| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,560,505 | T→A | 9.6% | W142R (TGG→AGG) ‡ | PP_2243 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,560,505 | 0 | T | A | 9.6% | 282.2 / 18.5 | 94 | W142R (TGG→AGG) ‡ | PP_2243 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/42); new base A (5/4); total (48/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.65e-01 | |||||||||||
CGATTGCGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGC > NC_002947/2560357‑2560651 | cGATTGCGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCctg > 2:213716/1‑150 (MQ=255) tGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCtg < 2:1496649/150‑2 (MQ=255) gggCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTc < 1:1295967/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCt > 1:1123582/1‑147 (MQ=255) ggCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCt < 2:1123582/147‑1 (MQ=255) aaGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCgg < 2:1863511/150‑1 (MQ=255) aaGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCACGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTGCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCgg > 1:2231120/1‑150 (MQ=255) aGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCggg < 1:1427897/150‑1 (MQ=255) ggTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGt < 2:1280254/150‑1 (MQ=255) gCAACTACAAGCCGAGCACCCGCAGGCGCTGGCTGACTGGCTGCAGGATCCGACCGAAGCTGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGt < 1:1778886/150‑1 (MQ=255) gCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGt < 1:2245885/150‑1 (MQ=255) gCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCAGGTGACTGGCCGggggg > 2:2245885/1‑149 (MQ=255) gCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCAAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCtg > 2:1255910/1‑122 (MQ=255) gCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCAAGGCCGCCAGCCAGGCGGCCtg < 1:1255910/123‑2 (MQ=255) aaCTACAAGCCGAGCAATCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGa < 2:898030/150‑1 (MQ=255) aaCTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGt > 1:1225443/1‑148 (MQ=255) aaCTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGt < 2:1225443/148‑1 (MQ=255) aaCTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGa < 2:2173206/150‑1 (MQ=255) cTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCct > 1:1753450/1‑106 (MQ=255) cTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCct < 2:1753450/106‑1 (MQ=255) cAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGc > 1:1405004/1‑124 (MQ=255) cAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGc < 2:1405004/124‑1 (MQ=255) aaGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGacccacc < 1:213716/150‑1 (MQ=255) ccGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGa > 1:1459598/1‑150 (MQ=255) gAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATg < 1:899630/150‑1 (MQ=255) cAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACa < 1:1961515/112‑1 (MQ=255) cAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACa > 2:1961515/1‑112 (MQ=255) cAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTc < 2:1104103/150‑1 (MQ=255) cAACCGCAGACGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTc > 2:97180/1‑150 (MQ=255) cGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTggcg < 1:1927989/98‑1 (MQ=255) cGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTggcg > 2:1927989/1‑98 (MQ=255) cAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATgcgc > 2:800858/1‑150 (MQ=255) gCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGcc < 1:2122689/96‑1 (MQ=255) gCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGcc > 2:2122689/1‑96 (MQ=255) gCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTTACCCACCCGATg > 2:293632/1‑132 (MQ=255) gCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATg < 1:293632/132‑1 (MQ=255) gCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTg < 1:642079/150‑1 (MQ=255) aTGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCtt < 1:1009055/87‑1 (MQ=255) aTGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCtt > 2:1009055/1‑87 (MQ=255) aTGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGGTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACGCTATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACa > 2:1150417/1‑150 (MQ=255) gCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGt < 1:2205203/150‑1 (MQ=255) gCTGCAGGATCAGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGGGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGt > 2:727589/1‑150 (MQ=255) tGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGa > 1:2052843/1‑111 (MQ=255) tGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGa < 2:2052843/111‑1 (MQ=255) tGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGc > 2:1791091/1‑150 (MQ=255) tGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGc > 1:2099548/1‑150 (MQ=255) tGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGGGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGc > 2:357532/1‑150 (MQ=255) cAGGATCCGGCTAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCtt < 2:130169/150‑1 (MQ=255) cAGGATCCGGCGAGTGCCGTGCACGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCGATGCCAGCGCCCGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGGGGTGACCCACCCTATCGTCATTCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCtt < 2:203899/150‑1 (MQ=255) ggATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTgg < 1:800858/150‑1 (MQ=255) ggATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTgg < 1:97180/150‑1 (MQ=255) ggATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTgg > 1:1435068/1‑150 (MQ=255) gATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCggg < 2:2087129/89‑1 (MQ=255) gATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCggg > 1:2087129/1‑89 (MQ=255) aTCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCATCCGATGGTCATTCGCGTCTTTCTGTTACAGGTGCttttgt < 2:2231120/150‑5 (MQ=255) aTCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGgt > 1:1725446/1‑150 (MQ=255) gCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACa < 2:794343/134‑1 (MQ=255) gCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACa > 1:794343/1‑134 (MQ=255) tGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTCGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCg < 2:1435068/150‑1 (MQ=255) tggtggTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCa < 2:1725446/150‑1 (MQ=255) tggtggTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCa > 1:503563/1‑150 (MQ=255) tggtggTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCa > 2:1446010/1‑150 (MQ=255) gtggtgAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGc < 2:1459598/150‑1 (MQ=255) tgAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTg > 1:1026990/1‑122 (MQ=255) tgAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTg < 2:1026990/122‑1 (MQ=255) gAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACATGGGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATc > 2:119239/1‑150 (MQ=255) gAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTAta > 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cTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGAc < 1:2021658/143‑1 (MQ=255) cTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGAc > 2:2021658/1‑143 (MQ=255) cTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGtgctgc > 2:1643050/1‑150 (MQ=255) tGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGcc > 1:597126/1‑150 (MQ=255) tcTATCCCAGCGCCAGGCCGTCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCt < 2:454850/149‑1 (MQ=255) tATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGt < 1:1419992/150‑1 (MQ=255) aTGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGcc > 2:1324449/1‑121 (MQ=255) aTGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGcc < 1:1324449/121‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCAc > 1:1019246/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGTTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGTGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGt < 2:412852/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATc > 1:1803267/1‑129 (MQ=255) cAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATc < 2:1803267/129‑1 (MQ=255) cAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGt > 2:1685125/1‑150 (MQ=255) gaaGGCCGCCAGCCAGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGc < 1:1201876/78‑1 (MQ=38) gaaGGCCGCCAGCCAGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGc > 2:1201876/3‑80 (MQ=38) cAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCaa > 2:1487034/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCCAGCCAGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCTCTGTCACGTCTGCAAt > 2:1544148/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCCAGCCAGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGAAGCTGTCACGTCTGCAAt > 2:14245/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAAtt < 2:2099548/150‑1 (MQ=255) gccgccTGGCTGGCGGCCTTCGACATGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTg > 1:2021840/1‑150 (MQ=255) cgccTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGt < 2:32033/84‑1 (MQ=255) cgccTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGt > 1:32033/1‑84 (MQ=255) gccTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGc > 1:1028436/1‑150 (MQ=255) gccTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCAGGGCAGCGCATCGACTCGCGGCCTCTGGCACGGCTGCAATTgcca > 2:612894/1‑147 (MQ=255) | CGATTGCGACCTTGGGCGTTGGCAAGGTGTGTCGTTGAAGCAACTACAAGCCGAGCAACCGCAGGCGTTGGCCGAATGGCTGCAGGATCCGGCCAGTGCCGTGCATGGTGGTGAGTCGTTCGCTGCGCTATGCCAGCGCCAGGCCGCCTGGCTGGCGGCCTTCGACAGGCCGGGTGACTGGCTGGCGGTGACCCACCCGATGGTCATGCGCGCCATGCTGGTACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGC > NC_002947/2560357‑2560651 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |