| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,766,399 | G→A | 6.5% | A20A (GCC→GCT) | PP_2419 ← | membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,766,399 | 0 | G | A | 6.5% | 224.0 / 4.8 | 77 | A20A (GCC→GCT) | PP_2419 | membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/35); new base A (2/3); total (39/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.35e-01 | |||||||||||
ACAGGCGCACACAGGTGGGCGAGGGTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATAGAGGTTTTTGTGTGGAC > NC_002947/2766250‑2766541 | acaGGCGCACACAGGTGGGCGAGGGTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAgg < 1:1079517/150‑1 (MQ=255)acaGGCGCACACAGGTGGGCGAGGGTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAgg < 1:77094/150‑1 (MQ=255)acaGGCGCACACAGGTGGGCGAGGGTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAgg < 1:2052649/150‑1 (MQ=255)acaGGCGCACACAGGTGGGCGAGGGTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAgg < 1:1079819/150‑1 (MQ=255) aGGCGCACACAGGTGGGCGAGGGTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGc > 1:1826902/1‑150 (MQ=255) cgcACACAGGTGGGCGAGGGTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATTACCAGGCCGCGCAGGGCATc < 2:42997/150‑1 (MQ=255) acacaGGTGGGCGAGGGTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGAt > 1:1238754/1‑150 (MQ=255) cacaGGTGGGCGAGGGTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATg < 1:351413/150‑1 (MQ=255) acaGGTGGGCGAGGGTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCGTGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGc > 2:1513129/1‑150 (MQ=255) aGGTGGGCGAGGGTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGctc > 2:181238/1‑150 (MQ=255) gTGGGCGAGGGTGCGACTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCGGGGCATCGATGCTCTg > 1:335664/1‑150 (MQ=255) ggCGAGGGTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCAATGGGGTGAATCACTGATCGCGGCATAAGGAAAGTCTCTCGGGCATGGTACCGGACCATGATCCGTTATTCCAGTCCGCGCAGAGCATCGATGCCCTGcgc < 1:531725/150‑3 (MQ=255) gTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGTCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTgg < 2:775182/150‑1 (MQ=255) ggCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGa > 1:1485945/1‑150 (MQ=255) gCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGAt > 2:1491623/1‑150 (MQ=255) aagaaAAGCGCCGGTTCCCTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCaga < 1:709742/150‑1 (MQ=255) agaaAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCagag > 2:1689148/1‑150 (MQ=255) gaaAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGt < 1:1689148/150‑1 (MQ=255) aaaGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTgg < 2:1826902/150‑1 (MQ=255) gcCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGCTCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTg < 1:1918879/150‑1 (MQ=255) cGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGt < 2:2125302/132‑1 (MQ=255) cGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGt > 1:2125302/1‑132 (MQ=255) gTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGACATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTaa > 2:1921788/1‑150 (MQ=255) gtgtCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCGAGGTGGAGGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCtt < 2:662593/150‑1 (MQ=255) gtgtCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGACCAGTAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCtt < 1:1794500/150‑1 (MQ=255) gtCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGt > 1:798868/1‑150 (MQ=255) tGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATgg < 2:284244/150‑1 (MQ=255) ggacATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGAGCATCGATGCCCTGcg > 2:35295/4‑103 (MQ=255) ggacATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGAGCATCGATGCCCTGcg < 1:35295/101‑2 (MQ=255) ccATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGtt < 1:1553209/150‑1 (MQ=255) cATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGGCATGGGTTg > 1:659489/1‑150 (MQ=255) gACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGgaat < 1:181238/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGt > 1:1324310/1‑110 (MQ=255) tGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGt < 2:1324310/110‑1 (MQ=255) tGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGgaat < 2:1189556/146‑1 (MQ=255) tGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGgaat > 1:1189556/1‑146 (MQ=255) ggTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCGTGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGAAGCCAGCCTCGTCGTGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCa > 2:1355277/1‑150 (MQ=255) ggTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCa > 2:1312338/1‑150 (MQ=255) ggTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCa < 2:1238754/150‑1 (MQ=255) gTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTGGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCAt < 2:1485945/150‑1 (MQ=255) tGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCAtg < 1:1513129/150‑1 (MQ=255) aggaggAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTg < 1:1819310/102‑1 (MQ=255) aggaggAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTg > 2:1819310/1‑102 (MQ=255) aggaggAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGa > 2:465417/1‑150 (MQ=255) aaGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCATGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTa < 1:1148628/150‑1 (MQ=255) tctcGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCg > 1:1448728/1‑150 (MQ=255) tcGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATgg < 1:478111/109‑1 (MQ=255) tcGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATgg > 2:478111/1‑109 (MQ=255) ggCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACa < 2:798868/150‑1 (MQ=255) ggTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGgcg > 2:1223165/1‑150 (MQ=255) ggAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGaaa < 2:1837831/150‑1 (MQ=255) gCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAAt > 2:1040850/1‑76 (MQ=255) gCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAAt < 1:1040850/76‑1 (MQ=255) cATGAACAGGATCACCAGGGCGCGCAGGGCATCGAGGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGa < 2:335664/150‑1 (MQ=255) aTGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCAtg > 2:2326974/1‑114 (MQ=255) aTGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCAtg < 1:2326974/114‑1 (MQ=255) aaCAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATag > 2:948435/1‑150 (MQ=255) aCAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATaga > 1:827154/1‑150 (MQ=255) aCAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATaga > 2:269113/1‑150 (MQ=255) cAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTTATCAGAGTgg < 1:1929571/59‑1 (MQ=255) cAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTTATCAGAGTgg > 2:1929571/1‑59 (MQ=255) cAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATaa > 2:1482117/1‑127 (MQ=255) cAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATaa < 1:1482117/127‑1 (MQ=255) aGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATAGAgg > 1:5387/1‑150 (MQ=255) gATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATgg > 1:1967508/1‑80 (MQ=255) gATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATgg < 2:1967508/80‑1 (MQ=255) gATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCATGAGAATGGCGCCTTCCTTAAGTTGTCGAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATAGAGGtt > 1:1451620/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATAGAGGTTTTtgt > 1:2214750/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAgg > 1:774043/1‑133 (MQ=255) cAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAgg < 2:774043/133‑1 (MQ=255) cAGACCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGAGAATAGAGGTTTTcgtg > 2:215781/1‑150 (MQ=255) ggCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATAGAGGTTTTtgtgtg > 1:2314222/1‑150 (MQ=255) ggCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATAGAGGTTTTtgtgtg < 1:465417/150‑1 (MQ=255) gCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATAGAGGTTTTTGTGTgg > 1:1338712/1‑150 (MQ=255) ccGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATAGAGGTTTTTGTGTGGa < 2:1338712/150‑1 (MQ=255) ccGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTAATGGTGTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATAGAGGTTTTTGTGTGGa < 1:1312338/150‑1 (MQ=255) cgcgCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCCTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATAGAGGTTTTTGTGTGGAc < 1:2278248/150‑1 (MQ=255) cctgcAGAGCATCGATGCCCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGtat > 1:1448466/4‑111 (MQ=255) cctgcAGAGCATCGATGCCCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGtat < 2:1448466/108‑1 (MQ=255) gcAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATAGAGGTTTTtgtgt < 2:316028/143‑1 (MQ=255) gcAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATAGAGGTTTTtgtgt > 1:316028/1‑143 (MQ=255) | ACAGGCGCACACAGGTGGGCGAGGGTGCGGCTGAAGAAAAGCGCCGGTTCCGTGGTGTCGATGGCCATGGGGTCGCTGACCTGGCGGTGCAGGAGGAAAGTCTCGCGGGCATGGTCCAGGAGCATGAACAGGATCACCAGGCCGCGCAGGGCATCGATGCTCTGCAGGCGCTGGGTGATCAGAGTGGGCGTGGTAATGGCGCTTGTCATGGGTTGTCTAATAGGAATGAATTTCATGTGAAACGTTATCGTATAACAAGGCGCTGAAAGGGAATAGAGGTTTTTGTGTGGAC > NC_002947/2766250‑2766541 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |