| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,381,445 | T→G | 8.6% | intergenic (+31/+56) | oprF → / ← cobA | porin F/uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,381,445 | 0 | T | G | 8.6% | 236.5 / 10.2 | 89 | intergenic (+31/+56) | oprF/cobA | porin F/uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/40); new base G (5/3); total (46/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGCCGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCAAACCAAACGCCCG > NC_002947/2381298‑2381593 | aGCCGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCg > 2:293150/1‑150 (MQ=255)aGCCGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCg > 2:629147/1‑150 (MQ=255)aGCCGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCATCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCg < 2:1964253/150‑1 (MQ=255)aGCCGTGTAGACCCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCg > 2:293094/1‑150 (MQ=255) gtTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCggg < 2:1549872/150‑1 (MQ=255) cTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGttttt > 1:1769528/1‑150 (MQ=255) tCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTc > 1:502196/1‑150 (MQ=255) ggTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTc > 2:414727/1‑148 (MQ=255) ggTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTc < 1:414727/148‑1 (MQ=255) ttGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTcatga < 1:1887543/150‑5 (MQ=255) gCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTACTTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCt < 1:293094/150‑1 (MQ=255) gCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAAAACTTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCt < 1:293150/150‑1 (MQ=255) tACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCggg > 2:1621691/1‑135 (MQ=255) tACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCggg < 1:1621691/135‑1 (MQ=255) tACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGCAATTGGTTTGACGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTgg > 2:140699/1‑150 (MQ=255) cGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGt < 1:1208602/150‑1 (MQ=255) gAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTa < 1:1488138/150‑1 (MQ=255) aaaccccGTCCGGTTGCTGACACCGCCACCGCAGACGGCCGTGCTGCCAACCATCGCGTAGAAGCTCAGGCAGAAGCCCACGCCAAATGCTTGGTTTGAAGCTGCATGAAAAGCTCGGCCTCGGCCGGCTTTTTCTTTGCCTGGGtttga < 2:1056032/146‑3 (MQ=255) aCCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAAcc > 2:1279360/1‑150 (MQ=255) cccGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCg < 1:2331185/150‑1 (MQ=255) ccGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCt < 2:1592272/150‑1 (MQ=255) ttGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCAAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAg < 2:1775070/150‑1 (MQ=255) aCAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGcc > 1:2151166/1‑138 (MQ=255) aCAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGcc < 2:2151166/138‑1 (MQ=255) ccACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCg < 2:388420/150‑1 (MQ=255) ccGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTACATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGGTTTTCTTTGCCTGCGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCACCTGCGGTc > 2:2304408/1‑150 (MQ=255) cGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCa < 1:1279360/150‑1 (MQ=255) gCNGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGNTCAGGTAGAAGCNCAGGCCNANTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCCGCCGGGTTTTTCTTTACCTGGCGTTGAACCGGCCCTGAAGGCCGCCCCTGCGGTCCGCCtgcgc > 1:1237427/1‑149 (MQ=255) gCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcga < 1:1598587/150‑1 (MQ=255) tGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcgattgc > 1:1380685/1‑150 (MQ=255) gTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGtt > 2:1853698/1‑102 (MQ=255) gTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGtt < 1:1853698/102‑1 (MQ=255) tCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcgatt > 1:332215/1‑143 (MQ=255) tCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcgatt < 2:332215/143‑1 (MQ=255) cgcgTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGc > 2:111608/1‑120 (MQ=255) cgcgTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGc < 1:111608/120‑1 (MQ=255) gTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcgatt > 2:311264/1‑132 (MQ=255) gTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcgatt < 1:311264/132‑1 (MQ=255) gTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGcc > 2:1768387/1‑150 (MQ=255) tGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCctg < 1:2259344/150‑1 (MQ=255) tcgggTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTc > 1:1638968/4‑150 (MQ=255) tCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGcc < 1:138207/92‑1 (MQ=255) tCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGcc > 2:138207/1‑92 (MQ=255) tCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTc < 2:1380685/150‑1 (MQ=255) aGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCt < 2:1595099/69‑1 (MQ=255) aGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCt > 1:1595099/1‑69 (MQ=255) gTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcgatt > 1:2062281/1‑120 (MQ=255) gTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcgatt < 2:2062281/120‑1 (MQ=255) gTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCGCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCa > 1:387720/1‑150 (MQ=255) tAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTCGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCaa < 1:854822/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAaccacc > 1:84758/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTc < 2:1769528/150‑1 (MQ=255) cAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTcc > 2:1846040/1‑150 (MQ=255) gCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgc < 2:878150/104‑1 (MQ=255) gCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgc > 1:878150/1‑104 (MQ=255) aGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCg < 2:1307639/90‑1 (MQ=255) aGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCg > 1:1307639/1‑90 (MQ=255) aGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTc < 2:1976439/142‑1 (MQ=255) aGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTc > 1:1976439/1‑142 (MQ=255) aTTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAg > 2:746573/1‑150 (MQ=255) gTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGAtt > 2:202042/1‑150 (MQ=255) aGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCggg < 1:629147/150‑1 (MQ=255) tCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTAc < 1:140699/150‑1 (MQ=255) cATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCa < 1:888353/75‑1 (MQ=255) cATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCa > 2:888353/1‑75 (MQ=255) aTGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGc < 1:1223723/145‑1 (MQ=255) aTGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGc > 2:1223723/1‑145 (MQ=255) aTGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGc > 1:1737865/1‑150 (MQ=255) gAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaa > 2:731249/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaa < 2:1737865/150‑1 (MQ=255) aaaaCCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaac < 2:1695906/150‑1 (MQ=255) aaaaCCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaac > 2:552389/1‑150 (MQ=255) aaaaCCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCctg < 2:890893/100‑1 (MQ=255) aaaaCCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCctg < 2:890951/100‑1 (MQ=255) aaaaCCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCctg > 1:890951/1‑100 (MQ=255) aaaaCCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTCTTTGCATGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCctg > 1:890893/1‑100 (MQ=39) aaaCCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaacc > 2:2077643/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaacc > 2:1782878/1‑150 (MQ=255) cccGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaaccaaa < 1:731249/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaaccaaac > 2:1576609/1‑150 (MQ=255) cGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCAAACCAAACg > 2:1129236/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGcc > 2:348288/1‑89 (MQ=255) ccTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGcc < 1:348288/89‑1 (MQ=255) ccTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCAAACCAAACGccc < 1:746573/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCTACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCAAACCAAACGCCcg > 2:2184223/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCGATGCGACGCAAACCAAACGcccc > 2:1704316/1‑149 (MQ=255) cTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCgg > 1:791142/1‑129 (MQ=255) cTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCgg < 2:791142/129‑1 (MQ=255) cTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCAAACCAAACGCCcg > 1:1880275/1‑150 (MQ=255) | AGCCGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCAAACCAAACGCCCG > NC_002947/2381298‑2381593 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |