Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,540,853 | G→C | 6.4% | intergenic (+23/+26) | PP_2232 → / ← PP_2233 | XRE family transcriptional regulator/isochorismatase family hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,540,853 | 0 | G | C | 6.4% | 294.8 / 9.3 | 94 | intergenic (+23/+26) | PP_2232/PP_2233 | XRE family transcriptional regulator/isochorismatase family hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (47/41); new base C (4/2); total (51/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.84e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ATCATCGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCAGG > NC_002947/2540705‑2540999 | atcatcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCCATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCtgt < 1:437307/150‑1 (MQ=255) tcatcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCtgtg < 2:2178337/150‑1 (MQ=255) catcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGc > 1:872984/1‑150 (MQ=255) atcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCa < 2:872984/150‑1 (MQ=255) tcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCtgtg > 2:1290982/1‑147 (MQ=255) tcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCtgtg < 1:1290982/147‑1 (MQ=255) tcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAg > 1:1886321/1‑150 (MQ=255) ggTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCACAGCAGCCCCaaa < 2:1539956/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTTCAGCCCCAAAg > 1:486309/1‑150 (MQ=255) gTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAg > 1:926759/1‑150 (MQ=255) gTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAg < 2:534449/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCACAAAg > 1:2217357/1‑150 (MQ=255) tCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCACACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAgg < 2:1404263/150‑1 (MQ=255) attgCTTGCATGTGAGGCATTTCCATGTGTTCCCTAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCaa < 2:1886321/147‑1 (MQ=255) aTCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCaa < 1:1521337/150‑1 (MQ=255) aTCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGACGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGGTTTGAGTCTGCAGACTGTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGCCTCaa > 2:1289832/1‑150 (MQ=255) tCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTGACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAg > 1:1890741/1‑150 (MQ=255) cGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGc < 2:926759/150‑1 (MQ=255) cGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTAGCACTTTGAGCCCGCAGGCTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGc < 1:1573192/150‑1 (MQ=255) gCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGcc > 1:117584/1‑150 (MQ=255) tGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGAt < 2:920143/150‑1 (MQ=255) aGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAg > 2:395088/1‑150 (MQ=255) gTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCt > 2:2137287/1‑150 (MQ=255) cAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTcag < 2:92940/150‑1 (MQ=255) aGTTCCATTTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCCACCGTAACGATGGGGTGGTGGCTGTTGGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGCCTTACGGGCTGTTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCGAGCCGATCAGCTTTTcagc < 2:329819/150‑1 (MQ=255) gTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTcagca < 1:2137287/150‑1 (MQ=255) gtgcTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGa > 2:1508704/1‑129 (MQ=255) gtgcTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGa < 1:1508704/129‑1 (MQ=255) ttCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGt > 1:102636/1‑150 (MQ=255) cccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGcccc < 1:2335649/107‑1 (MQ=255) cccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGcccc > 2:2335649/1‑107 (MQ=255) cccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGc < 1:1025305/104‑1 (MQ=255) cccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGc > 2:1025305/1‑104 (MQ=255) cccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑c > 2:906603/1‑148 (MQ=255) cccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑c < 1:906603/148‑1 (MQ=255) ccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCagcagc > 1:1036346/1‑138 (MQ=255) ccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCagcagc < 2:1036346/138‑1 (MQ=255) ccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTc > 1:1935534/1‑150 (MQ=255) ccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCCCAAGACGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTc > 1:123367/1‑150 (MQ=255) tAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTcacca < 1:359632/150‑1 (MQ=255) aCTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACcaca > 2:830201/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAg > 1:520998/1‑102 (MQ=255) tGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAg < 2:520998/102‑1 (MQ=255) gCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTc < 2:2316112/141‑1 (MQ=255) gCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTc > 1:2316112/1‑141 (MQ=255) gTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAg < 1:2175038/97‑1 (MQ=255) gTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAg > 2:2175038/1‑97 (MQ=255) gTATGCCTACCGTAACGATGACGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCAt > 2:533265/1‑150 (MQ=255) tGCCTATAGTAACGAGGGTGTGGTGGCTGTTTGGTTGGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGTCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCATCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTAGCATAgg < 1:181616/150‑1 (MQ=255) tGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAgg < 1:395088/150‑1 (MQ=255) ccTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCa < 2:1783975/150‑1 (MQ=255) ccGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGc < 1:160883/78‑1 (MQ=255) ccGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAaac > 1:2299463/1‑149 (MQ=255) ccGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAaac < 2:2299463/149‑1 (MQ=255) ccGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTCGGGCTGCTGTGc > 2:160883/1‑78 (MQ=255) gTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAaacgcc > 1:620249/1‑150 (MQ=255) tAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGGCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAaacgcca > 2:763245/1‑150 (MQ=255) aCGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAaacgccaac > 2:1893025/1‑150 (MQ=255) ggCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAAcgccgc < 2:102636/150‑1 (MQ=255) tGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCGAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCGGCTCGTTGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAAt > 1:1780696/1‑150 (MQ=255) tGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTca > 2:178537/1‑90 (MQ=255) tGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTca < 1:178537/90‑1 (MQ=255) gTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATc < 2:117584/150‑1 (MQ=255) ttCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAAtaa > 1:2077402/1‑148 (MQ=255) ttCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCa > 2:1497011/1‑150 (MQ=255) ggTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGc < 1:830201/150‑1 (MQ=255) gTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGca > 2:926758/1‑150 (MQ=255) cAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTT‑AACATTCAGCAGATGCTTCACCACATTGGCATAGGCACACACCACCGCACCCATCTCCGAATCATGCACATGAgccg > 1:405273/1‑150 (MQ=255) aaTGTGGCGATTTAAGCGTGCAGACTTTGGGTCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTTTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAgccgc < 2:123367/150‑1 (MQ=255) tgGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGa < 1:1070781/128‑1 (MQ=255) tgGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGa > 2:1070781/1‑128 (MQ=255) gCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCAc > 1:207523/1‑150 (MQ=255) gCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCAc < 2:1890741/150‑1 (MQ=255) gCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCAc > 2:2244008/1‑150 (MQ=255) tGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCtt < 1:2114240/150‑1 (MQ=255) aGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCGAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTTGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACAGGAGCCGCCGGCACCTGCTTGc < 2:1780696/150‑1 (MQ=255) gCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTcagc < 2:1154120/61‑1 (MQ=255) gCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTcagc > 1:1154120/1‑61 (MQ=255) gCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGcc > 1:466787/1‑150 (MQ=255) cTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTc < 2:1738299/74‑1 (MQ=255) cTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTc > 1:1738299/1‑74 (MQ=255) cTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGt > 1:76823/1‑150 (MQ=255) tGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTc > 1:1345531/1‑150 (MQ=255) gccgACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCg > 1:2329770/4‑147 (MQ=255) gCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCg < 2:2329770/147‑1 (MQ=255) cAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACCTTGGCATAGGCAAACGACCACGCAACAGTTGGCGAACCATAGACAGGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGa > 1:1684877/1‑150 (MQ=255) aGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGaa < 2:819915/150‑1 (MQ=255) tttGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTcagca > 1:797032/1‑52 (MQ=255) tttGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTcagca < 2:797032/52‑1 (MQ=255) tttGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCgg < 1:2115271/128‑1 (MQ=255) tttGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCgg > 2:2115271/1‑128 (MQ=255) tttGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGcc > 1:741908/1‑150 (MQ=255) tttGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGcc > 2:222861/1‑150 (MQ=255) tttGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGcc > 2:144825/1‑150 (MQ=255) ggggCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGt < 1:1257703/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCt > 1:472200/1‑128 (MQ=255) ggCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCt < 2:472200/128‑1 (MQ=255) ctgctgTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCGGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCa > 1:1593668/1‑150 (MQ=255) ctgctgTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCa < 1:926758/150‑1 (MQ=255) gctgTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCAgg < 2:405273/150‑1 (MQ=255) | ATCATCGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGT‑CTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCAGG > NC_002947/2540705‑2540999 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |