Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,754,917 | G→A | 5.4% | A400A (GCG→GCA) | czcA‑II → | cation efflux system protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,754,917 | 0 | G | A | 5.4% | 219.5 / 2.5 | 75 | A400A (GCG→GCA) | czcA‑II | cation efflux system protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/35); new base A (2/2); total (38/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.57e-01 |
GATCCTGGTGATTGCCGTGCTGTTCCTGTTCCTCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCG > NC_002947/2754770‑2755066 | gATCCTGGTGATTGCCGTGCTGTTCCTGTTCCTCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGACCATGGTTAGCCCGCTTTTGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCt > 1:2278804/1‑150 (MQ=255) tGGTGATTGCCGTGCTGTTCCTGTTCCTCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACt > 1:123770/1‑150 (MQ=255) ggTGATTGCCGTGCTGTTCCTGTTCCTCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACtt > 1:894367/1‑150 (MQ=255) ccGTGCTGTTCCTGTTCCTCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCACTGGACTTCGGcatca > 2:1152002/1‑150 (MQ=255) ccGTGCTGTTCCTGTTCCTCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCACTGGACTTCGGcatca > 2:2319170/1‑150 (MQ=255) gttcctgttcctCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGAc > 1:447495/1‑133 (MQ=255) gttcctgttcctCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGAc < 2:447495/133‑1 (MQ=255) ttcctgttcctCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGAc > 1:1600338/1‑150 (MQ=255) ctgttcctCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGgc > 1:925888/1‑150 (MQ=255) ttcctCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGcgcg > 2:63422/1‑150 (MQ=255) ttcctCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGcgcg > 1:749189/1‑150 (MQ=255) ctCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCggtg < 2:1552537/150‑1 (MQ=255) tCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCggtgg < 1:307686/150‑1 (MQ=255) tCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACATGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATAATCGTCGACGGCGCggggg > 1:2082736/1‑150 (MQ=255) ggCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGgtggtg > 2:376529/1‑150 (MQ=255) ggCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGgtggtg > 1:1702927/1‑150 (MQ=255) gCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGa < 2:2180860/150‑1 (MQ=255) gCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGa < 1:860245/150‑1 (MQ=255) ttCCTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCATTCGATGCTATTCACCTTTCCCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCATGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTgg < 1:916539/150‑1 (MQ=255) gctgcGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTAACCTTTACCGGTAGGTTCAGCAACAAGCCACGTGCCAACCTGATGAGCCTTGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAAc < 1:1686313/150‑1 (MQ=39) gcgcTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGcc < 2:749189/150‑1 (MQ=255) gcTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCAt > 2:643396/1‑150 (MQ=255) gcTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATAGTGGAAAACGCCAt < 2:2319703/150‑1 (MQ=255) cTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATc > 2:287193/1‑150 (MQ=255) aTCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGt > 2:160886/1‑150 (MQ=255) aCGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGc > 1:2265789/1‑150 (MQ=255) cGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGcc < 2:560066/150‑1 (MQ=255) gCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTAACAAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTTGGCGCGCTGTACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTg > 2:2017442/1‑150 (MQ=38) ccATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGCTCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTgg < 1:63422/150‑1 (MQ=255) ggTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCa < 2:1337479/150‑1 (MQ=255) gTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCAt > 2:1658948/1‑150 (MQ=255) tATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGACACCCTGGACTTCGGCATCATAGTCGACGTCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGc > 1:1795275/1‑150 (MQ=255) tCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGGGGGCGCGGTGGTGATCGTGGCCAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGccc > 1:734023/1‑150 (MQ=255) cccGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCAGCCGTCGCCTGGCCCATGCCca < 1:643396/150‑1 (MQ=255) cGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCcagc > 2:782369/1‑150 (MQ=255) cGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCcagc > 2:632497/1‑150 (MQ=255) aTGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACCAGGTCAGTGTCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACg > 1:1133586/1‑115 (MQ=255) aTGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGTCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACg < 2:1133586/115‑1 (MQ=255) gCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACgg < 2:123770/150‑1 (MQ=255) tATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTc < 2:1821212/150‑1 (MQ=255) ttCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGc > 1:452520/1‑150 (MQ=255) cACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCAt > 1:1974579/1‑150 (MQ=255) aCCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATg > 2:1591744/1‑150 (MQ=255) cTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTg > 2:586661/1‑97 (MQ=255) cTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTg < 1:586661/97‑1 (MQ=255) cTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCGGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCt < 2:2042489/150‑1 (MQ=255) gTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATcc > 2:695483/1‑102 (MQ=255) gTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATcc < 1:695483/102‑1 (MQ=255) tATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCgcgg < 1:160886/150‑1 (MQ=255) aTGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCCGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAACCGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCgcggc < 1:969694/150‑1 (MQ=255) ttCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGt < 2:1901399/83‑1 (MQ=255) ttCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGt > 1:1901399/1‑83 (MQ=255) tCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGGCGGCGCGTGTGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAAc < 1:632497/150‑1 (MQ=255) tCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAAc < 2:1795275/150‑1 (MQ=255) aGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCg > 2:2253305/1‑49 (MQ=255) aGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCg < 1:2253305/49‑1 (MQ=255) aGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACgg < 1:782369/150‑1 (MQ=255) aGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACgg < 2:2265789/150‑1 (MQ=255) gCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCACTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGt < 1:1152002/150‑1 (MQ=255) gCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCACTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGt < 1:2319170/150‑1 (MQ=255) caacaaGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGtt < 2:2278804/150‑1 (MQ=255) aacaaGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTc > 2:209076/1‑150 (MQ=255) caaGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCa > 1:1025834/1‑150 (MQ=255) aaGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCAt < 1:209076/150‑1 (MQ=255) gTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAg < 2:1702927/150‑1 (MQ=255) cAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGgt < 1:1524389/150‑1 (MQ=255) gCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGttt < 2:1600338/150‑1 (MQ=255) gCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACAAGCGGCGACCGGTTCCGTGAGGAGttt > 2:132293/1‑150 (MQ=39) ccAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTg > 2:789356/1‑150 (MQ=255) cAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGc < 2:894367/150‑1 (MQ=255) aCCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCg < 1:789356/150‑1 (MQ=255) ccTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGc > 1:1347743/1‑150 (MQ=255) atgaGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGcc > 2:125488/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGa > 1:1179991/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGaa < 2:1347743/150‑1 (MQ=255) gcTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGAAGCGGCGTTAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGAACgccg < 1:1591744/150‑1 (MQ=39) | GATCCTGGTGATTGCCGTGCTGTTCCTGTTCCTCGGCAACATTCGTGCTGCGCTGATCACGGCCATGGTTATCCCGCTTTCGATGCTATTCACCTTTACCGGTATGTTCAGCAACAAGGTCAGTGCCAACCTGATGAGCCTGGGCGCGCTGGACTTCGGCATCATCGTCGACGGCGCGGTGGTGATCGTGGAAAACGCCATCCGTCGCCTGGCCCATGCCCAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCG > NC_002947/2754770‑2755066 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |