tCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATg < 1:1697472/147‑1 (MQ=255) tCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATg > 2:1697472/1‑147 (MQ=255) gAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCctgct < 2:217772/98‑1 (MQ=255) gAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCctgct > 1:217772/1‑98 (MQ=255) gAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTAcc < 2:2062299/121‑1 (MQ=255) gAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTAcc > 1:2062299/1‑121 (MQ=255) aaGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACg < 2:1412818/150‑1 (MQ=255) aGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGt < 2:1440821/55‑1 (MQ=255) aGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGt > 1:1440821/1‑55 (MQ=255) | TTTCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTG‑TGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACG > NC_002947/1681563‑1681857 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |