Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,933,717 | A→C | 7.3% | L27R (CTC→CGC) | minD ← | MinC‑MinD‑MinE system ATPase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,933,717 | 0 | A | C | 7.3% | 227.9 / 9.1 | 82 | L27R (CTC→CGC) | minD | MinC‑MinD‑MinE system ATPase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/39); new base C (3/3); total (40/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.56e-01 |
CTTGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAGCTAAATAAAGGCA > NC_002947/1933569‑1933865 | cTTGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGGGAg > 1:182862/1‑150 (MQ=255) cTTGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAg > 1:1348206/1‑150 (MQ=255) ttGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAgg > 1:70175/1‑150 (MQ=255) ttGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAgg > 2:617347/1‑150 (MQ=255) ttGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAgg > 1:1541804/1‑150 (MQ=255) ttGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAg < 2:1379529/149‑1 (MQ=255) ttGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAg > 1:1379529/1‑149 (MQ=255) tGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGc < 1:1519136/150‑1 (MQ=255) tCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCTCGCACTGCGCGGc > 1:2003925/1‑147 (MQ=255) tCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCTCGCACTGCGCGGc < 2:2003925/147‑1 (MQ=255) tCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGCGGCCTCGCACTGCGCGGccac < 2:880841/150‑3 (MQ=255) aGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTa < 1:948334/150‑1 (MQ=255) gggCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTAc > 2:1496042/1‑150 (MQ=255) ggCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTAcc > 1:769276/1‑150 (MQ=255) gTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATAAGCAC‑AGGTGTACGCAGGCCCACGTAGAAGTCGACAAGCCCGTTCCTGTGACCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATgg > 1:1684710/1‑150 (MQ=255) gTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAATTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAAt > 1:24571/1‑141 (MQ=255) gTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAAt < 2:24571/141‑1 (MQ=255) gTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTAGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCt > 2:676210/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGt > 1:194928/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGt > 2:864930/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGTTGACCACGTCGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGt > 2:278727/1‑150 (MQ=255) atCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGGCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGt > 1:446110/2‑150 (MQ=255) tCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTg < 1:1876882/150‑1 (MQ=255) ctttGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCt > 2:922177/3‑150 (MQ=255) cGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGa < 1:1019942/117‑1 (MQ=255) cGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGa > 2:1019942/1‑117 (MQ=255) cGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGt < 2:1558712/145‑1 (MQ=255) cGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGt > 1:1558712/1‑145 (MQ=255) cGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCt > 2:1372038/1‑150 (MQ=255) gACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTTCCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACAccccc < 2:1348206/150‑1 (MQ=255) gAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTgg > 1:2106751/1‑125 (MQ=255) gAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTgg < 2:2106751/125‑1 (MQ=255) gAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCtt > 1:110617/1‑150 (MQ=255) gAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCtt > 2:2075553/1‑150 (MQ=255) gAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCtt > 1:2018627/1‑150 (MQ=255) aaGTCGTACACTACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTg < 2:497269/150‑1 (MQ=255) tCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCg > 2:1818157/1‑150 (MQ=255) tACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGaa < 2:194928/150‑1 (MQ=255) tACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGaa < 1:1496042/150‑1 (MQ=255) acacCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAg < 1:1372038/150‑1 (MQ=255) gcggcgTTGGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TAAGCAGGTCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGTGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACTCCCCCCTTGCCTGAAGTAACCAc < 2:182862/150‑1 (MQ=255) gcggcgTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCTGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCAc < 2:70175/150‑1 (MQ=255) gCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCtt < 1:617347/150‑1 (MQ=255) gCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCtt < 2:372742/150‑1 (MQ=255) cAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTg < 1:1953085/150‑1 (MQ=255) cAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTg < 1:278727/150‑1 (MQ=255) tCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGc > 1:2263574/1‑142 (MQ=255) tCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGc < 2:2263574/142‑1 (MQ=255) tCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCAc < 1:1029906/150‑1 (MQ=255) tCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCAc < 1:676210/150‑1 (MQ=255) aGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCAcccc > 2:1988150/1‑150 (MQ=255) t‑tACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCAc < 2:65311/119‑1 (MQ=255) t‑tACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCAc > 1:65311/1‑119 (MQ=255) gCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAAt > 1:1960527/1‑150 (MQ=255) cAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATa < 2:110617/150‑1 (MQ=255) ggCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGt < 1:1761785/150‑1 (MQ=255) cccACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCg < 2:1495073/150‑1 (MQ=255) ccgcGTCGAAGTCGACGAGGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTCGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCgg < 2:446110/147‑1 (MQ=255) aCGTCGAAGTCGACAATGACGGGCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGa > 1:1221630/1‑150 (MQ=255) gTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGaca < 2:1541804/150‑1 (MQ=255) gTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGaca > 2:350030/1‑150 (MQ=255) tCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGacac > 1:1505996/1‑150 (MQ=255) gAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACtt < 1:922177/150‑1 (MQ=255) aGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGt < 1:864930/150‑1 (MQ=255) tCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCtt > 2:96390/1‑83 (MQ=255) tCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCtt < 1:96390/83‑1 (MQ=255) tCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTcc < 1:350030/150‑1 (MQ=255) gACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCt > 1:125151/1‑150 (MQ=255) cGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCAGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGTGACACTTGTCCCTGCaaaaaa < 2:2018627/150‑1 (MQ=255) ggTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAAc < 1:1818157/150‑1 (MQ=255) gTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACt < 1:924784/150‑1 (MQ=255) ttGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGaa < 2:1684710/150‑1 (MQ=255) ttGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGaa < 2:1505996/150‑1 (MQ=255) cggCCTCGCACTGCGCGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCtt < 1:1170753/88‑1 (MQ=255) cggCCTCGCACTGCGCGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCtt > 2:1170753/2‑89 (MQ=255) gcgcAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTcc < 1:2277389/127‑1 (MQ=255) gcgcAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTcc > 2:2277389/1‑127 (MQ=255) gcAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTgg > 1:761740/1‑84 (MQ=255) gcAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTgg < 2:761740/84‑1 (MQ=255) gcAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAGCtaaat > 2:761405/1‑150 (MQ=255) gcACTGCGCGGCCGGTACCAATGGCGGCGATGGTAGTGGTCTTGCCCACACTTCGCTTGCCGGAAGTAAAAAAGCGAAACATCGCAATTGTGGGATACACCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAAATGAAATAGCtaaat > 1:1113479/1‑150 (MQ=255) cGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTg < 1:1937385/122‑1 (MQ=255) cGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTg > 2:1937385/1‑122 (MQ=255) gAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAGCTAAATAAAGGCa > 2:1611537/1‑150 (MQ=255) | CTTGATCAGGGCCTGTTGCAGGTTGGCTTCGCCGTTGACCACGTTGACGAAGTCGTACACCACGCGGCGTTCGCAGCCCATGATCAGGTCGAGGT‑TACGCAGGCCCACGTCGAAGTCGACAATGACGGTCTTGTGGCCGCGCAGTGCGAGGCCGGTACCAATGGCGGCGCTGGTAGTGGTCTTGCCCACACCCCCCTTGCCGGAAGTAACCACGAGAATCTTGGCCAAGGTGTTTCACCCCTAAAAATAGTCGGGACACTTGTCCCTGCAAAAAACTGAAATAGCTAAATAAAGGCA > NC_002947/1933569‑1933865 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |