| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,460,775 | G→C | 7.1% | H24Q (CAC→CAG) | PP_2153 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,460,775 | 0 | G | C | 7.1% | 272.9 / 9.6 | 85 | H24Q (CAC→CAG) | PP_2153 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/43); new base C (3/3); total (39/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 | |||||||||||
CCGCCTTCGGAAATGACCACCGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGAAGTGCGATCCGATCTTCGATGCGGTAGTATTCGC > NC_002947/2460626‑2460923 | ccgccTTCGGAAATGACCACCGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAgg > 1:1331249/1‑150 (MQ=255)ccgccTTCGGAAATGACCACCGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCCTGGCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAgg < 1:653807/150‑1 (MQ=255) cgccTTCGGAAATGACCACCGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGTGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCGTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGgt > 1:1215375/1‑150 (MQ=255) ccTTCGGAAATGACCACCGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGgtgt > 1:1995457/1‑150 (MQ=255) ttCGGAAATGACCACCGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCCGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTg < 1:413424/150‑1 (MQ=255) tCGGAAATGACCACCGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGc < 1:215569/150‑1 (MQ=255) gAAATGACCACCGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGAc < 2:1910609/150‑1 (MQ=255) gAAATGACCACCGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGAc < 2:1331249/150‑1 (MQ=255) aaaTGACCACCGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACt > 2:319399/1‑150 (MQ=255) aaTGACCACCGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTc < 2:1995457/150‑1 (MQ=255) gcccaccGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCACGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGaa < 1:494348/148‑1 (MQ=255) accaccGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAg < 2:360832/150‑1 (MQ=255) ccaccGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGt > 2:1196124/1‑150 (MQ=255) caccGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGTCGCAACACCTGTTGCgccag < 2:9661/144‑5 (MQ=255) caccGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGTCGCAACACCTGTTGCgccag > 1:9661/1‑140 (MQ=255) caccGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTc > 2:595473/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCgg > 2:1704907/1‑150 (MQ=255) cGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGc < 1:595473/150‑1 (MQ=255) cGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGc > 1:975589/1‑150 (MQ=255) gCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGt > 2:2208401/1‑150 (MQ=255) cGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTg > 2:1495919/1‑150 (MQ=255) ggCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGc > 1:1913077/1‑150 (MQ=255) gCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTc < 2:984220/150‑1 (MQ=255) gACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCCTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCt < 1:1920541/150‑1 (MQ=255) ttCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAg > 2:1158856/1‑150 (MQ=255) ttCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAg > 1:142166/1‑150 (MQ=255) tCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGACGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGc < 1:1313602/150‑1 (MQ=255) gCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAg > 1:2277668/1‑150 (MQ=255) gCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGATGAGCAg > 1:849281/1‑150 (MQ=255) gCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTCGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAg < 1:2273640/150‑1 (MQ=255) aaGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGtt < 1:2208401/150‑1 (MQ=255) cAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAgg < 1:2042455/103‑1 (MQ=255) cAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAgg > 2:2042455/1‑103 (MQ=255) aGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGt < 2:1485330/145‑1 (MQ=255) aGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGt > 1:1485330/1‑145 (MQ=255) aGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAAc < 1:1116632/150‑1 (MQ=255) ggTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAg < 2:142166/150‑1 (MQ=255) ccAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGa > 1:2299367/1‑130 (MQ=255) ccAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGa < 2:2299367/130‑1 (MQ=255) aaCCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGATCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAatc > 1:794938/1‑150 (MQ=255) accGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAg > 1:866470/1‑128 (MQ=255) accGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAg < 2:866470/128‑1 (MQ=255) gcgcTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGc < 1:1196124/150‑1 (MQ=255) gcgcTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGc < 2:1913077/150‑1 (MQ=255) gcgcTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGc < 1:1135359/150‑1 (MQ=255) gcgcTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGc < 1:319399/150‑1 (MQ=255) gcTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCaa < 1:1158856/150‑1 (MQ=255) gcTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCaa < 1:77420/150‑1 (MQ=255) tGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAaca > 1:2060643/1‑150 (MQ=255) gCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACAt < 1:20212/150‑1 (MQ=255) cAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATc < 1:1488931/150‑1 (MQ=255) cAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATc < 1:1495919/150‑1 (MQ=255) cAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGAAGATTGAACAGCTGCGAATCATCTTGCAACACATc > 2:20212/1‑150 (MQ=255) gcgcTTGTTATGTGCACGAAGGAAGGCGATGAGGGTGCTGTCCTTGTCGTTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAg < 2:21530/150‑1 (MQ=255) ttCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGc < 1:1143629/66‑1 (MQ=255) ttCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGc > 2:1143629/1‑66 (MQ=255) gtgCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGaa < 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tCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGtt > 2:1536499/1‑100 (MQ=255) tCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGtt < 1:1536499/100‑1 (MQ=255) ttAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGAAGTGCGATCCGATCTTCGa > 1:836471/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGAAGTGCGATCCGATCTTCGATGCg > 2:977648/1‑150 (MQ=255) agtcgcAACACCTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGAAGTGCGATCCGATCTTCGa < 1:1339364/142‑1 (MQ=255) agtcgcAACACCTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGAAGTGCGATCCGATCTTCGa > 2:1339364/4‑145 (MQ=255) gtcgcAACACCTGTTGCGACTCGAAGTCAGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGAAGTGc > 2:1965839/3‑130 (MQ=255) gtcgcAACACCTGTTGCGACTCGAAGTCAGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGAAGTGc < 1:1965839/128‑1 (MQ=255) gcgcAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGAAGTGCGATCCGATCTTCGATGCGgta < 1:1663893/150‑1 (MQ=255) gcAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGAAGTGCGATCCGATCTTCGATGCGgtagt > 1:569533/1‑150 (MQ=255) aaCAGGTGTTGCGACTCGAAGTTGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGAAGTGCGATCCGATCTTCGATGCGGTAGTAt > 1:1946147/1‑150 (MQ=255) aaCAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACGCATCTGGTTCaa > 1:1908862/1‑88 (MQ=255) aaCAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCaa < 2:1908862/88‑1 (MQ=255) aCAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGaa > 2:1855189/1‑120 (MQ=255) aCAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGaa < 1:1855189/120‑1 (MQ=255) cAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGAAGTGCGATCCGATCTTCGATGCGGTAGTATTc < 1:949334/150‑1 (MQ=255) agtgtTGCGATACAAAGTGTGCCAGGTGCAAATCGCTGAGCAGATTAAACAGCTGCGGATAATCTTGATACTCATCTGCTTCAAGGACAGCGCCTGCGTTAAGTGTGCTTATTTGAAGTGCGATCCGATCTTCGATGCGGTAGTATTcgc < 2:975589/149‑1 (MQ=255) gtgtTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGc < 1:1097343/67‑1 (MQ=255) gtgtTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGc > 2:1097343/1‑67 (MQ=255) | CCGCCTTCGGAAATGACCACCGGCAGCGGCTCGCCGACTTCGCCAAGCAGGGTTTGCCCAACCACCGCGCTGAGCAAGTCGAGGCGCTTGTTCTGTGCCCGCAGGAAGGCGGCGAGGGTGCGGTCCTTGTCGCTTAACTGGCGCAACAGGTGTTGCGACTCGAAGTCGGCCAGGTGCAGCTCGCTGAGCAGGTTGAACAGCGGCGAATCATCTTGCAACACATCTGGTTCAAGGGCTTCGGCCGCGCTAAGGGGGCTTATTTGAAGTGCGATCCGATCTTCGATGCGGTAGTATTCGC > NC_002947/2460626‑2460923 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |