| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,047,779 | G→T | 5.3% | L163L (CTG→CTT) | PP_2660 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,047,779 | 0 | G | T | 5.3% | 245.7 / 2.6 | 76 | L163L (CTG→CTT) | PP_2660 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/35); new base T (2/2); total (39/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.88e-01 | |||||||||||
ACTGGTACTGCGCGTACCGCAGCGATTCCATCTGGAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGTACGCCGCTTTCCTGGAAGCGAAAGCACC > NC_002947/3047631‑3047928 | aCTGGTACTGCGCGTACCGCAGCGATTCCATCTGGAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTgc < 1:2121490/150‑1 (MQ=255)aCTGGTACTGCGCGTACCGCAGCGATTCCATCTGGAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTgc < 1:2210123/150‑1 (MQ=255) gTACTGCGCGTACCGCAGCGATTCCATCTGGAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTgccgcc > 2:2336932/1‑150 (MQ=255) tACTGCGCGTACCGCAGCGATTCCATCTGGAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGTCa < 1:2330159/150‑1 (MQ=255) gCAGCGATTCCATCTGGAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGc > 2:1921904/1‑150 (MQ=255) cAGCGATTCCATCTGGAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCt < 2:1223616/150‑1 (MQ=255) cAGCGATTCCATCTGGAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCt < 2:1234129/150‑1 (MQ=255) aGCGATTCCATCTGGAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTg < 1:597349/150‑1 (MQ=255) aGCGATTCCATCTGGAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTg < 2:1713294/150‑1 (MQ=255) gCGATTCCATCTGGAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCACCACCGGCGCGAGTTCGGATGTGGTCAGGTATGTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTgg > 1:275851/1‑150 (MQ=255) ttCCATCTGGAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACaa > 1:478469/1‑150 (MQ=255) ggAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGt < 1:745087/132‑1 (MQ=255) ggAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGt > 2:745087/1‑132 (MQ=255) aaGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGt < 2:478469/150‑1 (MQ=255) gCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTa < 2:381510/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAAc < 1:2336932/150‑1 (MQ=255) gtgtgtATGTACGGATCCTCGGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGt > 2:370647/1‑150 (MQ=255) gtgtgtATGTACGGATCCTCGGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGt < 1:370647/150‑1 (MQ=255) gtgtgtATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGt > 2:1371842/1‑150 (MQ=255) atgtaCGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGa < 2:1241085/118‑1 (MQ=255) atgtaCGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGa > 1:1241085/1‑118 (MQ=255) gtaCGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAAc < 1:1261794/138‑1 (MQ=255) gtaCGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAAc > 2:1261794/1‑138 (MQ=255) taCGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTc > 1:2017839/1‑101 (MQ=255) taCGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTc < 2:2017839/101‑1 (MQ=255) cGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATa > 2:934570/1‑150 (MQ=255) tCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACt > 2:1425459/1‑150 (MQ=255) tCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACt > 1:931228/1‑150 (MQ=255) tCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACt > 1:1529576/1‑150 (MQ=255) gCAATCGGCCGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCg > 2:2329409/1‑150 (MQ=255) cGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAAc < 1:1962058/119‑1 (MQ=255) cGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAAc > 2:1962058/1‑119 (MQ=255) cTGTTCCTCGAAGGCAACAACCGCACGTCTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGgt < 2:931228/150‑1 (MQ=255) tCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCt < 2:2221830/76‑1 (MQ=255) tCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCt > 1:2221830/1‑76 (MQ=255) tCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAgg > 1:685604/1‑150 (MQ=255) ggCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTg < 2:2278002/150‑1 (MQ=255) gCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTTCCGCCAt < 2:2315944/63‑1 (MQ=255) gCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTTCCGCCAt < 2:2316089/63‑1 (MQ=255) gCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTTCCGCCAt > 1:2316089/1‑63 (MQ=255) gCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTTCCGCCAt > 1:2315944/1‑63 (MQ=255) gCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCt > 1:1940566/1‑76 (MQ=255) gCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCt < 2:1940566/76‑1 (MQ=255) aacaacCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGgt < 1:1910949/135‑1 (MQ=255) aacaacCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGgt > 2:1910949/1‑135 (MQ=255) cACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTccc < 1:1921904/150‑1 (MQ=255) ggTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCt > 2:34715/1‑94 (MQ=255) ggTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCt < 1:34715/94‑1 (MQ=255) gTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGa > 2:1058589/1‑150 (MQ=255) cGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCa < 1:2329409/150‑1 (MQ=255) gCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGCTCaa < 2:2034181/150‑1 (MQ=255) tATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGaa > 1:1989111/1‑150 (MQ=255) tCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTc < 1:2076577/131‑1 (MQ=255) tCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTc > 2:2076577/1‑131 (MQ=255) tCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGt > 1:1426990/1‑150 (MQ=255) tCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGt > 1:1527028/1‑150 (MQ=255) tCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGt < 2:1989111/150‑1 (MQ=255) tCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGt > 1:2191096/1‑150 (MQ=255) tCAGCTATTTGCTGATGCGTACCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGt > 1:1426471/1‑150 (MQ=255) gCTATTTGGTGATGCGTGGCGGGCTGGCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGCTACTAGAACACGTCCTCGGTCATCAGCCACTACGCCAAAACCGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCACCAAGATCAAGAAAAAGTTcg > 2:487424/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) cTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCg > 2:672398/1‑72 (MQ=255) tGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGTACGCCGCTTTcc > 1:1827399/1‑150 (MQ=255) aTGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACt > 2:912205/1‑55 (MQ=255) aTGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACt < 1:912205/55‑1 (MQ=255) tGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGTACGCCGCTTTCCTGGAAGc > 2:995166/1‑150 (MQ=255) tGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGTACGCCGCTTTCCTGGAAGc < 1:934570/150‑1 (MQ=255) gggCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGTACGCCGCTTTCCTGGAAGCGaaa < 2:1426990/150‑1 (MQ=255) gggCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGTACGCCGCTTTCCTGGAAGCGaaa < 2:1426471/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGTACGCCGCTTTCCTGGaa < 1:1640984/140‑1 (MQ=255) tGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGTACGCCGCTTTCCTGGaa > 2:1640984/1‑140 (MQ=255) tGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGTACGCCGCTTTCCTGGAAGCGAAAGCAc > 2:1540925/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGTACGCCGCTTTCCTGGAAGCGAAAGCAc < 2:1529576/150‑1 (MQ=255) gccgccATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGTACGCCGCTTTCCTGGAAGCGAAAGCAcc < 1:1371842/150‑1 (MQ=255) | ACTGGTACTGCGCGTACCGCAGCGATTCCATCTGGAAGCGGGCAGCGGGTGTGTATGTACGGATCCTCAGCAAGCCGCAGCTGTTCATCGAAGGCAACAACCGCACGGGTTCGCTTATTGTCAGCTATTTGCTGATGCGTGCCGGGCTGCCGCCATTCGTGCTGTCGCTGGACAACGCCGAGGGTTACTTCAACCCGTCCTCGGTCATACGCAACTCCGCCAAACACGGTGTCAAGGCTTTGTACGAACTCCCCAAGATCAAGAAAAAGTACGCCGCTTTCCTGGAAGCGAAAGCACC > NC_002947/3047631‑3047928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |