Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,880,362 | T→C | 9.8% | L54P (CTG→CCG) | PP_2535 → | transport protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,880,362 | 0 | T | C | 9.8% | 239.0 / 9.1 | 86 | L54P (CTG→CCG) | PP_2535 | transport protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (44/33); new base C (5/4); total (49/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CACCGCTTGTCGCACTCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTT > NC_002947/2880215‑2880511 | cACCGCTTGGCGCACTCGCCATCGGTGACTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTCCCCCCATAGGCATGCAGACTAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTACATTCCTGATGCGGGGCGGCGGTGGAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCCGa > 2:707469/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTGTCGCACTCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGTCTATGCCATCGGCGTGCTGAt > 2:1673257/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTGTCGCACTCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGAt > 2:1467918/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTGTCGCACTCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGCGCCGAt > 2:1806789/1‑150 (MQ=255) tGTCGCACTCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGgcgc < 2:2031779/150‑1 (MQ=255) tCGCACTCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGCGCCGATcagcacgc > 2:1859996/1‑143 (MQ=255) gCACTCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCAGCGGCGCGCCGATCAGCAcgccg > 1:2337476/1‑150 (MQ=255) cACTCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGcgccgc < 1:2284122/150‑1 (MQ=255) aCTCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCt > 2:1207267/1‑150 (MQ=255) aCTCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGCGCCGATCAGCAcgccgat < 1:1859996/150‑3 (MQ=255) cTCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCtg > 2:119642/1‑150 (MQ=255) tCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCtga > 2:363318/1‑150 (MQ=255) tCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGCGCCGATCAGCACGCCGAtgg < 1:1806789/150‑2 (MQ=255) cGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCtgat < 2:2033565/150‑1 (MQ=255) ccATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCtgatga > 1:278226/1‑150 (MQ=255) cATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGTCATGTTGCCAAGTATCGCTACCGACCTCGTTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGCGCCGATCAGCACGCCGAtggcata < 2:115715/150‑6 (MQ=255) cATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGAc > 1:54664/1‑150 (MQ=255) ttCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCAGCGGCGCGCCGATCAGCAcgccgatg > 2:1820831/1‑132 (MQ=255) ttCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCAGCGGCGCGCCGATCAGCACGCCGAtg < 1:1820831/135‑1 (MQ=255) cATGGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGCAAGTGGCTATGCCATTGGCGTGCTTATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGaa < 1:287682/150‑1 (MQ=255) tCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGTTGATCGGCGCGCCGCGGAGGACCCTGGCCACGGTGAAGa > 1:1683165/1‑150 (MQ=255) tCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGa > 1:27023/1‑150 (MQ=255) gagTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGt > 1:922827/1‑150 (MQ=255) tttGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTAc > 1:433773/1‑150 (MQ=255) tttGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGGGAAGATCCCGCGCCGTTAc > 2:505908/1‑150 (MQ=255) ttGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTAcc < 2:1371595/150‑1 (MQ=255) tGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCt < 1:1478231/150‑1 (MQ=255) tGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCt < 2:922827/150‑1 (MQ=255) ccccATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGtt < 2:433773/150‑1 (MQ=255) cccATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTg > 2:78325/1‑150 (MQ=255) ccATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGa > 1:1533375/1‑150 (MQ=255) ccATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGa > 2:989151/1‑150 (MQ=255) gCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGc < 2:54664/150‑1 (MQ=255) caacatGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGa > 1:1078041/6‑122 (MQ=255) caacatGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGa < 2:1078041/117‑1 (MQ=255) tGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATgg < 1:363318/150‑1 (MQ=255) gCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGc > 1:1269048/1‑150 (MQ=255) ccAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCgg < 2:194804/139‑1 (MQ=255) ccAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCgg > 1:194804/1‑139 (MQ=255) aCCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGGTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTg > 1:1777142/1‑150 (MQ=255) ccGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGTCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTgg < 1:1673257/150‑1 (MQ=255) ccGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTgg < 2:2002215/150‑1 (MQ=255) ccGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCATATGCGATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTgg < 1:1895166/150‑1 (MQ=255) cGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTggg < 2:1533375/150‑1 (MQ=255) ccTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCaa < 2:27023/150‑1 (MQ=255) tCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAAcc < 1:1207267/150‑1 (MQ=255) tCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAAc < 2:605222/149‑1 (MQ=255) tCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGCGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAAc > 1:605222/1‑149 (MQ=255) tCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGaa > 2:1848271/1‑86 (MQ=255) tCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGaa < 1:1848271/86‑1 (MQ=255) tCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCg < 2:1446175/150‑1 (MQ=255) ccATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGa < 2:1845128/117‑1 (MQ=255) ccATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGa > 1:1845128/1‑117 (MQ=255) cATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGc < 1:1467918/150‑1 (MQ=255) aTTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGaa < 2:1252208/83‑1 (MQ=255) aTTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGaa > 1:1252208/1‑83 (MQ=255) aTTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGcc > 2:1759423/1‑150 (MQ=255) aTTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGcc > 1:245630/1‑150 (MQ=255) aTTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGcc > 1:1472369/1‑150 (MQ=255) aTTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGcc > 2:463118/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTg < 1:1334981/131‑1 (MQ=255) ttCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTg > 2:1334981/1‑131 (MQ=255) ccTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTg > 1:2053907/1‑150 (MQ=255) ctgctgCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTgg > 1:895866/1‑150 (MQ=255) tgctgcGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTgg > 2:285944/1‑128 (MQ=255) tgctgcGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTgg < 1:285944/128‑1 (MQ=255) tgctgcGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGATGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTCTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGc > 1:2229266/1‑150 (MQ=255) ctgcGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCa < 1:463118/150‑1 (MQ=255) ctgctgGTCAGTGCTTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTAc < 1:707469/150‑1 (MQ=255) tgctgGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACg > 1:1132179/1‑150 (MQ=255) tgGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCa > 2:1861576/1‑150 (MQ=255) cTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGc > 1:1711305/1‑83 (MQ=255) cTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGc < 2:1711305/83‑1 (MQ=255) 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cTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGtcact > 2:1004243/1‑150 (MQ=255) tGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGGCTACGCCAGc > 2:1518886/1‑125 (MQ=255) tGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGGCTACGCCAGc < 1:1518886/125‑1 (MQ=255) tGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGtccctt > 2:2220012/1‑150 (MQ=255) | CACCGCTTGTCGCACTCGCCATCGGTGCCTTCGGCATCGGCGTTACAGAGTTTGCCCCCATGGGCATGTTGCCCAGTATCGCTACCGACCTCGGTGTTTCCATTCCTGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTT > NC_002947/2880215‑2880511 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |