| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,681,713 | A→T | 7.0% | I64F (ATC→TTC) | recJ → | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,681,713 | 0 | A | T | 7.0% | 280.0 / 10.5 | 99 | I64F (ATC→TTC) | recJ | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/41); new base T (4/3); total (53/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.18e-01 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TTCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACGGCCT > NC_002947/1681564‑1681861 | ttCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCa < 1:137267/150‑1 (MQ=255) tCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCAt < 1:2089054/150‑1 (MQ=255) cTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATc < 1:1120908/150‑1 (MQ=255) gggcaCCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAc > 2:1162425/5‑150 (MQ=255) ggTAACCCGCCCCCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGCGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAc < 1:1415868/150‑1 (MQ=255) gTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGAGAGGAGGCGCTGTACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAcc > 2:2069615/1‑150 (MQ=255) aCCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagc < 1:1284974/150‑1 (MQ=255) ccTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcg > 2:2202101/1‑150 (MQ=255) tGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgcc > 2:1524560/1‑150 (MQ=255) ccTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgcc < 2:826556/144‑1 (MQ=255) ccTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgcc > 1:826556/1‑144 (MQ=255) ttGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCAGGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCAGCGAAGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATc > 2:851498/1‑150 (MQ=255) ttGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATc > 1:1260458/1‑150 (MQ=255) gCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGNGTGCAGAGCGAGNCCGAGCNGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCt > 1:1872248/1‑150 (MQ=255) gACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGa > 2:2208517/1‑129 (MQ=255) gACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAt < 2:1472072/150‑1 (MQ=255) ccGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtcgt > 1:2169564/1‑150 (MQ=255) ccGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtcgt > 1:118291/1‑150 (MQ=255) gCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtcgtcc > 2:531355/1‑149 (MQ=255) gCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGACGCCCATGTGGCCCTCCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGTGCTTCCTCAgcgtcg < 2:615856/150‑1 (MQ=255) tctgcaCGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCgg > 1:1296206/6‑150 (MQ=255) tctgcaCGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCgg > 1:536751/6‑150 (MQ=255) ttACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGa < 1:2202101/150‑1 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcaggtc > 1:1700261/1‑121 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcaggtc < 2:1700261/126‑6 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCa > 2:867411/1‑112 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCa < 1:867411/112‑1 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTc > 2:1327983/1‑150 (MQ=255) gccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCGC‑TAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTc > 1:1330512/1‑150 (MQ=255) cgcgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGa < 1:495322/150‑1 (MQ=255) gcgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt < 2:1260458/150‑1 (MQ=255) gcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTCGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGc > 1:2223607/1‑150 (MQ=255) gcggcgTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTc < 2:357633/128‑1 (MQ=255) gcggcgTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTc > 1:357633/1‑128 (MQ=255) tGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTCCCGTGCCTTCTGCTCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTg < 2:775928/150‑1 (MQ=255) gCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTTTTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGc < 1:23075/150‑1 (MQ=255) gagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCCGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcag < 2:955402/106‑3 (MQ=255) gagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCCGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcag > 1:955402/1‑104 (MQ=255) gCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGc > 2:1179660/1‑150 (MQ=255) cTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTc < 2:473361/150‑1 (MQ=255) cTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTc < 1:2283456/150‑1 (MQ=255) ggACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccag < 1:393028/88‑1 (MQ=255) ggACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGATGGCTTCGAccag > 2:393028/1‑88 (MQ=255) gACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGCCGCCTCCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCggg > 1:744332/1‑150 (MQ=255) aaGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGt < 1:569100/149‑1 (MQ=255) aaGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGt > 2:569100/1‑149 (MQ=255) aaGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTg > 1:134522/1‑150 (MQ=255) agagCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGc < 1:1524560/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCCGATCAAAGGGACTGGAGTTCCG‑GTGTATCTGCTGGTCGAAGCCCAAGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTgg < 1:1685485/150‑1 (MQ=255) ccTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTCCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTggg > 2:1092271/1‑150 (MQ=255) ccTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGCTGCATCGCTCTTGCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTTGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTggg < 1:1571890/150‑1 (MQ=255) tGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCa > 1:684381/1‑129 (MQ=255) tGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCa < 2:684381/129‑1 (MQ=255) ccTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcgcct < 2:1872248/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcct < 2:1016749/144‑1 (MQ=255) ccTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGCGCTGGgcct > 1:1016749/1‑144 (MQ=255) gctgcCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCctgct > 2:869966/1‑150 (MQ=255) 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tACCAGCAGCCC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCg > 2:718649/1‑150 (MQ=255) aCCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCgg < 2:536751/150‑1 (MQ=255) cagcagCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCt < 1:973394/125‑1 (MQ=255) tC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCg > 2:102817/1‑150 (MQ=255) tC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCg > 2:374032/1‑150 (MQ=255) gggCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTa > 2:1000142/1‑150 (MQ=255) gCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTAcc > 2:1872263/1‑150 (MQ=255) cagcGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCt < 1:851498/147‑1 (MQ=255) aTCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTg > 1:1706190/1‑150 (MQ=255) aGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt < 1:2265811/71‑1 (MQ=255) aGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt > 2:2265811/1‑71 (MQ=255) cGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCaa > 1:1242663/1‑150 (MQ=255) ggTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAAc < 2:1183347/150‑1 (MQ=255) gACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTAAAGGCCGGCGGTGGCACGGCGGGCACCGTCGGGGTGCTGGGACTGCGCCTTCTGGGTGCTGGTCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTc < 1:531355/150‑1 (MQ=255) gACCTGCTGGTCGAAGACATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTc < 1:1872263/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCCACCTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGCGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGa < 2:118291/150‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCAcc > 2:1268165/1‑81 (MQ=255) ctgctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCAcc < 1:1268165/81‑1 (MQ=255) ctgctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAg > 1:2132060/1‑150 (MQ=255) ctgctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAg > 1:1412818/1‑150 (MQ=255) gctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTa > 2:1534442/1‑150 (MQ=255) gctgGGCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTa > 1:98150/1‑150 (MQ=255) tCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATg > 2:1697472/1‑147 (MQ=255) tCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATg < 1:1697472/147‑1 (MQ=255) gAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCctgct > 1:217772/1‑98 (MQ=255) gAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCctgct < 2:217772/98‑1 (MQ=255) gAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTAcc < 2:2062299/121‑1 (MQ=255) gAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTAcc > 1:2062299/1‑121 (MQ=255) aaGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACg < 2:1412818/150‑1 (MQ=255) aGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGt > 1:1440821/1‑55 (MQ=255) aGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGt < 2:1440821/55‑1 (MQ=255) cATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcgcctg > 1:17575/1‑91 (MQ=255) cATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcgcctg < 2:17575/91‑1 (MQ=255) cATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACGGCCt < 2:1706190/150‑1 (MQ=255) aTCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcgc > 2:1112075/1‑87 (MQ=255) aTCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcgc < 1:1112075/87‑1 (MQ=255) aTCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGt < 2:218285/107‑1 (MQ=255) aTCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGt > 1:218285/1‑107 (MQ=255) | TTCTGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTC‑AAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACGGCCT > NC_002947/1681564‑1681861 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |